2021 1an RECHERCHES à l'Université de Bretagne Occidentale - Université de Bretagne Occidentale (UBO)

 
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2021 1an RECHERCHES à l'Université de Bretagne Occidentale - Université de Bretagne Occidentale (UBO)
2021
1an   de
RECHERCHES
      à l’Université
      de Bretagne
      Occidentale
2021 1an RECHERCHES à l'Université de Bretagne Occidentale - Université de Bretagne Occidentale (UBO)
Sommaire

                                                                                                                         © ComUBO
                                                       05   Édito

                                                     		06
                                                            32 unités de recherche
    MA THÈSE                                                et 4 Instituts au service de l‘innovation et du savoir

    EN 180 SECONDES                                    08   5 faits marquants
    Chaque année, l'UBO organise la demi-
    finale du concours « Ma thèse en 180
                                                       12   Nos chercheurs à la une
    secondes » pour les doctorants de Brest,
    Lorient et Vannes. Les règles sont simples,
    chaque candidat à seulement 3 minutes et
                                                       14   Nos doctorants à la une
    1 seule diapositive pour présenter et faire
    comprendre ses travaux de recherche. Après         16   Les enjeux scientifiques forts
    une édition en ligne en 2021, les 6 nouveaux
    candidats ont repris le chemin de la scène
    en 2022. C'était pour eux une occasion
                                                       18   Défis comtemporains de la recherche

                                                       22
    unique de transmettre leur passion pour les
    sciences devant un public large et diversifié.          Un écosystème au service de la valorisation

                                                       25   Rayonnement international de la recherche

2
                                                       27   La culture scientifique et technique à l’UBO
                                                                                                                     3
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32

                                                                                                           Édito
                                                             Unités de recherche                                                     Sous le prisme de la Recherche et de         Retour également sur l’évaluation
                                                                                                                                     l’Innovation, 2021 résonnera comme           HCERES des unités de recherche et de
                                                                                                                                     étant l’année de l’évaluation HCERES,        l’Etablissement qui a permis de mon-

                                       70
                                                                                                                                     et de la poursuite de la contractua-         trer la qualité des projets, des recom-
                                                                                                                                     lisation d’une dizaine d’UMR avec le         mandations pour des changements
                                                             Millions d’€ : budget de la recherche                                   CNRS ainsi que 4 UMR INSERM, dont            ciblés, et des stratégies pour les mettre
                                                                                                                                     une nouvelle venue, en l’occurrence          en place. L’affirmation du nouveau
                                                                                                                                     le GETBO dont nous nous félicitons           modèle de la DRIVe, en support aux

                                     813
                                                                                                                                     qu’elle puisse porter l’excellence et la     enseignants-chercheurs et chercheurs
                                                                                                                                     visibilité internationale de l’établisse-    hébergés de notre Établissement a
                                                                                                                                     ment dans le futur contrat. Félicitations    été soulignée, avec des compétences
                                                             Enseignant·e·s-chercheur·e·s                                            au professeur Francis Couturaud et son       nouvelles pour être en phase avec les
                                                             et chercheur·e·s des organismes                                         équipe pour leur travail acharné depuis      régulations en matière de science et
                                                                                                                                     plusieurs années, ayant mené à cette

                                     353
                                                                                                                                                                                  données ouvertes jusqu’à l’accompa-
                                                                                                                                     reconnaissance de haut niveau, ce qui        gnement pour la calibration des projets
                                                                                                                                     valide également notre stratégie de          européens. C’est donc une reconnais-
                                                             Habilité·e·s à diriger la recherche                                     soutien continu à cette unité.               sance de notre organisation et de la
                                                                                                                                     Retour en arrière, deux ans plus tôt.        déclinaison politique de la structuration

                         RECHERCHE 342
                                                                                                                                     Les méta projets du volet Recherche          de la Recherche et de l’Innovation, de

                                  LA                                                                                                 du CPER 2021-2027 sont collectés, puis
                                                                                                                                     leurs financements négociés par coor-
                                                                                                                                                                                  son dynamisme et de sa résilience vis-
                                                                                                                                                                                  à-vis de la logique de financement par
                                                             Contrats de recherche                                                   dination entre l’État et les collectivités   appel à projets, qui est confortée.
                                                                                                                                     territoriales pendant la crise sanitaire     C’est dans un contexte d’optimisme que
                             À L’UBO                                                                                                 du Covid-19. Les maquettes financières

                                       31
                                                                                                                                                                                  débute le nouveau contrat 2022-2027
                                                                                                                                     nous sont enfin parvenues et les pre-        avec un impératif, celui de l’excellence
                               EN 10                         Doctorant·e·s CIFRE*
                                                                                                                                     miers engagements de dépense qui
                                                                                                                                     nous parviennent fin 2021 doivent per-
                                                                                                                                                                                  dans le domaine de la Recherche et du

                        INDICATEURS
                                                                                                                                                                                  passage vers l’Innovation pour acquérir
                                                                                                                                     mettre d’irriguer les unités de recherche    notre pleine place dans le concert inter-
                                                                                                                                     en équipements lourds en phase avec

                                     34%
                                                                                                                                                                                  national des universités qui devient de
                                                                                                                                     le travail de précision pour construire      plus en plus concurrentiel. Enfin, 2021
                                                                                                                                     ces méta projets.                            a été l’occasion de procéder à la mise
                                                             Doctorant·e·s internationaux                                            À y regarder de près et bien que l’année     en place progressive et coordonnée
                                                                                                                                     passée ait été largement perturbée par       des actions de Research-EU de façon à
                                                                                                                                     la crise sanitaire du Covid-19, le bilan     consolider notre université européenne

                                       11
                                                                                                              Christian Brosseau,    Recherche de 2021 contient pratique-         SEA-EU sur le volet Recherche.
                                                                                                                    Vice-Président
                                                                                                           Recherche et Innovation   ment tous les marqueurs d’excellence
                                                                                                                                                                                  Notre ambition au moment où nous fê-
                                                             Écoles doctorales                                                       des années précédentes. À quelques
                                                                                                                                                                                  tons les 50 ans de l’UBO : relever le défi
                                                                                                                                     échelons qu’ils se situent, régional avec
                                                                                                                                                                                  de taille de continuer à être une univer-
                                                                                                                                     le rang de leader de l’UBO sur l’AAP

                                      115
                                                                                                                                                                                  sité pluridisciplinaire avec une très forte
                                                                                                                                     COFUND Bienvenue, national avec la
                                                                                                                                                                                  valeur ajoutée en termes de recherche
                                                                                                                                     création de la quatrième UMR INSERM
                                                                                                                                                                                  et d’innovation pour relever les défis
                                                             Diplômé.e.s de doctorat                                                 du GETBO ou la nomination du profes-
                                                                                                                                                                                  associés aux transitions énergétique et
                                                                                                                                     seur Barrat comme IUF senior sur une
                                                                                                                                                                                  environnementale.
                                                                                                                                     chaire Innovation, et international avec

                                     488
                                                                                                                                     plusieurs projets européens financés,        Je terminerai en adressant mes remer-
                                                                                                                                     la lecture de ce Bilan renforce la vision    ciements aux services de l’UBO mobili-
                                                                                                                                                                                  sés pour la réalisation de ce Bilan de la
© Benjami Deroche

                                                             Doctorant·e·s toutes disciplines confondues                             constante depuis 2016 d’une dyna-
                                                                                                                                     mique collective forte au sein de l’Éta-     Recherche.
                                                                                                                                     blissement.

