Le microbiote français - Projet Le French Gut, LIVRET DE PRÉSENTATION - INRAE
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N otre microbiote : ces milliers de microorganismes vivant en communautés complexes, avec qui nous sommes en symbiose depuis notre naissance. Près de 50 000 milliards de bactéries sont présentes dans nos intestins par exemple, ce qui représente environ 1kg par individu ! Ce microbiote intestinal, constitué principalement de bactéries, mais aussi d’archées, de champignons et de virus, joue un rôle décisif pour plusieurs fonctions vitales de notre corps. Les recherches récentes à ce sujet montrent bien à quel point la santé du microbiote influe sur la bonne santé d’un individu. Une piste prometteuse pour le développement d’approches innovantes en santé. Le microbiote est très variable d’un individu à l’autre, même chez les personnes en bonne santé. Donc pour comprendre plus finement les interactions microbiote, alimentation et santé il est capital d’accroître le nombre d’individus analysés, pour avoir une vision plus exhaustive de la population. Le projet Le French Gut, le microbiote français, initié par l’équipe MetaGenoPolis (MGP), basée en Île-de-France, est un projet porté par INRAE, en association étroite avec l’AP-HP et en collaboration et avec le soutien d’un consortium de membres du milieu médical, scientifique, et industriel. Le French Gut, s’inscrit dans un vaste projet international, le « Million Microbiome of Humans Project » (MMHP). Ce projet MMHP réunit plusieurs instituts de recherche à travers le monde (Karolinska Institute of Sweden, Shanghai National Clinical Research Center for Metabolic Diseases in China, University of Copenhagen, Denmark, Shenzhen BGI Research...), dont l’unité MetaGenoPolis d’INRAE pour représenter la France. L’objectif de MMHP ? Constituer la plus grande base de données mondiale de microbiotes humains avec un million d’échantillons microbiens provenant notamment des intestins, bouche, peau, appareil reproducteur. INRAE est l’un des membres fondateurs du projet MMHP et apportera 100 000 métagénomes intestinaux français grâce au projet Le French Gut. Cette banque permettra de caractériser les microbiotes de personnes en bonne santé selon l’âge, le genre, la taille, le poids, etc., pour définir des références, à l’image des analyses de sang. Le French Gut contribuera donc significativement à l’une des plus grandes bases de données du microbiote à l’échelle mondiale. Sa puissance statistique devrait permettre d’explorer le potentiel du microbiote intestinal pour prévenir et soigner de nombreuses maladies chroniques. 2
Le French Gut - c’est quoi ? Un projet de recherche ambitieux et unique en France Le French Gut est une contribution nationale • Modéliser et prévoir les changements du sur le microbiote. Son ambition ? Cartographier microbiote intestinal associés aux maladies. et comprendre l’hétérogénéité des microbiotes Les scientifiques étudieront le lien entre intestinaux sains français, les facteurs qui les microbiote intestinal et maladies chroniques impactent, ainsi que leurs déviations dans (diabète, obésité, cancer…), les troubles les maladies chroniques. D’ici 2027, les selles neurodéveloppementaux (autisme, bipo- de 100 000 volontaires ainsi que les données larité...) et les maladies neurodégénératives nutritionnelles et cliniques associées seront (notamment la maladie de Parkinson). recueillies. • Décrire les variations du microbiote intesti- Le projet inclut trois axes scientifiques : nal associées à la présence et au développe- • Cartographier le microbiote intestinal en ment de certaines maladies. Notamment le lien entre microbiote intestinal et désordres France, pour mieux définir la composition fonctionnels : syndrome de l’intestin irritable, des microbiotes intestinaux sains et appro- diabète, obésité, cancer, Parkinson, autisme, fondir les connaissances sur les liens entre bipolarité. microbiote, alimentation et mode de vie. Le French Gut - pour qui ? Penser