Effets collatéraux de l'antibiothérapie néonatale à moyen et long termes

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Effets collatéraux de l'antibiothérapie néonatale à moyen et long termes
Journée du GEN
24 mai 2014, Aix en Provence

  Effets collatéraux de l’antibiothérapie néonatale
                à moyen et long termes
                            Catherine MICHEL
                     (Fanny MOREL & Dominique DARMAUN)

         UMR 1280 Physiologie des Adaptations Nutritionnelles (PhAN),
              INRA & Université de Nantes, IMAD, CRNH Ouest
                     Catherine.Michel@univ-nantes.fr

                                                                        1
Effets collatéraux de l'antibiothérapie néonatale à moyen et long termes
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                      C Michel

                          Plan
     Quelles raisons de croire que l’antibiothérapie
   néonatale puisse exercer des effets à long terme ?

                   Quelles évidences aujourd’hui ?
                   •Antibiothérapie néonatale & Asthme
             •Antibiothérapie néonatale & maladies intestinales
            •Antibiothérapie néonatale & composition corporelle

                       Conclusions & Perspectives
Effets collatéraux de l'antibiothérapie néonatale à moyen et long termes
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                   C Michel

   Le microbiote intestinal peut affecter différentes
          fonctions physiologiques de l’hôte

                                                              Burcelin Acta Diabetol. 2011;48:257

                NB: Impact dépend de la composition et/ou activité du microbiote
Effets collatéraux de l'antibiothérapie néonatale à moyen et long termes
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                 C Michel

  Le microbiote intestinal néonatal pourrait formater
     différentes fonctions physiologiques de l’hôte
    En modulant différenciation tissulaire                   En modulant epigénome
                                          Conventionnelles
                                          Axéniques

Expression du « brain derived neurotrophic factor »
dans le cerveau de souris conventionnelles et axéniques
âgées de 9 semaines Sudo et al J Physiol, 2004, 558: 263
               Réseaux
                               Prise alimentaire
BDNF           Neuronaux
                               Dépense énergétique
               hypothalamiques
    Lebrun et al Auton Neurosci 2006;126-127:30
    Fargali et al J Mol Neurosci 2012;48:654
                                                                Mischke M, Plösch T. Am J Physiol Regul
                                                                Integr Comp Physiol. 2013 15;304:R1065
        « Education » des réponses immunitaires
                                                                Modulation réponses ultérieures
        Détermination du nombre d’adipocytes …
                                                                         au « stress »
Effets collatéraux de l'antibiothérapie néonatale à moyen et long termes
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                      C Michel

   L’antibiothérapie néonatale module la composition
                 du microbiote intestinal
                                                    AF: infants subjects free from antibiotic exposure
 Palmer et al PLoS Biol 2007, 5: e177                    during the faeces-sampling period (n=18)
                                             AT : infants subjects orally administered cefalexin (50 mg kg1,
                        Baby                          four times a day) in the first 4 days of life (n=5)
                                                          Tanaka et al FEMS Immunol Med Microbiol 2009, 56: 80

                        Baby

         ATB
(nature non spécifiée)

                            Effets variables selon nature ATB
                            mais pas forcément en accord avec spectres d’action
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      Les modulations néonatales de la composition
        du microbiote intestinal perdureraient (1)
  (puisque microbiote intestinal serait définitivement “formaté” au début de la vie)
                                     Éléments favorables
•« the fecal microbiota resembles that of adults by about the second year of life » [Mackie, 1999].
(Cibik et al 2004, Langhendries 2006,…)
• l’activité du microbiote atteint un profile « adulte » chez les enfants d’env 2 ans [Midtvedt et al
1988, 1992)
•« By the end of the first year of life, the idiosyncratic microbial ecosystems in each baby, […] had
converged toward a profile characteristic of the adult gastrointestinal tract » [Palmer et al 07]

Des différences initiales de composition du microbiote sont (en partie) retrouvées plusieurs mois
plus tard [Rinne et al 2006, Gronlund et al 1999, Salminen et al 2004, Salvini et al 2011]