                                    *CIFRE : Convention industrielle de Formation par la Recherche

                    4                                                                                                                                                                                                           5
2021 1an RECHERCHES à l'Université de Bretagne Occidentale - Université de Bretagne Occidentale (UBO)
32 Unités de recherche et 4 instituts
            au service de l’innovation et du savoir

        Santé                                                                  Numérique                                                                        Sciences                                                               Sciences
        Agro Matière                                                           Mathématiques                                                                    de la mer                                                              Humaines et Sociales
                                                                                                                                                                  OSU IUEM                                                             IBSHS
 IBSAM                                                                         IBNM                                                                                                                                                    Institut Brestois Sciences Humaines et Sociales
 Institut Brestois Santé Agro Matière                                          Institut Brestois Numérique Mathématiques                                          Institut Universitaire Européen de la Mer
                                                                                                                                                                  Dir : Frédéric JEAN (UBO)                                            Dir : Marie-Thérèse CAM
 Dir : Laurent CORCOS (INSERM)                                                 Dir : Laurent NANA
                                                                                                                                                                                                                                              Effectifs                                     Nbre Nbre
                                                     Nbre Nbre                     Effectifs                               Nbre   Nbre                        Effectifs                                                                                                                     EC* HDR*
                                                     EC* HDR*                      globaux                                 EC*    HDR*                        globaux                                         Nbre   Nbre              AXE globaux
                                                                                                                                                                                                                                           SHS                                                             Tutelles
 AXE SANTÉ AGRO MATIÈRE                                          Tutelles      AXE MATH-STIC                                                 Tutelles             AXE MER                                     EC*    HDR*     Tutelles                                                      289 102
                                                     192 108                         262                                   105    48                            312
                                                                                                                                                                                                                                       CECJI 538
 LATIM                                                                         LAB-STICC                                                     IMT Atlantique                                                   150    71                EA 7289 Centre d’Etudes des Correspondances
                                                                 INSERM        UMR 6285 Laboratoire des Sciences                             UBO                                                                                                                                             5    4     UBO
 UMR-S 1101 Laboratoire de Traitement                                                                                                                             LOPS                                                      CNRS       et Journaux Intimes.
 de l’Information Médicale                           22    14    IMT Atlantiqueet Techniques
                                                                                     56      de l’Information, de la                         UBS                                                                                       Dir : Sophie GUERMES
                                                                 UBO                                                        70     29                             UMR 6523 Laboratoire d’Océanographie
                                                                                                                                                                256                                                         IFREMER
 Dir : Eric STINDEL                                                            Communication et de la Connaissance                           CNRS                                                              9      5                          52
                                                                                                                                                                  Physique et Spatiale                                      IRD        CRBC
                                                                               Dir : Christian PERSON                                        ENSTA Bretagne       Dir : Jérôme PAILLET (CNRS)
 GGB                                                                           (IMT Atlantique)                                              ENIB
                                                                                                                                                                                                                            UBO        EA 4451 Centre de Recherche Bretonne et Celtique                 UBO
 UMR-S 1078 Génétique, Génomique
                                                                 EFS                                                                                                                                                                                                                        40    21
                                                                                                                                                                  LGO                                                                  CRBC - Documentation UMS3554                                     Univ. Renne
 Fonctionnelle et Biotechnologies                    26    17    INSERM        LMBA36                                                                                                                                       CNRS       Dir : Yves COATIVY
                                                                 UBO                                                                         UBO                  UMR 6538 Laboratoire Géosciences
 Dir : Emmanuelle GENIN (INSERM)                                               UMR 6205 Laboratoire de Mathématiques                                                                                           28     15    UBO                  85
                                                                               de Bretagne Atlantique
                                                                                                                            35     19        UBS                 56Océan
                                                                                                                                                                                                                            UBS        HCTI
 LBAI                                                                          Dir : Marc QUINCAMPOIX
                                                                                                                                             CNRS                 Dir : Marc-André GUTSCHER (CNRS)                                     EA 4249 Héritages et Construction dans le Texte et               UBO
                                                                 UBO                                                                                                                                                                                                                        49    20
 UMR-S 1227 Lymphocyte B et Auto Immunité             17   13                         18                                                                                                                                               l’Image.                                                         UBS
                                                                 INSERM
 Dir : Jacques-Olivier PERS                                                    Nbre de doctorants                                       64                        LEMAR                                                     CNRS       Dir : Alain KERHERVE
                                                                                                                                                                  UMR 6539 Laboratoire des Sciences                         IFREMER
 CEMCA                                                                         ED MATH-STIC.                                                                      de l’Environnement Marin
                                                                                                                                                                                                               38     24               LEGO      79
                                                                                                                                                                                                                            IRD                                                                         UBO
 UMR 6521 Laboratoire de Chimie,                                 UBO           Dir. Adj                                                                                                                                                 EA 2652 Laboratoire d’Économie et de Gestion
                                                     23    15                         27site Brest : Christian PERSON                   57                        Dir : Luis TITO DE MORAIS (IRD)                           UBO                                                             28    9     UBS
 Électrochimie Moléculaires et Chimie Analytique                 CNRS          (IMT Atlantique)                                                                                                                                         de l’Ouest.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        IMT Atlantiq
 Dir : Philippe SCHOLLHAMMER                                                                                                                                                                                                            Dir : Patrick GABRIEL
                                                                                                                                                                                                                            Univ Caen Norm.
                                                                               ED 3M. Dir. Adj site Brest : Smail TRIKI                  7                        LETG
 GETBO                                                                                                                                                                                                                      Univ Nantes CREAD
 EA 3878 Groupe d’Étude de la Thrombose                                                                                                                           UMR 6554 Littoral, Environnement,                         Univ Rennes 2EA 3875 Centre de Recherche sur l’Education, les               Univ Renne
                                                     25    16    UBO                  26                                                                                                                       11     5                             50                                       43   11
 de Bretagne Occidentale                                                                                                                                          Télédétection, Géomatique                                 UBO - CNRS Apprentissages et la Didactique                                  UBO
 Dir : Francis COUTURAUD                                                                                                                                          Dir : Françoise GOURMELON (CNRS)                          Univ Angers Dir : Patrica MARZIN
                                                                                                                                                                                                                            EPHE
 ORPHY                                                                                                                                                                                                                                                                                                  UBO
 EA 4324 Optimisation des Régulations                                                                                                                             LM2E                                                                 GÉOARCHITECTURE
                                                      14   5     UBO                   21                                                                                                                                   UBO                                                             20    7     Univ Renne
 PHYsiologiques                                                                                                                                                   UMR 6197 Laboratoire de Microbiologie                                EA 2219 Dir : Lionel PRIGENT
                                                                                                                                                                                                               5      2     IFREMER              23                                                     UBS
 Dir : Mickaël THERON                                                                                                                                             des Environnements Extrêmes
                                                                                                                                                                                                                            CNRS       LABERS
                                                                                                                                                                  Dir : Mohamed JEBBAR
 LUBEM                                                                                                                                                                                                                                 EA 3149 Laboratoire d’Études et de Recherche en
 EA 3882 Laboratoire Universitaire de Biodiversité                                                                                                                AMURE                                                                                                                     38    3     UBO
                                                     22    10    UBO                  23                                                                                                                                               Sociologie.
 et Écologie Microbienne                                                                                                                                          UMR 6308 Aménagement des Usages                                      Dir : Nicole ROUX
                                                                                                                                                                                                                            UBO
 Dir : Emmanuel COTON                                                                                                                                             des Ressources et des Espaces Marins et
                                                                                                                                                                  Littoraux – Centre de Droit et d’économie
                                                                                                                                                                                                               34     12    IFREMER    LAB-LEX45
 LIEN                                                                                                                                                                                                                       CNRS                                                                        UBO
                                                                                                                                                                  de la mer                                                            Laboratoire de Recherche en Droit                    40    17
 EA 4685 Laboratoire des Interactions Epithelium                                                                                                                                                                                                                                                        UBS
                                                      15   9     UBO                   17                                                                         Dir : Gaëlle GUEGUEN-HALLOUET                                        Dir : Gilles RAOUL-CORMEIL
 Neurone
 Dir : Laurent MISERY                                                                                                                                             LBCM                                                                 LP3C
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        UBS
                                                                                                                                                                  EA 3884 Laboratoire de Biotechnologie                     UBO        EA 1285 Laboratoire de Psychologie : Cognition,
 SPURBO                                                                                                                                                                                                        5      1                          20
                                                                                                                                                                                                                                       Comportement,  Communication.
                                                                                                                                                                                                                                                                                             11   1     UBO
 EA Soins Primaires, Santé Publique,                                                                                                                              et Chimie Marines                                         UBS                                                                         Univ Renne
                                                     16    1     UBO                  26                                                                          Dir : Isabelle LINOSSIER (UBS)                                       Dir : Maud BESANÇON
 Registre des cancers de Bretagne
 Dir : Jean-Yves LE RESTE                                                                                                                                                                                                              CRPC-CLCS
                                                                                                                                                                  IRDL
                                                                                                                                                                                                                            CNRS / UBS EA 4050 Composante de Recherches en                              Univ Renne
 OPTIMAG                                                                                                                                                          FRE 3744 Institut de Recherche                                       Psychopathologie - Clinique du Lien et Création
                                                                                                                                                                                                               20     7     ENSTA Bretagne      184                                          16   1     Univ Poitier
 EA 938 Laboratoire d’Optique et de Magnétisme        12   8     UBO                   12                                                                         Dupuy de Lôme
                                                                                                                                                                                                                            UBO / ENIB Subjective.                                                      UBO
 Dir : Yann LE GRAND                                                                                                                                              Dir : Philippe LE MASSON
                                                                                                                                                                                                                                       Dir : Luz ZAPATA
 CIC 0502                                                        UBO                                                                                                                                                                   CFV
 Centre d’Investigation Clinique de Brest                        INSERM Effectifs septembre 2021                                                                                                                                                                                                        Univ Nantes
                                                                                                                                                                                                                                       EA 1161 Centre Francois Viète                         5
 Dir : Christophe LEROYER                                               EC : enseignant·e-chercheur·e
                                                                 CHRU HDR : habilitation à diriger des recherches                                                                                                                                                                                       UBO
                                                                                                                                                                                                                                       Dir : Pierre TESSIER (Nantes)
                                    Associés                                                                                                                                                                                                                                Associés
 GEIHP                                                                                                                                                                                                                                 VISA
6 Groupe d’Étude des Interactions                                UBO                                                                                                                                                                                                                                    UBO
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        7
                                                                                                                                                                                                                                       SF 4217 Vidéo de Simulation d’enseignements
 Hôte-Pathogène (Angers)                                         Univ Angers                                                                                                                                                                                                                            ENS de Lyo
                                                                                                                                                                                                                                       et d’ Apprentissage. Dir :Gérard SENSEVY (UBO)
2021 1an RECHERCHES à l'Université de Bretagne Occidentale - Université de Bretagne Occidentale (UBO)
5
           FAITS MARQUANTS
                                                                                                                         1. Pourquoi vous êtes-vous lancés dans le proces-