la nutrition préventive et la médecine de demain Le French Gut permettra, à partir de la connais- du projet, réseaux sociaux dédiés, intervention sance scientifique générée, d’aller vers une des experts du projet dans les médias et nutrition préventive personnalisée. Il ouvrira organisation d’événements. également la voie à des diagnostics et des thé- Collectivités locales, mutuelles, pharmacies, rapies innovantes, notamment dans le contexte associations de patients, sociétés médicales des maladies chroniques en augmentation scientifiques… sont essentielles pour aider à constante et incontrôlée depuis trois généra- communiquer sur Le French Gut dans toutes tions. les régions de France, au plus près des Français. Il permettra aussi de sensibiliser le grand public, adultes et enfants, sur le microbiote et son lien avec la santé et l’alimentation. Comment devenir acteur du projet French Gut ? La participation est gratuite et ouverte à toute Les réseaux grand public : personne majeure volontaire résidant en France clé de la réussite métropolitaine (sous réserve d’éligibilité, actée Plusieurs canaux seront utilisés afin de cibler après l’analyse des résultats d’un questionnaire). toutes les tranches d’âges des habitants L’inscription se fait sur le site internet Le French résidant en France métropolitaine : site internet Gut. Le remplissage d’un questionnaire et en- 3
suite un don de selles seront requis pour partici- Toutes les données sont recueillies dans un per au projet. Le questionnaire, préparé par nos environnement sécurisé, certifié hébergeur de scientifiques et médecins experts, permet d’en données de santé. Les participants Le French savoir plus sur les habitudes alimentaires et la Gut auront accès à des résultats collectifs du santé des volontaires, et de faire le lien avec leur projet par des newsletters ainsi que l’opportuni- microbiote intestinal. Les données seront trai- té d’interagir avec des experts lors de webi- tées dans un environnement sécurisé et certifié naires dédiés. (voir démarches d’accréditation plus bas) pour l’hébergement des données personnelles. Il est aussi possible de soutenir le projet en participant au financement par un don sur Site internet Le French Gut : lefrenchgut.fr le site de la Microbiome foundation micro- biome-foundation.org/formulaire- de-don/ don-projet-french-gut/ INRAE et la Microbiome foundation sont engagés dans un partenariat pour accélérer la recherche sur le microbiote intestinal. La vidéo Le French Gut youtu.be/USLO6VXhQ5s 4
Le parcours du participant Sur le site Le French Gut, Répondez à un questionnaire le bouton Participer au projet de 10 minutes sur vos vous permet de vous inscrire habitudes alimentaires en quelques clics. Vous recevez et votre santé. ensuite vos identifiants de connexion par mail. Utilisez vos identifiants pour vous Vous recevez un kit de collecte connecter à l'espace participant. à domicile, avec sa notice Nous vérifions votre éligibilité au explicative qui vous guide à moyen d'un court questionnaire. chaque étape. Lisez attentivement la note d'information qui récapitule le projet Le French Gut et Une fois votre échantillon reçu le traitement des données et vérifié par le centre de collecte, collectées. Nous recueillons bienvenue, vous reioignez alors votre consentement. Le French Gut ! Vous restez libre de quitter le projet à tout moment ! 5
Le French Gut - par qui ? Un projet de recherche ambitieux et unique en France Le French Gut, est un projet mené en partena- Le consortium Le French Gut rassemble actuel- riat avec des institutions publiques et acteurs lement 4 institutions publiques (INRAE, AP-HP, privés, impliqués dans le domaine du micro- Inserm, AgroParisTech) et 10 partenaires privés. biote. Ce grand projet s’aligne avec le concept Le coût total du projet Le French Gut est actuel- One health, une seule santé, et s’inscrit dans lement estimé à environ 32 M€ sur 5 ans. l’un des objectifs stratégiques INRAE 2030 qui est de favoriser une approche globale