                                    Éléments défavorables
Chez les rongeurs, la composition du microbiote intestinal continue à varier longtemps après le
sevrage complet [Inoue & Ushida 2003, Fança-Berthon et al 2010]

Chez les humains, certains auteurs rapportent des évolutions de composition de microbiote au-delà
de la 2e année de vie [Ellis-Pegler et al 1975, Tannock 2007, Bergström et al 2014]

  Le formatage existerait mais ne s’effectuerait pas « à l’identique » ?
La nature des colonisateurs initiaux conditionnerait la composition ultérieure du microbiote
[Eggesbo et al 2011; Scholtens et al 2012]
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Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                C Michel
      Les modulations néonatales de la composition
        du microbiote intestinal perdureraient (2)
                                   Quid dans les faits ?
ampicilline+ gentamicine                         Fouhy et al Antimicrob Agents Chemother. 2012;56:5811
dans les premières 48h     Phyla                                        Genres

  n=9
  V&C
  BF&FF

  n=9
  V only
  BF&FF

                                                        Members of the Enterobacteriaceae family
                                                        Bifidobacterium sp.
                      Quid à plus long-terme ?          Lactobacillus sp.
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L’antibiothérapie néonatale pourrait donc affecter la
      santé ultérieure (= exercer une empreinte)
              par 2 voies mécanistiques

          Physiologie          programmation                 Physiologie
           De l’enfant                                       De l’adulte

       Formatage
                                                              Modulation
fonctions physiologiques          ATB
                                                       fonctions physiologiques
                                néonatale

         Microbiote                                          Microbiote
         Intestinal                Formatage durable         intestinal
          précoce                                              adulte

                                                                   âge
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Journée du GEN, 24 mai 2014,                       C Michel

             Antibiothérapie néonatale et asthme

                                 Système
                               immunitaire

     Pas d’ATB
Effets collatéraux de l'antibiothérapie néonatale à moyen et long termes
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                       C Michel

     L’antibiothérapie néonatale semble augmenter
                   le risque d’asthme
  Uniquement études prospectives, diagnostic « wheezing/ asthmatic symptoms » avant l’âge de 10 ans

                                                                    Penders et al Eur Respir J, 2011;38:295
                                                                     pooled risk estimate for
                                                                     asthma/wheeze :
                                                                     OR= 1.27,
                                                                     95% CI 1.12–1.43

                                                                    Forte hétérogénéité :
                                                                    Période de l’ATB
                                                                    Définition asthme
                                                                    Age diagnostic…

                          Toutes études        Études rétrospectives        études prospectives
  Marra et al CHEST,      OR= 2.05,            OR= 2.82;                    OR= 1.12;
  2006;129:610
  Métanalyse 8 études     95% CI: 1.41–2.99    95% CI 2.07 - 3.85           95% CI, 0.88 - 1.42
  Murk et al Pediatrics   OR= 1.52             OR= 2.04                     OR= 1.25
  2011;127;1125
  Métanalyse 20 études
                          95% CI: 1.30 –1.77   95% CI: 1.83–2.27            95% CI: 1.08 –1.45
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                                    C Michel

    L’effet de l’antibiothérapie néonatale sur risque
    d’asthme varie selon âge au moment diagnostic
  Figure 1. Association between antibiotic exposure in
  infancy and persistent asthma at 3 to 7 years of age.
  The odds ratios achieved statistical significance at all
  ages (P < .001).
     Ong et al Ann Allergy Asthma Immunol 2014, in press

    Quid à l’âge adulte ?

             *OR (95% confidence interval) and p value per prescription adjusted for age, sex, social class,
             parental allergic disease, and number of siblings.
                                                                                     diagnostic à env 35 ans
                                                                                     Cullinan et al Thorax, 2004, 59:11

                                                 Causalité inverse ?
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                         C Michel

     L’effet de l’antibiothérapie néonatale sur risque
                   d’asthme serait mineur
                                                                     Penders et al Eur Respir J, 2011;38:295
Restricted meta-analyis :
Pas de concomittance entre ATB et diagnostic
Ajustement tenant compte infections respiratoires