                                                                        50
                                                                                                                         sus de labellisation UMR pour le GETBO ?
                                                                                                                         Francis Couturaud : Parfois, les unités de re-
                                                                                                                         cherche rencontrent des difficultés pour leur pé-
                                                                                                                         rennisation. La labellisation UMR est une sécurité
L’UBO : 50 ANS DE CONQUÊTE                                                                                               pour le laboratoire et le personnel. Cela permet
                                                                                                                         aussi d’inscrire nos thématiques de recherche à
UNIVERSITAIRE                                                                                                            un niveau national. En 2021, notre rapport HCERES
                                                                                                                         était excellent, ce qui nous a permis de postuler
                                                                                                                         et de déposer un dossier auprès de l’INSERM*          3. Quels sont les futurs projets de la nouvelle
                                                                                                                         pour devenir une UMR. L’INSERM nous soutient          UMR GETBO ?
 Créée en 1971, l’UBO a fêté ses 50 ans en 2021.
                                                                                                                         depuis le début dans ce processus et nous avons
 Cette année était l’occasion de célébrer le passé de                                                                    été accompagnés par l’UBO et le CHU de Brest.         C.L : L’enjeu principal est d’avoir une recherche
 l’université, mais aussi de se projeter vers son avenir.                                                                                                                      fondamentale qui produise autant de résultat
                                                                                                                         Catherine Lemarié : En plus de sécuriser les sta-
                                                                                                                                                                               que la recherche clinique. À court terme, ces ré-
                                                                                                                         tuts, l’UMRisation nous a permis de développer
                                                                                                                                                                               sultats seront visibles grâce aux prochaines sou-
                                                                                                                         et d’agrandir le laboratoire de recherche fon-

                                                                                                      Ans/vloaz
                                                                                                                                                                               tenances de thèse.
                     Pour découvrir les événements                                                                       damentale. Nous avons bénéficié d’aides de la
                                                                                                                                                                               Par ailleurs, les demandes de collaborations
                qui ont marqué les 50 ans de l’UBO                                                                       région Bretagne, du conseil départemental du
                                                                                                                                                                               sont de plus en plus nombreuses depuis l’UMRi-
                                                                                                                         Finistère et de Brest Métropole. Nous avons aussi
                                                                                                                                                                               sation. Grâce à notre double compétence, nous
                                                                                                                         reçu des bourses de la Fédération française de
                                                                                                                                                                               sommes fréquemment sollicités pour des pro-
                                                                                                                         cardiologie et de la Fondation du souffle.
                                                                                                                                                                               jets de recherche translationnelle*.
LE GETBO DEVIENT LA 4e UMR INSERM DE L’UBO                                                                               2. Que signifie cette labellisation pour vous et      F.C : Le GETBO a de nombreux projets en re-
                                                                                                                         pour l’ensemble de l’équipe ?                         cherche clinique et fondamentale : 1 projet ANR

      L
            a thrombose, ou maladie thrombo-embo-           la recherche fondamentale, visant à mieux com-                                                                     est en cours et 2 sont à venir. Nous avons égale-
                                                                                                                         F.C : La labellisation ouvre des perspectives. Nous
            lique veineuse est la conséquence de la         prendre les phénomènes biologiques et physio-                                                                      ment été retenus dans le cadre de l’appel à pro-
                                                                                                                         allons pouvoir agrandir l’équipe en intégrant de
            formation de bouchon de sang au niveau          logiques, pour trouver de nouveaux traitements.                                                                    jet « préfiguration de chaire » lancé par la Fonda-
                                                                                                                         nouveaux chercheurs. Ce statut va également
      d’une veine. Cette maladie est un véritable enjeu     Ces liens étroits ont permis à l’équipe d’avoir une                                                                tion de l’UBO. Cette chaire, issue d’un consortium
                                                                                                                         nous permettre de répondre à de nouveaux ap-
      de santé publique puisque c’est la 3e cause de        production scientifique très importante, avec une                                                                  avec une école d’ingénieur, portera sur les mi-
                                                                                                                         pels d’offres auxquels nous n’avions pas accès
      mortalité cardio-vasculaire.                          augmentation de la qualité et de la quantité des                                                                   lieux hétérogènes et les fluides pour étudier la
                                                                                                                         auparavant. L’UMR nous apporte une crédibilité
      Le groupe d’étude de la thrombose de Bretagne         publications.                                                                                                      structure physico-chimique des thromboses.
                                                                                                                         scientifique au niveau national, notamment au-
      Occidentale (GETBO), créé en 1992, compte au-         Le GETBO se distingue aussi par ses choix de                                                                       Côté recherche, notre objectif est d’explorer les
                                                                                                                         près de l’ANR*, mais aussi au niveau international,
      jourd’hui 64 membres, chercheurs, ingénieurs de       méthodologies. C’est, en effet, l’une des trois                                                                    récidives au niveau fondamental, au même ni-
                                                                                                                         ce qui va nous permettre de diriger des projets
      recherche et techniciens, ainsi qu’une dizaine de     seules équipes au monde à utiliser le modèle                                                                       veau que la recherche clinique. Actuellement, il
                                                                                                                         européens. Par ailleurs, être labellisé INSERM
      doctorants.                                           animal pour définir des modèles de récidives et                                                                    n’y a pas d’équipe qui fait aussi bien sur ces deux
                                                                                                                         nous donne accès à leurs plateformes techno-
      Les recherches du GETBO portent sur l’étude           déterminer les familles à risque.                                                                                  aspects. Nous souhaitons également développer
                                                                                                                         logiques, ce qui nous offre plus de possibilités.
      de la thrombose, son épidémiologie et les trai-       Grâce à ses spécificités, le GETBO est reconnu                                                                     l’approche fondamentale dans nos recherches
                                                                                                                         C.L : L’INSERM est un grand institut national. Nous   sur l’exposition hormonale chez les femmes.
      tements possibles, avec un axe de recherche           à l’échelle internationale et figure parmi les pre-          pouvons bénéficier de leur soutien organisation-
      consacré à un sujet innovant et peu exploré : les     mières équipes de recherche sur les thromboses.                                                                    Nous avons besoin de plus de chercheurs sur ce
                                                                                                                         nel et financier pour le montage de nouveaux          sujet.
      liens entre thrombose et exposition hormonale         En 2021, le GETBO a obtenu le statut d’unité                 projets, en renforçant également notre crédibilité
      chez la femme.                                        mixte de recherche (UMR) en co-tutelle avec                                                                        Finalement, l’objectif principal est de garder la
                                                                                                                         auprès des financeurs. Le label INSERM permet         labellisation UMR sur le long terme pour stabili-
      Le GETBO est également l’une des 4 équipes au         l’INSERM*.                                                   également de nous rendre plus attractifs pour
      monde à s’intéresser au risque de récidive. Pour      Pour en savoir plus sur ce processus « d’UMRisation »                                                              ser nos ressources et les développer.
                                                                                                                         certains chercheurs qui n’auraient pas forcément
      cela, l’unité de recherche a mis en place une         rencontre avec Francis Couturaud, directeur du               voulu venir jusqu’à Brest.                            *Institut national de la santé et de la recherche médicale
      réelle complémentarité scientifique entre re-         GETBO, et Catherine Lemarié, directrice adjointe.                                                                  *Agence Nationale de la recherche
                                                                                                                         F.C : Brest est à la pointe et en bord de mer, nous
      cherche fondamentale et recherche clinique. La                                                                                                                           *La recherche translationnelle se situe à l’interface entre recherche
                                                                                                                         n’avons pas le choix que d’être bons dans notre         clinique et fondamentale, elle permet de produire des applications
      recherche clinique s'appuie sur les résultats de      *Institut national de la santé et de la recherche médicale   domaine !                                               concrètes à partir de connaissances fondamentales