de la santé. Intérêts scientifiques Intérêts industriels • Cartographier le microbiote intestinal français ; • Innover en matière de nutrition et de médecine • Comprendre sa composition chez des personnes personnalisée ; en bonne santé ; • Disposer de futurs prébiotiques en complé- • Étudier l’effet du régime alimentaire ; ments et/ou traitements d’intérêt ; • Décrire les changements du microbiote intesti- • Créer un effet de levier pour les industries im- nal liés à l’émergence des maladies ; plantées en France ; • Prédire à partir des variations microbiologiques • Donner un accès privilégié à un réseau d’experts l’apparition de certaines maladies et essayer de microbiote de renommée mondiale (KOL). les prévenir. Calendrier des étapes du projet : Démarrage phase pilote du projet : septembre 2022 Objectif à 2023 : 3 000 participants Objectif à 2027 : 100 000 participants INRAE, avec l’AP-HP, a initié toutes les démarches pour mener cette recherche conformément aux dispositions du Code de la santé publique pour les recherches impliquant la personne humaine. L’étude Le microbiote français - Le French Gut est enre- gistrée auprès de l’ANSM sous le numéro IDRCB- 2021-A01439-32. Le dossier pour la phase pilote de 3 000 participants a reçu un avis favorable du CPP Sud Est IV (n° 21.00225.000006). Une fois la phase pilote bien avancée, une nouvelle demande permettra de lancer la phase de recrutement des 100 000 partici- pants. Un avis favorable de la Commission nationale de l’informatique et des libertés (CNIL) a également été reçu (n° DR-2022-141). 6
Des établissements français de ses implications pour la santé et la nutrition est largement reconnue dans la communauté qui allient leurs forces scientifique internationale depuis 2010. Depuis INRAE, l’Institut national de recherche pour sa création en 2012, MetaGenoPolis a collaboré l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, sur 236 projets de recherche dont 154 projets en est un acteur majeur de la recherche et de partenariat avec les industriels. l’innovation créé le 1er janvier 2020. Institut de MGP a pour missions principales : recherche finalisée issu de la fusion entre l’Inra et l’Irstea, INRAE rassemble une communauté • d’accélérer la science du microbiote en France et l’innovation dans le domaine de la de 12 000 personnes, avec 273 unités de re- santé et de l’alimentation ; cherche, service et expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France. L’institut se • de proposer des technologies performantes positionne parmi les tout premiers organismes et à haut débit pour analyser la diversité des de recherche au monde en sciences agricoles microbiotes complexes et les interactions et alimentaires, en sciences du végétal et de entre les bactéries intestinales et les cellules l’animal, et en écologie-environnement. Il est humaines ; le premier organisme de recherche mondial • de collaborer avec les acteurs industriels spécialisé sur l’ensemble « agriculture-alimen- pour la transformation de leurs découvertes tation-environnement ». INRAE a pour ambition en produits et services liés à la santé, pour d’être un acteur clé des transitions nécessaires identifier et traiter pleinement les pistes vers pour répondre aux grands enjeux mondiaux. de futures applications industrielles, pour Face à l’augmentation de la population, aider à concevoir et conduire des projets au changement climatique, à la raréfaction scientifiques vers des applications. des ressources et au déclin de la biodiversi- Site internet MetaGenoPolis : www.mgps.eu té, l’institut construit des solutions pour des agricultures multiperformantes, une alimen- tation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes. www.inrae.fr L’infrastructure MetaGenoPolis / INRAE L’AP-HP MetaGenoPolis (MGP), une des 273 unités de L’AP-HP (Assistance publique-Hôpitaux de recherche d’INRAE, est experte en recherche Paris), premier promoteur d’essai clinique en sur le microbiote intestinal appliquée à la santé Europe, apporte