                                                      pooled risk estimate for asthma/wheeze :
                                                      OR= 1.12, 95% CI 0.98–1.26
Ong et al Ann Allergy Asthma Immunol 2014, in press   risk estimate for persistent asthma :
exclusion des infections respiratoires                OR= 1.3, 95% CI 1.1–1.4
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                               C Michel

     L’effet de l’antibiothérapie néonatale sur risque
     d’asthme est à nuancer en fonction nature ATB
                   et nombre d’expositions
                                        Marra et al Pediatrics 2009;123;1003

                                                                                       +

                                                               ie: N° of URTI & LRTI

       Jedrychowski et al J Physiol Pharmacol. 2011; 62: 189
                                                Macrolides > Cephalosporines>Penicillines
Journée du GEN, 24 mai 2014,                    À approfondir ?                            C Michel
Journée du GEN, 24 mai 2014,                         C Michel

                       Antibiothérapie néonatale
                       et pathologies intestinales

                                  Barrière
                                intestinale?
                                Syst immu?

     Pas d’ATB
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           L’antibiothérapie néonatale augmenterait
                        le risque de MICI
  étude rétroprospective, diagnostic IBD avant l’âge de 19 ans   Kronman,et al Pediatrics 2012;130;e794

                                                                  Exposure before 1 year of age
                                                                  was associated with a 5.5-fold
                                                                  increased IBD risk (aHR: 5.51
                                                                  [95% CI:1.66–18.28])
                                                                  compared with those
                                                                  unexposed at that age,

                                                                  with decreasing IBD risks by 5
                                                                  years (aHR: 2.62 [95%
                                                                  CI:1.61–4.25])

                                                                  and 15 years (aHR: 1.57 [95%
                                                                  CI: 1.35–1.84]).

Shaw et al J Pediatr 2013;162:510
« individuals with an otitis media diagnosis by age 5 years were 2.8-fold more likely to
be an IBD case (95% CI, 1.5-5.2; P = .001) […] We suspect that otitis media serves as a
proxy measure of antibiotic use »
Journée du GEN, 24 mai 2014,                     C Michel

L’effet de l’antibiothérapie néonatale sur risque MICI
        serait à nuancer en fonction nature ATB
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                   C Michel

          L’antibiothérapie néonatale augmenterait
                 le risque de maladie cœliaque
                                                           Mårild et al. BMC Gastroenterology 2013, 13:109
Additional file 3. Odds ratios for prior antibiotic use in individuals with coeliac disease.
Stratified analyses by age at biopsy.
Journée du GEN, 24 mai 2014,                     C Michel

Antibiothérapie néonatale et composition corporelle

                               Hypothalamus ?
                               Tissu adipeux ?

     Pas d’ATB
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                          C Michel

   Chez l’Homme, l’antibiothérapie néonatale
augmenterait le risque de surpoids/obésité ultérieur
                                    … sous certaines conditions
      Ajslev et al Int J Obes, 2011;35:520                   ATB
                                                                          *
                                                                   *
                                                                                  *                     NS

                                                                         Trasande et al Int J Obes, 2013;37:16

                                                                   ATB
 NB: microbiote intestinal différent selon que
 mère obèse ou non
                 Collado et al Am J Clin Nutr 2008;88:894;
                 Santacruz et al Br J Nutr 2010;104:83]

 « Early life antibiotic exposure was associated with
 increased childhood BMI in boys (+0.107 kg/m2
 p
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                                             C Michel

Chez la souris, l’antibiothérapie postnatale influence
la composition corporelle, de façon variable selon la
                    nature de l’ATB
                                               Dose:
                    sevrage             ATBs:1000 mg.kg BW-1
    Élevage maternel
                                                Water                         n = 10
                                               Antibiotic                     n = 10
0    5    10   15    20    25   30      35   40 45 50       55   60   65 70
                          Jours postnataux
                                                                              x3
                                         B                                             C
                                                            *         *                                                      *
A              *                                                                   *
                          *
                                    *
                                *

                                                                                           Cho et al Nature, 2012;488(7413):621
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                                                                                                                                     C Michel