  8                                                                                                                                                                                                                                                     9
2021 1an RECHERCHES à l'Université de Bretagne Occidentale - Université de Bretagne Occidentale (UBO)
EC002 :                                                      LA DALLE DE LEUHAN,
L’UBO N°1 DE L’APPEL À PROJET
BIENVENÜE FINANCÉ                                                                                                         LA PLUS ANCIENNE MÉTÉORITE                                   PLUS ANCIENNE CARTE D’EUROPE
PAR LA RÉGION BRETAGNE                                                                                                    DU SYSTÈME SOLAIRE                                           ET GRANDE DÉCOUVERTE
                                                                                                                                                                                       DE L’ANNÉE

                                                                                                                              L
                                                                                                                                      es premières petites planètes sont appa-
                                                                                                                                      rues au tout début de la formation du sys-
                                                                                                                                      tème solaire, il y a 4,566 millions d’années.
                                                                                                                               Les météorites métalliques forment des traces

                                                                                                                                                                                      D
                                                                                                                               visibles des noyaux de ces planètes, mais la par-             ans un article publié en avril 2021 dans le
                                                                                                                               tie rocheuse était, elle, totalement inconnue. Une            Bulletin de la Société préhistorique fran-
                                                                                                                               équipe de recherche dirigée par Jean-Alix Barrat,             çaise, Clément Nicolas, post-doctorant
                                                                                                                               géochimiste au LEMAR*, a pu se procurer un mor-        à l’université de Bournemouth, et Yvan Pailler,
                                                                                                                               ceau de la météorite EC002 découverte en mai           chercheur titulaire de la chaire ArMeRIE*, pré-
                                                                                                                               2020 dans le désert du Sahara. L’analyse com-          sentent ce qui pourrait être la plus ancienne
                                                                                                                               plète de cette roche a permis de déterminer sa         carte connue d’un territoire en Europe.
                                                                                                                               composition en minéraux et en gaz rares, sa géo-       La dalle de Leuhan (Finistère) est une dalle
                                                                                                                               chimie, ses propriétés physiques, mais également

P
                                                                                                                                                                                      gravée en schiste de 2 mètres de long, décou-
       révu pour une durée de 5 ans, le programme                                                                              sa datation. Ces éléments montrent qu’il s’agit        verte en 1900 dans un tumulus datant de l’âge
       postdoctoral Bienvenüe est porté par la ré-                                                                             d’une roche unique, elle est la seule à présen-        du Bronze (2150 – 1600 avant notre ère). Après
       gion Bretagne, en partenariat avec l’UBO et                                                                             ter l’ensemble de ces caractéristiques. Dans un        avoir retrouvé la dalle dans la cave du musée
 7 autres établissements d’enseignements supé-                                                                                 article publié en mars 2021 dans la revue PNAS,        d’Archéologie nationale, l’équipe de recherche
 rieurs et de de recherche. L’objectif est d’encou-                                                                            les chercheurs montrent qu’il s’agit d’un morceau      a mené une série d’analyses grâce à la photo-
 rager et de valoriser l’excellence de la recherche                                                                            de la croûte d’un des premiers objets du système       grammétrie et à la modélisation 3D. Les résul-
 en Bretagne. Au total, ce sont 75 post-doctorats                                                                              solaire. EC002 est, à ce jour, reconnue comme la       tats mettent en évidence des similitudes entre
 qui seront co-financés par l’Union européenne                                                                                 plus ancienne météorite. Un record enregistré en       les représentations sur la dalle et les cartes du
 au travers de son programme de recherche et                                                                                   avril 2021 dans le Guinness World Records.             territoire environnant du tumulus où elle a été
 d’innovation Horizon 2020.                                                                                                    Une étude approfondie de cette roche très an-          découverte.
 La première phase du projet a permis de sélec-                                                                                cienne va ensuite permettre de reconstituer le
                                                                                                                               contexte de formation et d’imaginer comment les        Pour valider statistiquement et mathémati-
 tionner 25 lauréats, sur plus de 120 candidatures,
                                                                                                                               toutes premières planètes primordiales ont évolué      quement cette hypothèse, Julie Pierson, géo-
 en se basant sur leur projet scientifique : intérêt
                                                                                                                               au cours du temps. La météorite EC002 est donc         maticienne au LETG* a réalisé des analyses de
 scientifique, potentiel d’application, faisabilité
                                                                                                                               un témoin unique du passé du système solaire.          concordance des réseaux. Ils montrent une cor-
 du projet et résultats scientifiques attendus sont
                                                                                                                                                                                      respondance de 80% entre la dalle et la vallée
 pris en compte dans l’évaluation.
                                                                                                                                                                                      de l’Odet. Il s’agirait donc bien d’une carte de ce
 Sur les 25 post-doctorants retenus, 11 ont rejoint                                                                                                                                   territoire, représenté sur environ 30 kilomètres.
 les laboratoires de l’UBO en septembre 2021.
                                                                                                                                                                                      La publication en novembre 2021 de la version
 Leurs projets portent sur des thématiques très
                                                                                                                                                                                      anglaise de l’article dans Oxford Journal of Ar-
 diverses (immunologie, chimie, science de l’édu-
                                                                                                                                                                                      chaeology a offert à la dalle de Leuhan une re-
 cation, écologie marine…) qui s’inscrivent dans 3
                                                                                                                                                                                      nommée internationale. Le caractère inédit de
 des 4 axes de recherche de l’UBO.
                                                                                                                                                                                      cette découverte est également souligné par
 Au-delà de la réalisation d’un projet de recherche                                                                                                                                   le magazine de l'Institut Américaine d'Archéo-
 d’excellence, ce programme est un véritable                                                                                                                                          logie, Archaeology Magazine, qui la classe dans
 accélérateur de carrière pour les jeunes cher-                                                                                                                                       son Top 10 des découvertes archéologiques de
 cheurs. Ils bénéficient des meilleures conditions                                                                                                                                    l’année 2021.
 possibles pour mener à bien leur projet et se
 constituer un réseau.
 Rendez-vous en 2022 pour la deuxième phase
 du programme et pour découvrir les 25 nou-
 veaux post-doctorants !
                                                                                                                            *Laboratoire des Sciences de l’Environnement Marin
 -                                                                                                                           (LEMAR, UMR 6539, UBO-CNRS-IRD-Ifremer)
                                                                                                                                                                                      *ArMeRIE : chaire d’Archéologie maritime et recherche interdiscipli-
                                                                                                                                                                                        naire environnementale. Pour en savoir plus, voir pages 25-56
                                                       Jean-Alix Barrat, géochimiste au LEMAR,
                                                                                                                                                                                      *Littoral, Environnement, Géomatique, Télédétection (LETG, UMR
                                                       a été nommé membre Senior de l'Institut Universitaire de France                                                                  6554 (CNRS-École Pratique de Hautes Études-Université d’Angers-
                                                       au titre de l'Innovation, pour ses travaux sur les terres rares,                                                                 UBO-Université Caen Normandie-Université de Nantes-Université de
                                                       et leur rôle dans les chaînes trophiques marines.                                                                                Rennes 2)