son soutien et son expertise et à la nutrition humaine et animale, pour méthodologique, réglementaire et logistique accélérer la science et l’innovation. Financée en matière de conduite de recherche en santé par le Programme des investissements d’avenir à INRAE, promoteur de Le French Gut. (lauréat 2012 et 2019), MGP a été coordinateur Le professeur Robert Benamouzig chef de deux grands projets qui ont permis de faire du service de gastro-entérologie et oncologie avancer la science du microbiote : le projet digestive de l’hôpital Avicenne AP-HP est l’in- MetaHIT qui publie le premier catalogue de vestigateur coordinateur du projet gènes microbiens intestinaux humains et le Le French Gut. projet IHMS pour aider à normaliser l’analyse de l’ADN microbien. L’excellence scientifique de Premier centre hospitalier et universitaire MGP dans l’analyse du microbiote intestinal et (CHU) d’Europe, l’AP-HP et ses 38 hôpitaux sont 7
organisés en 6 groupements hospitalo-univer- Ses cliniciens chercheurs signent chaque année sitaires (AP-HP. Centre - Université Paris Cité ; plus de 10 000 publications scientifiques et plus AP-HP. Sorbonne Université ; AP-HP. Nord - Uni- de 4 000 projets de recherche sont aujourd’hui versité Paris Cité ; AP-HP. Université Paris Saclay ; en cours de développement, tous promoteurs AP-HP. Hôpitaux Universitaires Henri Mondor confondus. L’AP-HP a obtenu en 2020 le label et AP-HP. Hôpitaux Universitaires Paris Seine- Institut Carnot, qui récompense la qualité de Saint-Denis) et s’articulent autour de 5 univer- la recherche partenariale : le Carnot@AP-HP sités franciliennes. Étroitement liée aux grands propose aux acteurs industriels des solutions organismes de recherche, l’AP-HP compte en recherche appliquée et clinique dans le 4 instituts hospitalo-universitaires d’envergure domaine de la santé. L’AP-HP a également créé mondiale (ICM, ICAN, IMAGINE, FOReSIGHT) en 2015 la Fondation de l’AP-HP qui agit en lien et le plus grand entrepôt de données de santé direct avec les soignants afin de soutenir l’orga- (EDS) français. Acteur majeur de la recherche nisation des soins, le personnel hospitalier et la appliquée et de l’innovation en santé, l’AP-HP recherche au sein de l’AP-HP. détient un portefeuille de 650 brevets actifs. www.aphp.fr Les scientifiques impliqués Dr Joël Doré, Directeur scientifique du projet Le French Gut Le Dr. Joël Doré, agronome de formation, travaille sur le microbiote intestinal et la santé depuis le début de sa carrière de chercheur. Il est directeur de recherche à l’Institut national de la recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) au sein des unités Micalis et MetaGenoPolis. Il est également le directeur scientifique du laboratoire INRAE MetaGenoPolis (MGP) qui étudie l’impact de l’alimentation sur le microbiote intestinal (humain et animal), et l’impact de ce dernier sur la santé et la maladie. Joël Doré coordonne d’ambitieux projets comme le projet ERC-advanced Homo symbiosus d’une durée de 5 ans et d’un montant de 2,5 millions euros. Pr Robert Benamouzig, Médecin investigateur du projet Le French Gut Le Pr. Robert Benamouzig est le chef du service de gastro-entérologie et oncologie digestive de l’hôpital d’Avicenne AP-HP à Bobigny. Il est également responsable du Centre de recherche en nutrition humaine d’Île-de-France et enseignant à l’université Sorbonne Paris Nord. Le Pr. Robert Benamouzig est spécialiste des organes du tube digestif : œsophage, estomac, intestin, voies biliaires et pancréas. Il est très impliqué dans la recherche et est notamment coordinateur de l’étude AAS Lynch, essai clinique multicentrique national de phase 3, mené dans une quarantaine d’établissements français. Il vise à recruter 852 patients âgés de 18 à 75 ans atteints du syndrome de Lynch pour étudier l’efficacité de l’aspirine à faible dose dans la prévention de l’apparition ou des récidives d’adénomes colorectaux. 8