                  Chez le rat, l’administration néonatale d’amoxicilline
                    n’influence pas significativement la composition
                                              sevrage corporelle
                           Élevage maternel +                    Dose:
                                           gavages quotidiens                                                      ATB (Amoxycillin): 100 mg.kg BW-1
                                 n=8                         CTL                                      Alimentation adaptée à la croissance (Safe A03)
                                 n=8                    Antibiotic                                                                                                                          Jours postnataux
                                           0        5        10      15         20        25    30      35         40                 45     50             55    60    65                    120 125 130

                                                                                                                                                             Body fat                       Leptin

                                                                                                                        Length (cm)
                  650                                                                                              50
Body weight (g)

                                                                                                                                                   10                                  5
                                  CTL - Weight
                  600
                                  ATB - Weight                                                                                                          8                              4
                                                                                                                   45
                  550             CTL - Lenght

                                                                                                                                              % of BW

                                                                                                                                                                             ng.mL-1
                                                                                                                                                        6                              3
                  500             ATB - Lenght
                                                                                                                   40
                                                                                                                                                        4                              2
                  450
                                                                                                                   35                                   2                              1
                  400

                  350                                                                                                                                   0                              0
                                                                                                                   30                                       CTL    AMX                     CTL   AMX
                  300

                  250                                                                                              25
                                                                                                                        Pas d’impact sur composition du microbiote adulte
                  200                                                                                                                 100%                                                       Erysipelotrichaceae
                  150
                                                                                                                   20
                                                                                                                                      80%                                                        Methanobacteriales
                                                                                                                                                                                                 C leptum cluster
                  100
                                                                                                                   15                 60%
                                                                                                                                                                                                 C coccoides cluster
                  50                                          Postnatal age (days)
                                                                                                                                      40%                                                        Lactobacillales
                   0                                                                                               10
                        0   10   20   30       40       50    60     70    80        90   100   110   120    130                                                                                 Bifidobacterium sp
                                                                                                                                      20%
                                                                                                                                                                                                 Bacteroides sp
                                                    Morel et al Neonatalogy, 2013;103:182                                              0%                                                        Escherichia sp
                                                                                                                                             CTL
                                                                                                                                              1             AmX
                                                                                                                                                             2     3    CTL
                                                                                                                                                                          4  AmX
                                                                                                                                                                               5
                                                                                                                                             J15            J15         J130 J130
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                                C Michel

                                   Conclusions
• L’existence de conséquences à long terme / « à distance »
des antibiothérapies néonatales est plausible
    •Via modulation de l’impact du µbiote sur formatage de la physiologie de l’hôte
    •Via formatage de la composition du µbiote

• Pas de réelles preuves d’empreinte (sur µbiote et/ou sur
  fonctions physiologiques) à ce jour :
    •Manque d’études longitudinales
    •Causalité inverse difficile à exclure

• Effets (logiquement!) variables selon ATB
    Quid doses, durée traitement, fenêtres temporelles ?

•Impacts de faible ampleur : contribution « santé » réelle ?
Journée du GEN, 24 mai 2014,                                          C Michel

                                           Perspectives
•Quid influence antibiothérapie néonatale sur autres
                                         Burcelin Acta Diabetol. 2011;48:257
fonctions ?

•Quid influence des autres modulateurs du microbiote
intestinal sur santé ultérieure ?
              Salvini et al J. Nutr. 2011, 141: 1335
                    *            *           *

                          *

               + Prébiotiques
Journée du GEN, 24 mai 2014,                      Perspectives (2)                                                        C Michel

•Période néonatale déjà trop tardive ?
                                                                  Milk composition
                                                             Milk µbiota
                                                                        Perez et al 2007;
                                                                    Donnet-Hughes et al 2010;
                Wikoff et al 2009                                        Jost et al 2013