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2021 1an RECHERCHES à l'Université de Bretagne Occidentale - Université de Bretagne Occidentale (UBO)
NOS CHERCHEUR·E·S
 
           à la une
                                                                                                                                                                                                                                            Matthieu TALAGAS
                                                                                                                                                                                                                                            prix Charles Grupper 2021

                                    Geneviève HÉRY-ARNAUD
                                    PU-PH* de l’UMR 1078*
                                                                                                                                                                           Géraldine LE ROUX
                                                                                                                                                                           prix 2021 du livre engagé
                                                                                                                                                                                                           LES RELATIONS ENTRE LA PEAU
                                                                                                                                                                           pour la planète                 ET LE SYSTÈME NERVEUX
      CES MICROBES                                                                                                                       ETHNOGRAPHIE                                                      À l’occasion des Journées Dermatologiques de Paris,
      QUI NOUS VEULENT DU BIEN                                                                                                           DES MICROPLASTIQUES                                               Matthieu Talagas, professeur des universités et praticien
                                                                                                                                                                                                           hospitalier, a reçu le prix Charles Grupper 2021. Ce prix,
      Pour répondre aux attentes grandissantes du grand public,                                                                          Publié en juin, Sea Sisters a reçu le prix 2021 du livre engagé   remis par le laboratoire pharmaceutique Leo Pharma,
                                                                                                   François LUCIA
      mais aussi des professionnels de la santé, Geneviève Héry-                                   prix Lucien Mallet                    pour la planète au festival de Mouans-Sartoux. Géraldine          récompense de jeunes chercheurs pour leur publica-
      Arnaud, PU-PH* de l’UMR 1078*, a publié en avril 2021 un                                     de la Fondation de France             Le Roux y retrace le récit d’eXXpedition : un projet de           tion de haut niveau dans le domaine de la dermatologie.
      livre consacré aux microbes. Nourri d’exemples concrets                                                                            science participative pour documenter la présence du              « C'est une reconnaissance de l’importance de nos tra-
      et de données sur tous les microbiotes de nos organes,                                                                             plastique dans les océans, réalisé à l’occasion d’un tour du      vaux par les pairs, pour moi, comme pour le laboratoire »,
      cet ouvrage permet « d’expliquer ce que font les bactéries                                                                         monde en voilier avec un équipage 100% féminin.                   reconnaît Matthieu Talagas.
      chez nous, de les relier avec des maladies que l’on connaît    AMÉLIORER LA RADIOTHÉRAPIE                                          Lors de son périple de Rapa Nui (île de Pâques) à Tahiti          Ses travaux, menés avec l’équipe du LIEN*, portent sur
      et que l’on redoute, d’expliquer les mécanismes et don-        GRÂCE À L’IMAGERIE MÉDICALE                                         en 2020, l’eXXpedition a été rattrapée à mi-parcours par          l’identification des relations entre les keratinocytes, prin-
      nées obtenues grâce à la recherche, de donner des pers-                                                                            la pandémie, ce qui a contraint les participantes à un huis       cipales cellules de l’épiderme, et les neurones sensoriels.
      pectives et d’aiguiser la curiosité ».                                                                                             clos nautique, mais ne les a pas découragées ! Géraldine          Cette avancée pourrait, à terme, ouvrir la voie à de nou-
                                                                     François Lucia, oncologue radiothérapeute au CHU de
      Avec son livre, Geneviève Héry-Arnaud se place ainsi                                                                               Le Roux, maître de conférence en anthropologie au CRBC*,          velles perspectives de thérapies ciblées contre les dou-
                                                                     Brest, a reçu en mars dernier le prix Lucien Mallet de la
      en défenseuse de nos microbes et veut surtout nous                                                                                 a ainsi agrémenté son livre d’une analyse sociale en condi-       leurs et démangeaisons cutanées.
                                                                     Fondation de France. Ce prix vient récompenser ses tra-
      prouver qu’ils nous veulent du bien, comme elle le fait au     vaux de thèse, réalisés au sein du LaTIM* sous la direction         tion de confinement.
      quotidien dans son laboratoire de recherche et auprès de       du Pr Ulrike Schick et de Mathieu Hatt, sur l’imagerie fonc-        Au-delà du récit d’aventure, Géraldine Le Roux propose
      ses étudiants.                                                 tionnelle pour améliorer la curiethérapie. Cette technique          dans son livre une véritable ethnographie d’un projet de
                                                                     de radiothérapie vient cibler directement la tumeur.                science participative. Elle fait également le lien avec la per-
                                                                     Sa thèse porte sur le cancer du col de l’utérus, qui touche         ception culturelle des déchets plastiques par les sociétés
                                                                     en France près de 3000 femmes par an, avec pour ambi-               océaniennes, son domaine de recherche principal.
                                                                     tion d’améliorer leur prise en charge grâce à l’imagerie
                                                                     médicale, notamment l’IRM* et la TEP*. Les images obte-
                                                                     nues permettraient ensuite de personnaliser et d’adapter
                                                                     les traitements selon les spécificités de chaq ue patiente
                            Pour en savoir plus :                    et ainsi d’obtenir une meilleure efficacité et une moindre                               Pour en savoir plus sur eXXpedition :
                            Ces microbes qui nous veulent du bien    toxicité.                                                                                Sea sisters - Indigène éditions
                                                                                                                                                                                                                     Pour en savoir plus
                            Édition Humen Sciences

                                                                                                                                                                                                           *Laboratoire des Interactions Epithelium-Neurone (EA 4685)

                                                                                                                                                    Pour en savoir plus
                                                                                                                                                      sur les travaux de
      *PU-PH : Professeur des Universités et Praticien Hospitalier                                                                                   Géraldine Le Roux
      *
       Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (GGB,   *Laboratoire de traitement de l’information médicale (LaTIM, UMR
       UMR 1078, Inserm-UBO-Établissement Français du Sang-CHRU        1101, UBO- IMTA-Inserm)
       de Brest)                                                     *Imagerie par résonnance magnétique                                 *Centre de Recherche Bretonne et Celtique (EA 4451)
                                                                     *Tomographie par émission de positons

12                                                                                                                                                                                                                                                                         13
2021 1an RECHERCHES à l'Université de Bretagne Occidentale - Université de Bretagne Occidentale (UBO)
Un article issu du « Bilan ISblue 2020/2021 »

                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ÉCOLE UNIVERSITA
                                                                                                                                                                                                                                                                                                             Sciences et technol          IRE DE RECHERCH
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ogies   marines pour la planète      E
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  bleue

NOS DOCTORANT·E·S
                                                                                                                                                                                                UN MAGAZINE VIDÉO POUR UNE THÈSE À TÉBÉO
                                                                                                                                                                                                Laura Corsi a réalisé une thèse en géographie sociale au sein de la télévision locale

ont du talent
                                                                                                                                                                                                finistérienne, Tébéo. Après avoir soutenu son doctorat en janvier 2020, elle est main-
                                                                                                                                                                                                tenant post-doctorante au Labex Dynamite.
                                                                                                                                                                                                « J’ai mené une thèse dans le cadre d’une convention CIFRE* au sein de Tébéo et du
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               Projets
                                                                                                                                                                                                laboratoire LETG* de l’IUEM* pour le programme ID-îles (Initiatives et Développement                                                                Projets
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   201021
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               2020/2    9
                                                                                                                                                                                                dans les îles du Ponant).                                                                    ISBLUE.indd 1