Partenaires de l’Université Paris-Saclay et pour vocation l’étude de toutes les membre fondateur de ParisTech et maladies, des plus fréquentes aux publics Agreenium. plus rares. De nombreuses études pointent www.agroparistech.fr le microbiome comme élément « Au regard de la santé humaine, essentiel associé à la santé ou à des pathologies, ce qui a notamment les enseignements portés par AgroParisTech est l’institut national justifié le lancement en 2016 par AgroParisTech et les recherches des sciences et industries du vivant l’Inserm d’un programme scien- qui y sont menées s’intéressent à et de l’environnement, sous tutelle tifique interne dédié. Pour établir l’impact de l’alimentation et de du ministère de l’Agriculture et de ces associations, les cohortes repré- l’environnement sur la santé des la Souveraineté alimentaire. Acteur sentent une ressource essentielle. individus, ainsi qu’aux applica- de l’enseignement supérieur et de Ainsi dans son rôle clé de pilote de tions des technologies et des la recherche, ce grand établisse- l’entité « France Cohortes », l’Inserm biotechnologies en relation avec ment de référence au plan interna- a soutenu le développement de la santé. Acteur des transitions, tional s’adresse aux grands enjeux compétences en data science, notre établissement dispose d’une du 21e siècle : nourrir les hommes en en expertise juridique et régle- réelle expertise sur l’impact de la gérant durablement les territoires, mentaire indispensables au bon transition protéique sur la santé préserver les ressources naturelles, fonctionnement de cohortes et à humaine et sur le microbiote favoriser les innovations et intégrer la standardisation des données de intestinal. Il était donc naturel de la bioéconomie. santé produites. rejoindre le consortium Le French En s’appuyant sur la recherche et C’est par son apport dans ces Gut qui vise à approfondir les sur ses liens étroits avec les milieux métiers spécifiques que l’Inserm connaissances sur les liens entre professionnels, l’établissement contribue au projet ambitieux Le microbiote, alimentation et mode forme des cadres, ingénieurs, doc- French Gut : savoir collecter, stocker, de vie. » Laurent Buisson, directeur teurs et décideurs, dans le domaine structurer, harmoniser et analyser général d’AgroParisTech du vivant et de l’environnement, en les données et les échantillons déployant un cursus ingénieur, une biologiques est crucial pour le dé- offre de master et une formation ploiement de ce projet dont la mise doctorale en partenariat avec de en œuvre se fera dans le cadre d’un grandes universités françaises et programme de recherche national étrangères, ainsi qu’une gamme de copiloté par l’Inserm et INRAE. formation professionnelle continue À terme les collaborations entre les sous la marque « AgroParisTech équipes de French Gut et France Executive ». Implantée sur 8 sites en Cohortes contribueront à une France métropolitaine et Outre- Créé en 1964, l’Institut national de meilleure compréhension des inte- mer, AgroParisTech développe une la santé et de la recherche médi- ractions entre le microbiome et son stratégie d’alliances au niveau ter- cale (Inserm) est un établissement hôte, et à proposer des opportuni- ritorial par le biais de partenariats public à caractère scientifique tés d’interventions préventives ou étroits avec les universités locales et technologique, placé sous la thérapeutiques en santé humaine. et leurs initiatives d’excellence. double tutelle du ministère de lʼEnseignement supérieur, de la www.inserm.fr L’établissement se structure en 22 unités de recherche dont une unité Recherche et de lʼInnovation et de recherche et développement, du ministère des Solidarités et de une ferme expérimentale, une halle la Santé. L’Inserm est le seul orga- technologique, quatre tiers-lieux nisme public français dédié à la ouverts dits « InnLab » et compte recherche biologique, médicale et plus de 3000 étudiants et 280 à la santé humaine. Il se positionne enseignants, chercheurs et ensei- sur l’ensemble du parcours allant gnants-chercheurs. AgroParisTech du laboratoire de recherche au est une grande école composante lit du patient. Ses chercheurs ont 9
