Virus de la grippe - M. SEGONDY - CHU Montpellier lli

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Virus de la grippe - M. SEGONDY - CHU Montpellier lli
Virus de la grippe

M. SEGONDY – CHU Montpellier
                       lli
Virus de la grippe - M. SEGONDY - CHU Montpellier lli
Virus de la grippe: 3D

M. SEGONDY
Structure des virus grippaux

M. SEGONDY
Virus de la grippe
             Génome segmenté (8 segments)
               1     PB2
               2     PB1         Réplicase, transcriptase
               3     PA
               4     HA          Hémagglutinine
               5     NP          Nucléoprotéine (capside)
               6     NA          Neuraminidase
               7     M1--M2
                     M1          Matrice
               8     NS1--NS2 Prot.
                     NS1         Prot non structurales
M. SEGONDY
Virus de la grippe: neuraminidase

M. SEGONDY
Multiplicité des virus grippaux :
    les types et les sous-types
                    Type B                          Type C

                                    Type A

             H1N1            H2N2            H3N2        H5N1

M. SEGONDY
Variabilité des virus grippaux
                                   g pp
              Grippe A: variabilité +++
                Glissements antigéniques: mutations
               ponctuelles spontanées sur les gènes HA et
               NA  variants sélectionnés dans le temps
                par la
                     l pression
                            i immunologique
                                i   l i
                Cassures antigéniques:
                                g q     modifications
                majeures
                   j      des
                          d gènes
                                è      t/ NA 
                                  HA et/ou
                nouvelle HA ou NA  nouveau sous-
                                               sous-type
                de grippe A (H1N1, H2N2, H3N2,
                H5N1…)
                H5N1…) )
M. SEGONDY
Variabilité des virus grippaux
              Grippe B: variabilité +
                par glissements antigéniques

M. SEGONDY
Variabilité des virus grippaux
                                   g pp
               Variabilité
               antigénique

                                     Cassure
                                     antigénique
                                       ti é i

                      Glissements
                      antigéniques

                                              Temps
M. SEGONDY
Variabilité des virus grippaux
              Conséquences épidémiologiques
                Grippe A
                  Glissements: épidémies tous les 22--3 ans
                  touchant 55--20% de la population
                  Cassures: pandémies,
                             pandémies tous les 10
                                                 10--30 ans
                  touchant > 80% de la population
                Grippe B
                  Glissements: ppetites épidémies
                                         p        tous les 33--6
                  ans
M. SEGONDY
Variabilité des virus grippaux
              « Cassure » antigénique
                 Apparition d’un nouveau sous-
                                         sous-type de
                virus de grippe A humaine

                H
                Hypothèse
                      thè lal plus
                               l vraissemblable:
                                       i   bl bl
                passage de souche animale (réservoir
                oiseaux
                 i      sauvages)) à homme
                                     h     par mutation
                                                  t ti
                ou recombinaison génétique

M. SEGONDY
Transmissions
    interespèces
    des virus grippaux
    de type A

M. SEGONDY
Nomenclature des virus grippaux
                                                Sous-type

                         A/Sydney/5/93 (H1N1)

                             Numéro
                             N   é                    N
                                                      Neuraminidase
                                                             i id
    Type                            Année
             Lieu d’origine de cahier.    d’isolement
                                                Hémagglutinine

                          B/Beijing/184/93

M. SEGONDY
Grippe: défenses immunitaires

M. SEGONDY
Grippe: diagnostic
              Prélèvement
              P élè       t
                sécrétions nasales (aspiration ou écouvillonnage)
                Attention
                 A      i à la
                             l qualité
                                    li é du
                                         d prélèvement
                                             élè       !!!
              Méthodes
               Détection rapide:
                  IF
                  Immunochromatographie (savonnette)
               Culture
               PCR
M. SEGONDY
               Sérodiagnostic
Grippe: diagnostic
              I.F
                 Rapidité: 4H
                 Sensibilité < culture et PCR
                 Spécificité: attention aux artéfacts
              Immunochromatographie
                 Rapidité: < 1H
                 Sensibilité: 80% / culture
                 Spécificité: > 95% /culture

M. SEGONDY
Grippe: diagnostic
              Culture
               Rapidité: plusieurs jours
               Sensibilité: < PCR
               Spécificité: gold standard
               T è sensible
               Très      ibl aux conditions
                                     diti    de
                                             d
               conservation de l’échantillon
              Peu utile au diagnostic réservé à
               l’isolement des souches pour études
               antigéniques
M. SEGONDY
Grippe: diagnostic
              PCR
                Rapidité: quelques heures
                Sensibilité: +++
                Spécificité:+++
                Typage et sous typage
                Possibilité de mise en évidence de
                mutations de résistances aux antiviraux
                Inconvénient: prix, hors nomenclature
M. SEGONDY
Grippe: diagnostic
              Sérodiagnostic
                Aucune utilité diagnostique (rétrospectif)
                Etudes séroépidémiologiques

M. SEGONDY
Grippe: diagnostic
              En résumé
                Intérêt des techniques rapides (IF et
                Immunochromatographie) mais un test
                négatif n’élimine pas le diagnostic.
                PCR technique
                PCR:      h i    de
                                 d choix
                                      h i mais i trop
                onéreux pour la pratique courante: à
                réserver aux circonstances
                épidémiologiques
                 p          gq     pparticulières
M. SEGONDY
P dé i grippales
             Pandémies i  l

                                          e
    Mortalité au cours des pandémies du XX siècle

       1918-19     « Grippe  ≈ 40 millions
                 espagnole » de décès dans          Les pandémies ont lieu
                                                    tous les 10 à 40 ans
                    A(H1N1)  le monde
                                                       q
                                                    Jusqu’à 50 % de la ppopulation
                                                                          p
                                                    mondiale peut être affectée
       1957-58    « Grippe     1 million            Virus nouveau pour
                 asiatique »   de décès dans        la ppopulation
                                                          p        humaine
                   A(H2N2)     l monde
                               le      d
                                                    Taux de létalité élevé
                                                    1997 “grippe du poulet” (H5N1) à
       1968-69   « Grippe de 0
                             0,8
                               8 millions de        H
                                                    Hong  K
                                                          Kong – rappell de
                                                                         d la
                                                                            l menace
                    Hong-    décès dans le          pandémique
                   Kong »    monde
                   A(H3N2)

M. SEGONDY
M. SEGONDY
M. SEGONDY
M. SEGONDY
M. SEGONDY
Résistance aux antiviraux: données CDC 01 09 09

M. SEGONDY
M. SEGONDY
Diagnostic différentiel
              Viroses respiratoires ± fébriles
                Rhinovirus
                Coronavirus
                VRS
                M t
                Metapneumovirus
                              i
                Virus parainfluenzae
                Adénovirus
                Bocavirus humain
M. SEGONDY
Diagnostic différentiel
              Autres infections respiratoires aiguës
              fébriles
                Mycoplasma pneumoniae
                Chlamydia pneumoniae, psitacci
                Coxiella burnetti
                Legionella pneumophila
                Broncho--pneumonies bactériennes
                Broncho

M. SEGONDY
Diagnostic différentiel
              Syndromes fébriles ± algiques
                CMV, EBV
                Paludisme
                                Notion de voyage
                Arboviroses
                + grand nombre d’infections bactériennes ou
                parasitaires

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