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      01/09/2020 11:33

                                                                                                                                                                                                Mon travail consistait à contribuer à la recherche sur l’installation de néo-arrivants
                                                                                                                                                                                                insulaires et les interactions de ce phénomène avec les dynamiques territoriales.
                                                                                                                                                           Laura CORSI                          À partir de nos travaux, j’écrivais de façon collaborative le scénario d’un film, dont
                                                                                                                                                           une thèse en géographie sociale      j’assurais ensuite le tournage, l’animation, le montage et la diffusion sur les îles. J’ai
                                                                                                                                                                                                ainsi réalisé une série de 19 émissions de 26 minutes chacune, mettant en scène
                                                                                                                                                                                                179 intervenants.
                                                                                                                                                                                                J’ai ensuite analysé cette expérience à travers le concept de médiation, entre les
                                                                                                                                                                                                sphères de la recherche, des territoires et de la télévision. La thèse a obtenu le
                                                                                                                                                                        Pour voir tous les      second accessit du prix de thèse du Comité National Français de Géographie. »
                                                                                                                                                                        documentaires
                                                                                                                     Élyne DUGÉNY                                       réalisés dans le         *Conventions Industrielles de Formation par la Recherche
                                                                                                                     Finaliste de                                                                *
                                                                                                                                                                                                  Littoral, Environnement, Géomatique, Télédétection (LETG, UMR 6554, CNRS-École Pratique de Hautes
                                                                                                                                                                        cadre de la thèse         Études-Université d’Angers-UBO-Université Caen Normandie-Université de Nantes-Université de Rennes 2)
                                                                                                                     "Ma Thèse en 180 secondes"
                                                                                                                                                                                                 *Institut Universitaire Européen de la Mer
                                    Axel AYET
                                    Meilleure thèse dans le                           LE MICROBIOTE DES HUÎTRES
                                    domaine de la météorologie,
                                    des sciences de l'atmosphère                      EXPLIQUÉ EN 3 MINUTES
                                    et du climat
                                                                                      Après avoir remporté deux fois la finale régio-
     UNE NOUVELLE APPROCHE DE
                                                                                      nale Bretagne/Pays de la Loire du concours
     L’INTERFACE AIR-MER                                                              « Ma Thèse en 180 secondes » (en mars 2020
     Le prix André Prudhomme 2021, qui récompense la meil-                            avant annulation de la suite du concours dû
     leure thèse dans le domaine de la météorologie, des                              aux conditions sanitaires, puis en mars 2021),
     sciences de l'atmosphère et du climat, a été remis à pour                        Élyne Dugény, ancienne doctorante au LE-
     sa thèse intitulée "Flux de quantité de mouvement à l'in-                        MAR*, a enfin pu participer à la demi-finale
     terface air-mer : Approche théorique du couplage entre
                                                                                      nationale du concours en avril 2021.
     turbulence et vagues de vent" réalisée au sein du LOPS* et
                                                                                      Son exposé clair sur l’influence des espèces environ-
     soutenue en 2020 à l’UBO.
                                                                                      nantes de l’huître sur son microbiote, transmis avec pas-                                                                                                                     Dominique ABGRALL
     La thèse d’Axe Ayet revisite la façon de décrire le couplage                     sion et une touche d’humour, a su convaincre le jury. Elle                                                                                                                    lauréat du prix SCOR 2021
     vent-vague. Ce nouveau cadre théorique conduit à des                             a rejoint les 15 autres candidats sélectionnés pour la finale
     avancées significatives pour la modélisation de l’atmos-                         nationale du concours, le 11 juin 2021 à Paris. Même si elle                                    José-Luis GARCIA CORONA
     phère et de l’océan, mais également pour la mise en place
     de paramétrisations de flux air-mer.
                                                                                      ne fait pas partie du trio gagnant, c’est un parcours remar-                                    Prix Maureen Kellerman                            DÉTECTER LES RUPTURES
                                                                                      quable dans le concours pour la jeune chercheuse qui a
                                                                                      soutenu sa thèse le 7 septembre 2021 à l’IUEM.                                                                                                    APPLIQUÉES AUX ASSURANCES
     *Laboratoire d’Océanographie Physique et Spatiale (LOPS, UMR
       6523, CNRS-Ifremer-IRD-UBO)
                                                                                                                                                         DES ALGUES TOXIQUES POUR
                                                                                                                                                                                                                                        Actuaire au GIE AXA et docteur en mathématiques appli-
                                                                                      *Laboratoire des Sciences de l’Environnement Marin (LEMAR, UMR
                                                                                        6539, UBO-CNRS-IRD-Ifremer)
                                                                                                                                                         LES COQUILLES SAINT-JACQUES                                                    quées, Dominique Abgrall est lauréat du prix SCOR 2021
                                                                                                                                                                                                                                        des jeunes docteurs. Ce prix récompense ses travaux de
                                                                                                                                                         José-Luis Garcia Corona est doctorant en écotoxicologie                        thèse réalisés au sein du laboratoire de mathématiques
                                                                                                                                                         au sein du LEMAR*. Sa thèse porte sur la détection d’une                       de Brest (LMBA*) adossé à l’EURIA, institut universitaire
                                                                                                                                                         algue contenant une toxine amnésique, l’acide domoïque,                        d’actuaire de l’UBO.
                                                                                                                                                         dans les tissus d’un bivalve marins. Grâce à une approche                      “Les travaux de ma thèse portent sur deux études de
                                                                                                                                                         qui utilise la physiologie intégrative et la génomique fonc-
                                                     DES ALGORITHMES PLUS RAPIDES                                                                        tionnelle, il a pu découvrir les mécanismes impliqués
                                                                                                                                                                                                                                        détection de rupture. Nous y étudions des phénomènes
                                                                                                                                                                                                                                        aléatoires dont les propriétés sous-jacentes sont suppo-
                                                     QUE LES MÉDECINS                                                                                    dans l’accumulation et la rétention de cette toxine chez la                    sées constantes mais, à un moment, changent. On parle
                                                                                                                                                         coquille Saint-Jacques.                                                        alors de rupture.” explique Dominique Abgrall. La pre-
                                                     Andrei Iantsen, doctorant au LaTIM*, a remporté la première compétition d’algorithme                Lors de la 19ème édition de la conférence internationale                       mière étude permet d’estimer rapidement le nombre
                                                     pour la détection et le contourage automatique de tumeur grâce à l’intelligence arti-               ICHA (International Conference on Harmful Algae) sur les                       moyen de décès suite à un changement. Dans un second
                                                     ficielle, HECKTO 2020.                                                                              algues toxiques, organisée en octobre dernier au Mexique,                      temps, Dominique Abgrall a développé une technique
                                                     L’équipe du LaTIM, dirigée par Andrei Iantsen, a su se démarquer des 17 autres                      José-Luis Garcia Corona a reçu le prix Maureen Kellerman                       qui permet aux actuaires de détecter une rupture dans
                                                     équipes internationales grâce à une approche basée sur du deep learning, parfois                    de la meilleure présentation orale. Ce prix lui a été remis                    une population qui contient plusieurs sous-populations.
                                                     plus performante que les médecins. Les algorithmes développés pendant la com-                       après une délibération portant sur 77 présentations pré-
                                                     pétition pourront avoir des applications concrètes, notamment pour faciliter le travail             sentées par des doctorants de 13 pays différents.                              *
                                                                                                                                                                                                                                         Laboratoire de Mathématiques de Bretagne Atlantique (LMBA,
                                                     des médecins dans l’évaluation de l’évolution des tumeurs au cours du traitement, ou                                                                                                UMR 6205, CNRS-UBO-UBS)
                    Andrei IANTSEN                   pour permettre des études de médecine personnalisée à grande échelle.
                    HECKTO 2020                                                                                                                          *Laboratoire des Sciences de l’Environnement Marin (LEMAR, UMR
                                                                                                                                                           6539, UBO-CNRS-IRD-Ifremer)
                                                     *LaTIM : Laboratoire de traitement de l’information médicale (LaTIM, UMR 1101, UBO- IMTA- Inserm)

14                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               15
2021 1an RECHERCHES à l'Université de Bretagne Occidentale - Université de Bretagne Occidentale (UBO)
DES ENJEUX
SCIENTIFIQUES
LES             FORTS
    ENJEUX SCIENTIFIQUES

                                             FORTS                                                 ÉTHIQUE ET INTÉGRITÉ SCIENTIFIQUE
                                                                                                   AU COEUR DES PRÉOCCUPATIONS

