Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin

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Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin
Epidémiologie et anticipation
                 Réseau de surveillance

                                      Jennifer Pradel
                              Epidémiologiste vétérinaire
                 Animatrice et coordinatrice de CaribVET

  LES RENDEZ-VOUS DE LA RECHERCHE EN SANTÉ ANIMALE
                 INRA, DOMAINE DE DUCLOS, REVOSA
Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin
Des préoccupations communes

             1. Résistance des tiques aux acaricides

             2. Surveillance de la cowdriose et des
               maladies transmises par les tiques

             3. Cartographie des risques Influenza
                    Aviaire dans la Caraïbe
                                                      1
Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin
Génèse de l’étude des résistances
des tiques aux acaricides
Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin
Rhipicephalus (Boophilus) microplus

   « Tique créole »
Rhipicephalus, 1 hôte: 3 stades

« Tique sénégalaise »
Amblyomma, 1 hôte: 1 stade
                                                          3
Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin
L’échantillon

                                       © M. Hamon, CIRAD

                                     90% troupeaux en pâture
73
                                     89% race croisée EU X BR

38
                                         © M. Hamon, CIRAD

                                                                 4
     M. Hamon, thèse vétérinaire
Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin
© S. Depraz, CIRAD

                            © T. Hue, New caledonia      © S. Depraz, CIRAD

               Molécule 1
                                                 Ticks collection & survey 73 farms                LTT Test on 16 farms

     RR50 > 4       Resistant
                                                                                                                          5
L.Lovis et al., Veterinary Parasitology (2013)
Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin
Etude Martinique – résultats

                                 Suspicion de résistance

                                       Confirmée

                                       Non confirmée

                                       A investiguer

                                                           6
M. Hamon, thèse vétérinaire
Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin
Pas de solution miracle…
  mais une stratégie globale

  Lutte          Lutte
chimique     agronomique

         Lutte
       Génétique

                               7
Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin
•   Guide & formation sur le diagnostic      •   Sensibilisation, video, réunions
    de la résistance des tiques                  d’éleveurs

                                                                      S. Depraz,
                                                                      Epidémiologiste

       Laboratoires de
    diagnostic vétérinaire

•   Evaluation terrain de l’efficacité des
    acaricide – Protocoles & Registre        •   Poster Scientifique & Newsletters

Associations d’éleveur,
Instituts de recherche
 Services vétérinaires

                                                                                        8
Epidémiologie et anticipation - Réseau de surveillance Jennifer Pradel - Projet Malin
Des préoccupations communes

             1. Résistance des tiques aux acaricides

             2. Surveillance de la cowdriose et des
               maladies transmises par les tiques

             3. Cartographie des risques Influenza
                    Aviaire dans la Caraïbe
                                                      9
Le Réseau d’Epidémiosurveillance des Pathologies
    Nerveuses des Ruminants en Guadeloupe

                  2010 – 2015

                                                   10
11
Des préoccupations communes

             1. Résistance des tiques aux acaricides

             2. Surveillance de la cowdriose et des
               maladies transmises par les tiques

             3. Cartographie des risques Influenza
                    Aviaire dans la Caraïbe
                                                      12
Flambée épizootique en 2015 aux USA  Quel risque pour la Caraïbe?

                       ?

                                                                13
Couloirs de migration de l’avifaune
Rappels sur Influenza Aviaire            HA - 16 types “H1-H16”;
                                                       NA - 9 types “N1-N9”
  Une “Peste Aviaire”                                113 combinaisons possibles
  Potentiel zoonotique: grippe type A chez l’homme

D’après C. Oura (UWI, Trinidad et Tobago)
Plan régional de préparation à une émergence Influenza aviaire
                    Améliorer les capacités de détection précoce, réponse rapide
   Objectifs        Renforcer la préparation des pays
                    Renforcer la collaboration inter-sectorielle

                                                                               55 réunions virtuelles
 5 Aspects clefs préparation & réponse aux urgence
                                                                               4 Réunions région.

                                                                               4 workshop region.

  Biosec.          SIG, carto                     Labo &                       20 workshops nationaux
                                  Exercices      diagnost.     Communicati
Élevages de         risques,
                                 simulation                    on du risque
  volaille        Surveillance

Coordination

                    •   “CaribVET plateforme solide et essentielle malgré les financements
   Evaluation           limités, et a su réagir rapidement à une menace en evolution”
   Experts USDA     •   “Résultats représentent un renforcement significatif des outils
                        disponibles dans la region pour répondre à un risqué IAHP”        16        16
47 partenaires de 34 pays et territoires
Méthode intégrée

                                                            Identifier les facteurs de risque
                        Pour l’évaluation de l’introduction                           Pour l’évaluation de la diffusion

                                                        Qualifier l’importance des facteurs de risque
                            Pour la probabilité d’introduction                       Pour la probabilité de diffusion

                           Combiner les probabilités & mesures d’interventions en santé animale
                                                           Pour produire CARTE DE RISQUES

                                                   Optimiser les systèmes de surveillance
                                                   basé sur les cartes de risque

D’après C. Squarzoni et C. Coste (CIRAD, Montpellier)
Analyse qualitative du risque cartographique: améliorer la
                                                surveillance

       Mouvements animaux                                                   Analyse des réseaux SNA

         Surveillance basée sur
              les risques                               Analyse Spatiale
                                                                           Analyses de risque et
                                                                                                      19
D’après C. Squarzoni et C. Coste (CIRAD, Montpellier)                      facteurs de risque
Nov 205           Janv-Juin 2016              Sept 2016             Jun 2017

  SIG           Principes de                Risk mapping          Surveillance
 Basic          carto risques               niveau avancé      basée sur le risque

Formation des experts nationaux en SIG, cartographie des risques
Réunir et collecter les données
Organisation de discussion panels d’experts pour identifier
Les facteurs de risque
Analyser et discuter!