           Host metabolism
                Trans-                        gut
                                          µbiota
           placenta transferStrus et al 2012                                  Martin et al 2012
                                                                              Jost et al 2013;
                                             ;
                                    Arroyo et al 2010                         Jeurink et al 2013
             Nutrients
             Hormones
               SCFA ?                           vaginal                 Eg: Schultz et al 2004;
              Folates ?                                                 Grönlund et al 2011;
              Thum et al 2012;
                                                µbiota                  Grzeskowiak et al 2012
              Mischke &
                                        Eg: Gronlund et al. 1999;                                     Adapted from Thum et al 2012
                                        Salminen et al. 2004;
              Plosch, 2013
                                        Makino et al 2013
                                                                                                          & Jeurink et al 2013
                                 Gestation                      Birth                     Lactation
      Antibiothérapie pendant gestation peut contribuer à la programmation du descendant
•   Thans et al Prenatal exposure to metronidazole and risk of childhood cancer: a retrospective cohort study of children
    younger than 5 years. Cancer 1998;83:1461.
•   Norgaard et al Maternal use of antibiotics, hospitalisation for infection during pregnancy, and risk of childhood epilepsy: a
    population-based cohort study. Plos One 2012;7(1):e30850
•   Stensballe et al Use of antibiotics during pregnancy increases the risk of asthma in early childhood. J Pediatr 2013;162:832.
•   Mårild et al. Antibiotic exposure in pregnancy and risk of coeliac disease in offspring: a cohort study. BMC Gastroenterology
    2014, 14:75
•Clôture des inscriptions :
                                                                                               18 octobre 2014
                                                                                          •Soumission des résumés :
https://colloque.inra.fr/sfdohadnantes2014                                                      30 juin 2014
Jeudi 6 novembre                                             Vendredi 7 novembre
9:15 – INTRODUCTION                                          8:00 - PROGRAMMATION et DEVELOPPEMENT
C JUNIEN (SF-DOHaD) et D DARMAUN (Nantes)                    COGNITIF
9:30 - PROGRAMMATION PRE-CONCEPTIONNELLE                     JL GUEANT : Programmation, folates, épigénétique
T FLEMING Preconception and long term impacts                N PROVENCAL The signature of maternal rearing in the
10:00 - Conférences courtes: 3X10 min                        methylome in rhesus macaque prefrontal cortex and T cells
11:20 - PROGRAMMATION DE LA FONCTION                         9:00 - Conférences courtes: 2X10 min
DIGESTIVE                                                    10:10 - PROGRAMMATION et CANCER
C MICHEL Le microbiote intestinal fait-il l’objet d’une      J CLAVEL : Oncologie pédiatrique, facteurs précoces de
empreinte ?                                                  risque de leucémie de l’enfant, tumeurs embryonnaires
11:50 - Conférences courtes: 3X10 min                        10:40 - Conférences courtes: 3X10 min
14:10 - REPRODUCTION : L’EPIGENETIQUE :                      11:30 - PROGRAMMATION et ENVIRONNEMENT
POURQUOI ET COMMENT:                                         A MAGNAN : Allergie respiratoire
MA SIRARD : Reproduction animale, Epigénétique,              12:00 - Conférences courtes: 2X10 min
Plateformes techniques et stratégies épigénétiques           14:00 - DOHAD et ECONOMIE : INTERVENTIONS
14:40 - RCIU PREMATURITE ET SANTE DE                         PRECOCES et RETOUR SUR INVESTISSEMENT
L’ADULTE                                                     G CONTI Economics, DOHaD and epigenetics
U SIMEONI Prématurité et restriction de croissance intra-    14:30 - 15:30 - DOHAD et SOCIETE TABLE RONDE
utérine: de la période périnatale aux conséquences à long    E RIAL-SEBBAG, C GUIBET LAFAYE,, C VERGELY
terme                                                        (Association de parents d’enfants malades ISIS, PARIS), C
15:10 - Conférences courtes: 3X10 min                        JUNIEN (SF DOHAD)
16:30 NUTRITION MATERNELLE et INFANTILE 1000                 15:30 - EFFETS TRANSGENERATIONNELS
jours                                                        J JIMENEZ CHILLARON : Epigenetics in
JC ROZE Nutrition des enfants prématurés et effets à moyen   transgenerational effects : more questions than answers ?
terme                                                        16:00 - Conférences courtes: 3X10 min
17:00 - Conférences courtes: 3X10 min                        16:50 - CONCLUSION
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