                                                                                                   L
                                                                                                          ’annuelle journée de la recherche de l’UBO         fut fait en mars 2017 : il est un département de
                                                                                                          a été consacrée à l’éthique et à l’intégrité       l’HCERES et ses travaux sont supervisés par le
                                                                                                          scientifique, deux notions consubstantielles       Conseil français de l’intégrité scientifique (COFIS).
                                                                                                   à la recherche et donc considérées dans les uni-          D’emblée, l’OFIS suggéra la désignation, dans
                                                                                                   versités depuis leur création. Cependant, depuis          chaque établissement d’enseignement supé-
                                                                                                   une quinzaine d’années, les problèmes afférents           rieur ou de recherche, d’un référent à l’intégrité
                                                                                                   ont crû et changé d’ampleur. Pour expliquer cette         scientifique : l’UBO s‘en est doté en mars 2018.
                                                                                                   inflation, trois raisons principales sont alléguées :     Au nombre de 170 aujourd’hui, ils sont organisés
                                                                                                   les budgets de plus en plus lourds et difficiles à        en réseau (RESINT) et ont notamment rédigé un
                                                                                                   réunir pour mener à bien les recherches ; la formi-       guide visant à normaliser l’élaboration des dos-
                                                                                                   dable augmentation de la quantité d’informations          siers constitués lorsqu’un manquement est si-
                                                                                                   en circulation et la facilité accrue à s’en saisir ; le   gnalé ou subodoré. Mais, bien sûr, la prévention
                                                                                                   rôle attribué aux critères quantitatifs (bibliomé-        doit primer. Pour cela, les modules de formation
                                                                                                   trie, ordre des signatures, etc.) dans la construc-       ad hoc proposés aux doctorants se sont étoffés et
                                                                                                   tion des carrières.                                       la garantie de bonnes pratiques est désormais un
                                                                                                   La prise de conscience de ces évolutions a                critère d’appréciation dans la plupart des appels
                                                                                                   conduit à l’organisation, en 2007 à Lisbonne,             d’offres de recherche, qui posent des conditions
                                                                                                   d’une première conférence mondiale sur l’inté-            en la matière et demandent des avis autorisés sur
                                                                                                   grité scientifique définie comme « l’ensemble             les protocoles envisagés. Cette exigence intro-
                                                                                                   des règles qui gouvernent les pratiques de la re-         duite par la loi Jardé en 2012 pour les registres

     Focus : le CERNI de l’AUB                            Retour sur la Journée                    cherche pour en garantir le caractère honnête et
                                                                                                   scientifiquement rigoureux ».
                                                                                                                                                             interventionnels a été élargie aux sciences hu-
                                                                                                                                                             maines et sociales par une ordonnance du 16 juin

     Depuis 2021, l’Alliance Universitaire de Bretagne
                                                          de la Recherche 2021                     La notion, on le voit, est plus pragmatique que           2016.
                                                                                                   l’éthique, qui traite de façon surplombante des           Pour satisfaire à cette obligation, l’UBO a décidé,
     (AUB) a mis en place un Comité d’éthique pour
     la recherche non-interventionnelle (CERNI). Le
                                                          en quelques chiffres                     grandes questions que posent les progrès de               dans le cadre de l’AUB, conjointement avec l’UBS
                                                                                                   la science et de leurs répercussions sociétales.          et l’ENIB, de se doter d’un Comité d’éthique pour
     comité AUB a pour rôle de justifier du respect des
     règles d’éthique dans les projets de recherche       14 Octobre 2021                          Dans ce dernier registre, la France disposait, de-
                                                                                                   puis 1983, d’un Comité consultatif national, alors
                                                                                                                                                             la recherche non-interventionnelle (CERNI). La
                                                                                                                                                             Journée de la Recherche a permis de situer les
     menés par les membres de l’UBO, de l’UBS et
                                                                                                   que l’intégrité scientifique demeurait un parent          enjeux, de préciser les modalités en place ou en
     de l’ENIB. Un avis favorable délivré par le CER-     1 thématique centrale :                  pauvre. Au terme d’une seconde conférence                 devenir, et de sensibiliser à ces questions les per-
     NI indique que le projet a été considéré comme       éthique et intégrité scientifique
                                                                                                   mondiale, tenue à Singapour en 2010, les choses           sonnels et usagers de l’UBO.
     répondant aux principes éthiques de recherche.
                                                                                                   allaient changer. En 2015, une charte nationale de
     Le CERNI assure également une veille sur les         5 intervenants experts                  déontologie de la recherche a été promulguée et
     évolutions législatives et réglementaires concer-    sur ces questions, dont 1 intervenante
                                                                                                   une conférence de ses signataires — dont l’UBO —
     nant les recherches sur la personne humaine et la    de l’université de Split, membre de
                                                                                                   installée. L’année suivante, un rapport demandé à
     protection des données.                              l’alliance SEA-EU
                                                                                                   Pierre Corvol, médecin et biologiste, membre de
                                                                                                   l’Académie des sciences qu’il préside aujourd’hui,
     Pour en savoir plus :                                200 participants                         allait ouvrir un nouveau champ. Intitulé « Bilan                                         Daniel Le Couedic,
     https://aub.bzh/recherche/cerni/                     dont 96 doctorants
                                                                                                   et propositions de mise en œuvre de la charte                         Référent intégrité scientifique à l’UBO
                                                                                                   nationale d’intégrité scientifique », il comportait                                           de 2018 à 2021
                                                          500 vues                                16 recommandations, dont la création d’un Office
                                                          sur les rediffusions sur Youtube
                                                                                                   français de l’intégrité scientifique (OFIS), ce qui

16                                                                                                                                                                                                                   17
2021 1an RECHERCHES à l'Université de Bretagne Occidentale - Université de Bretagne Occidentale (UBO)
DÉFIS CONTEMPORAINS                                                                                                            ©Mathieu Le Gall                                                                                                                     ©Entre-vue

DE LA RECHERCHE
     Deux disciplines pour un même objectif :                                                                                                     À chaque maladie auto-immune rare, son traitement
     en finir avec le gaspillage alimentaire

     L                                                                                                                                            A
            e projet de recherche FoodRest est né d’un        fruits et légumes altérés, ainsi que dans les lieux                                          ujourd’hui, on estime que 5 à 8 % de la       Dans un premier temps, une série d’analyses mo-
            constat éloquent : les ménages produisent         de stockage. Cette méthodologie permet d’étu-                                                population mondiale est atteinte d’une        léculaires a permis de classer les patients atteints
            53% des déchets alimentaires en Europe. Un        dier l’ensemble du processus de gaspillage dans                                              maladie auto-immune rare. Connaître et        de SGS dans 4 groupes, ou clusters, selon leur
     gaspillage qui pourrait être en grande partie évité.     les ménages : le comportement face aux fruits et                                    comprendre les origines de ces pathologies est         profil immunitaire. Ces clusters sont ensuite ca-
     Pour comprendre son origine, et trouver des so-          légumes altérés, les pratiques de conservation et                                   essentiel pour mettre en œuvre des stratégies de       ractérisés spécifiquement à l’aide d’un algorithme
     lutions pour limiter le gaspillage des fruits et lé-     les contaminations microbiennes.                                                    médecine personnalisée. C’est précisément l’ob-        d’apprentissage dérivé du machine learning. En
     gumes frais, deux laboratoires de l’UBO se sont          L’objectif final de FoodRest est de réaliser un                                     jectif du projet européen IMI PRECISESADS qui a        déterminant les biomarqueurs moléculaires res-
     associés : le LEGO* pour le volet comportemental         guide des bonnes pratiques d’hygiène pour ac-                                       réuni, pendant 5 ans, 28 partenaires de 12 pays        ponsables du SGS, l’étude du LBAI fournit une
     et communicationnel, et le LUBEM* pour le volet          compagner les consommateurs et les aider à li-                                      différents, dont l’équipe de recherche du LBAI*, le    compréhension claire de l’hétérogénéité de la
     microbiologique.                                         miter le gaspillage des fruits et légumes frais.                                    laboratoire d'immunologie de l’UBO.                    maladie, et donc de ses causes, et ouvre la voie
                                                                                                                                                  Dans un article publié en juin 2021 dans Nature        vers des thérapies ciblées pour ces patients.
     Lancé début 2021, le projet FoodRest est financé
     par l’ANR* pour une durée de 4 ans. Pour le mener                                                                                            Communications, le LBAI s’est particulièrement
     à bien et être au plus près de la réalité, 50 familles                                                                                       intéressé au syndrome Gougerot-Sjögren (SGS).
     volontaires ont été recrutées dans le pays de                                                                                                Cette maladie auto-immune se manifeste par une
     Brest. Des poubelles connectées sont installées                                                                                              destruction des glandes qui produisent la salive et
     dans chaque foyer, afin de peser précisément le          *Laboratoire d'Économie et de Gestion de l'Ouest (LEGO, UR 2652,                   les larmes. Actuellement, il n’existe aucune théra-
     volume de fruits et légumes jetés. En complé-              UBO-IMTA-UBS)                                                                     pie efficace contre le SGS, en raison de l’hétérogé-
     ment, des entretiens sont menés auprès des par-
                                                              *Laboratoire Universitaire de Biodiversité et d’Écologie Microbienne               néité des symptômes. C’est cette hétérogénéité,        *Lymphocytes B et Autoimmunité (LBAI, UMR 1227, UBO-Inserm-CHRU
                                                                (LUBEM, UR 3882, UBO)                                                                                                                      de Brest)
     ticipants et des prélèvements sont réalisés sur les      *Agence Nationale de la Recherche
                                                                                                                                                  et notamment son origine, qui intéresse le LBAI.