                          Lizmap, tutoriels video (Youtube)                          20
Quid de la Guadeloupe?
Travail en Cours… Master 2 GIMAT / Thèse vétérinaire – Manon Gatti

Analyse spatiale intégrée des risques
d’influenza aviaire dans les départements
français d’Amérique (DFA)
                                                  DAAF 971, 972 et 973

• Guadeloupe                                      Supervision/intervenants
                                                  - Jennifer Pradel
• Martinique                                      - Pachka Hammami
• Guyane Française                                - Cécile Squarzoni (Réunion)
                                                  - Caroline Coste (Montpellier)

           … Rapport de stage M2 – Juillet 2018                                    21
Merci de votre attention!

CIRAD ASTRE - CRVC team

CaribVET Working Group members

                                  Epigroup                          AD WG
  Lab WG         VPH WG                             SDWG
                                  & Comm.                           T&TBD

                                                                          22

CaribVET Chairs, and so many other contributors (Public, Research, Private…)

                                                                               22
23
34 «countries » = Services Vétérinaires
              6 Universités & Instituts de Recherche
    47
              5 Organisations Internationales
partenaires   2 Organisation politique (1) & inter-gouvernementale (1)

   Reconnaissance Caricom 2006 et signature par tous les CVO charte 2010 et 2012 (pour France signé par 3
    daaf + CVO français).
   Recommandation secrétariat au Cirad en Guadeloupe
   Statut légal de CaribVET en fin de validation par l’unité de coordination
CaribVET – Les récentes évolutions
• Un réseau élargit: 47 partenaires
   • 2 universités, 1 organisation (CAHFSA), 1 territoire (St Martin/St Barthélémy).
   • Renforcement de la recherche / interaction avec surveillance

• Des projets porteurs
   • Cartographie des risques IA (CIRAD / USDA) – SIG, carto, risques, mobilité animale
   • One health dans la région (ACP project, UWI) – 10 pays cariforum
   • Epigenesis (Regpot) – équipements et nouvelles compétences pour renforcer la
     recherche / surveillance (Flavivirus et West Nile)

• 2 évaluations successives sur activités et réseau 2016-2017

• Vers un secrétariat (en Guadeloupe) et un statut légal
   • Révision de la Charte – financement, ressources humaines, organisation
   • Principes du management par la qualité – transparence, amélioration continue, traçabilité
   • Ressources humaines: CIRAD et propres réseau (à créer)
26
Ex: 2015-2016 – Influenza aviaire

            REGIONAL STRATEGY, COORDINATION, EVALUATION & FOLLOW-UP

April 2015 and 2016 – Guadeloupe & Grenada   July 2015, Barbados
CaribVET Steering Committee Meetings         Regional Preparedness Workshop
Coordination Unit & Expert evaluation        CaribVET WG & Poultry Producers

                                                                               27
               KEY PARTNERS                           PROJECTS & FUNDING
Ex: 2015-2016 – Influenza aviaire

AI Field simulation, Haiti, May 2016      Biosec. Barbados, 2016   AGID Diagn. training, Jamaica, Sept2016

GIS Training, Tools & Risk Mapping                 HPAI Risk Mapping & Risk-based surveillance
  Belize, Nov 2015, (basic level)                         DR, Sept 2016, Advanced Level
                                                                                                 28
3/ Enquêtes régionales
Credit: J. pradel, CIRAD

      Ex: d’introduction
   Risque coqs de combat & de diffusion des virus IA - coqs de combat
        Coqs de combat: tradition dans plusieurs îles (legal, informel, illégal)
        Echanges de coqs et d’oiseaux sauvages entre les îles
        Mouvements non contrôlés
        Porteurs potentiels d’agents pathogènes
   Lien avec étude ethnographique, réseau informel de coqs de combats
   Etude du niveau de connaissance des services vétérinaires, évaluation
   du besoin d’information sur la filière
   Evaluation des connaissances sanitaires des acteurs de la filière

                                                                                   29
CommunicationEx1/ Informations &
      Recommandations sanitaires

Foyers de 06 à 09/12
Foyers de 01 à 02/13

                                         30
Evaluation qualitative du risque
              • OBJECTIFS                                                    • METHODE
                    1. Estimer les sources et la                          1. Probabilité d’introduction
                       probabilité d’introduction du        answer
                       visu par les animaux vivants

                  2. Identifier les zones dangereuses                     2. Probabilité d’exposition
                  pour la transmission et la persistence    answer        (diffusion)
                  du virus

                  3. Optimiser les systèmes de                            3. Consequences
                     surveillance et plans de contrôle       Justifient

                                                          Données disponibles (revue de la literature)
                                                          Revue bibliographique (enquête, cas)
                                                          Dires d’experts (panel)

D’après C. Squarzoni et C. Coste (CIRAD, Montpellier)
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