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© Natalia Llopis monferrer / UBO ; Philippe Elies / UBO ; Valentin Foulon/CNRS,
                                                                                                                                      réalisée au sein de la plateforme d'Imagerie et de Mesures en Micrsocopie

                                                                                                                                                                                                                                                                                         ©Mathieu Le Gall
                                                                                                                                                                                                                                                                                         Le LUBEM
                                                                                                                                                                                                                                                                                         renforce ses liens avec l’INRAe
                                                                                                                                                                                                                         IUEM                                                                               Le LUBEM* est aujourd’hui le seul laboratoire en
                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agriculture et alimentation de l’UBO. Il étudie ces
                                                                                                                                                                                                                         leader des recherches                                                              domaines sous l'angle microbiologique en s'inté-
                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ressant aux bactéries sporulées et aux champi-
                                                                                                                                                                                                                         sur le silicium                                                                    gnons (levures & moisissures). Si les équipes tra-
                                                                                                                              ©NASA                                                                                                                                                                         vaillent fréquemment avec d’autres laboratoires
                                                                                                                                                                                                                        Les organismes vivants sont faits de carbone. On                                    locaux comme le LEGO* ou le BEEP*, des colla-
                                                                                                                                                                                                                        ignore souvent qu’une bonne partie d’entre eux                                      borations historiques et régulières existent avec
                                                                                                                                                                                                                        utilisent l’élément silicium pour constituer des                                    l’INRAe*, et en particulier avec le département
     De petits courants influencent le climat                                                                                                                                                                           enveloppes externes et internes. C’est notam-                                       MICA, qui s’intéresse aux micro-organismes dans
                                                                                                                                                                                                                        ment le cas des diatomées, des algues microsco-                                     la chaîne alimentaire.
                                                                                                                                                                                                                        piques qui fournissent 25% de l’oxygène que nous                                    Une convention entre les deux organismes a été
     La surface des océans est balayée par de mul-          Ces modifications du courant des Aiguilles, même                                                                                                            respirons.                                                                          établie pour formaliser ces liens historiques et
     tiples courants de tailles et de formes différentes,   de petite échelle, pourraient alors entraîner un                                                                                                            Une étude de synthèse, pilotée par Paul Tréguer                                     fructueux. Depuis le 1er janvier 2022, le LUBEM est
     qui contribuent à la circulation d’éléments phy-       déséquilibre et avoir des répercussions majeures                                                                                                            et Jill Sutton du LEMAR*, montre que les apports                                    donc officiellement une unité sous contrat (USC)
     siques. Le courant des Aiguilles, situé au large       sur le climat, notamment avec l’augmentation de                                                                                                             de silicium dans l’océan (dus aux fleuves, à la                                     de l’INRAe. Si l’INRAe ne devient pas encore une
     de l’Afrique du Sud, est un courant océanique qui      la fréquence et l’intensité des cyclones.                                                                                                                   dissolution des roches siliceuses, aux vents...)                                    tutelle du LUBEM, cette convention permet, entre
     contribue à la circulation d’eau chaude et salée                                                                                                                                                                   sont actuellement équilibrés par les bio-dépôts                                     autre, de renforcer les échanges, faciliter le mon-
     depuis l’océan Indien jusqu’à l’Atlantique. Ces                                                                                                                                                                    dans les sédiments. Cependant, le cycle du sili-                                    tage de projets et favoriser l'accès à des contrats
     masses d’eau alimentent ensuite la circulation                                                                                                                                                                     cium est, comme celui du carbone, soumis à de                                       doctoraux d’établissement pour des thèses en
     thermohaline, à l’origine de la régulation du cli-                                                                                                                                                                 fortes pressions des activités humaines : pra-                                      commun.
     mat.                                                                                                                                                                                                               tiques agricoles qui engendrent l’érosion des                                       Dans le cadre de cette convention, le LUBEM a
     Dans une étude publiée en septembre 2021 dans                                                                                                                                                                      sols, constructions de barrage qui détournent les                                   dû se projeter dans le plan « INRAe 2030 », une
     Nature Communications, Jonathan Gula, cher-                                                                                                                                                                        rivières, changement climatique… Ces activités
                                                                                   Jonathan Gula, océanographe physicien au                                                                                                                                                                                 feuille de route qui définit les grands objectifs
     cheur au LOPS*, et ses collaborateurs du centre                                                                                                                                                                    viennent modifier la composition des sédiments
                                                                                   LOPS a été nommé, en 2020, membre Junior                                                                                                                                                                                 scientifiques de l’institut pour la prochaine dé-
     GEOMAR Helmholtz pour la recherche océanique                                                                                                                                                                       et les éléments disponibles pour les organismes.
                                                                                   de l’Institut Universitaire de France pour ses                                                                                                                                                                           cennie. Dans ce contexte, le LUBEM s’est inscrit
     de Kiel, démontrent pour la première fois l’impact                            travaux sur la turbulence océanique et les                                                                                           Au cours du 21e siècle, ces perturbations pour-                                     dans 2 axes : « Comprendre le fonctionnement
     significatif de la dynamique de fine échelle dans                             processus dynamiques.                                                                                                                raient fortement affecter les organismes siliceux                                   des microbiotes alimentaires pour accompagner
     la région du courant des Aiguilles sur la circula-                            Ce statut, obtenu pour une durée de 5 ans, lui                                                                                       et déséquilibrer le cycle global du silicium, avec                                  la transition écologique » et « Étudier et optimi-
     tion océanique. Pour cela, les chercheurs ont uti-                            permet de se concentrer uniquement sur ses
                                                                                                                                                                                                                        des conséquences à grande échelle.                                                  ser les systèmes microbiens pour les biotech-
     lisé des simulations de très haute résolution per-                            projets de recherche pour créer et innover.
                                                                                                                                                                                                                        En 25 ans, c’est le troisième article de synthèse                                   nologies », en particulier dans les domaines de
     mettant de modéliser les structures dynamiques                                                                                                                                                                     sur le cycle du silicium piloté par des chercheurs                                  l’agroalimentaire, de l'environnement et de la
     (courants, tourbillons…) sur des surfaces d’environ                                                                                                                                                                de l’IUEM* qui confirme ainsi son rôle de leader                                    santé. Des sujets d’avenir à suivre de près !
     1km. Les résultats montrent que ces structures                                                                                                                                                                     mondial sur ce thème scientifique.
     de petites échelles modifient les échanges entre                                                                                                                                                                                                                                                       *Laboratoire Universitaire de Biodiversité et d’Écologie Microbienne
                                                                                                                                                                                                                                                                                                              (LUBEM, UR 3882, UBO)
     les océans et peuvent conduire à une augmen-                                                                                                                                                                       *
                                                                                                                                                                                                                         Laboratoire des Sciences de l’Environnement Marin (LEMAR, UMR                      *Laboratoire d'Économie et de Gestion de l'Ouest (LEGO, UR 2652,
                                                            *Laboratoire d’Océanographie Physique et Spatiale (LOPS, UMR 6523,
     tation de 40% du flux d’eau chaude et salée vers         CNRS-Ifremer-IRD-UBO)
                                                                                                                                                                                                                         6539, UBO-CNRS-IRD-Ifremer)                                                          UBO-IMTA-UBS)
                                                                                                                                                                                                                        *Institut Universitaire Européen de la Mer                                          *Laboratoire Biologie et Ecologie des Environnements marins Pro-
     l’Atlantique.                                                                                                                                                                                                                                                                                            fonds (BEEP, UMR 6197, Ifremer-UBO-CNRS)
                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'en-
                                                                                                                                                                                                                                                                                                              vironnement
20                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         21
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