Partenaires sur les 5 continents, unis par des valeurs pasteuriennes communes, Erik Eckhardt, directeur Recherche et Développement Adare Biome privés qui contribuent à l’amélioration de la santé humaine. Les équipes de l’Institut Pasteur partageront leurs expertises en microbiologie, en infectiologie et Fondation reconnue d’utilité en immunologie des muqueuses publique, créée par décret en afin de mieux comprendre le rôle Biocodex est une société pharma- 1887 à l’initiative de Louis Pasteur, des différents types de microbiotes ceutique française familiale dont le l’Institut Pasteur est aujourd’hui un sur la santé des porteurs. siège se situe en région parisienne. centre de recherche biomédicale La société a été fondée en 1953 de renommée internationale. Pour www.pasteur.fr autour du développement et de la mener sa mission dédiée à la lutte commercialisation de la première contre les maladies, en France et souche de levure probiotique dans le monde, l’Institut Pasteur médicament au monde, Saccha- développe ses activités dans romyces boulardii CNCM I-745, quatre domaines : recherche, santé découverte en 1923. Depuis, publique, formation et dévelop- Biocodex est passé de pionnier à pement des applications de la acteur international majeur dans le recherche. Leader mondial recon- domaine des microbiotes. Par nu dans le domaine des maladies Adare Biome est une division ailleurs, le centre de R&D Biocodex infectieuses, de la microbiologie et d’Adare Pharma Solutions, un a concentré ses activités de de l’immunologie, l’Institut Pasteur CDMO global axé sur la techno- recherche sur le système nerveux se consacre à l’étude de la biologie logie. Adare Biome est basé à central et développé un médica- du vivant. Ses travaux portent Houdan sur un site pharmaceu- ment antiépileptique orphelin, ainsi sur les maladies infectieuses tique GMP dédié à la fermentation Diacomit®. Fin 2019, Biocodex a émergentes, la résistance aux microbienne. poursuivi sa diversification avec antimicrobiens, certains cancers, En tant que pionnier des postbio- l’acquisition des laboratoires Iprad, les maladies neurodégénératives et tiques, Adare Biome révolutionne spécialisés dans la santé de la les pathologies de la connectivité la santé en offrant des solutions femme. cérébrale. Pour renforcer l’excel- postbiotiques de haute qualité à Biocodex se développe ainsi autour lence de ses recherches, l’Institut travers sa plateforme technolo- de trois piliers : Pasteur dispose et développe un gique microbienne. • les microbiotes, pour sensibi- environnement technologique liser le grand public ainsi que adarebiome.com de très haut niveau, comme en les professionnels de santé à nano-imagerie ou en biologie « En tant que pionnier des l’importance du microbiote ; faire computationnelle et intelligence postbiotiques et fournisseur de progresser la découverte scienti- artificielle. Depuis sa création, solutions pour la santé digestive fique sur le microbiote en finan- 10 chercheurs travaillant au sein tel que Lactéol, Adare Biome est çant la recherche universitaire ; de l’Institut Pasteur ont reçu le prix enthousiaste de participer au pro- fournir des solutions préservant Nobel de médecine, les derniers en jet French Gut. Cet immense projet l’équilibre du microbiote avec le 2008 à titre de reconnaissance de va mettre en lumière le rôle du médicament probiotique unique leur découverte en 1983 du virus de microbiote intestinal dans la santé Saccharomyces boulardii CNCM l’immunodéficience humaine (VIH) humaine et nous permettra de I-745, innover avec la gamme responsable du sida. développer de nouvelles solutions Symbiosys et investir très tôt dans Depuis le 1er juillet 2021, l’Institut nutritionnelles afin de renforcer le les entreprises en développe- Pasteur est un organisme de microbiote. Nous sommes heureux ment ; recherche partenaire d’Université Paris Cité. et fiers de prendre part à cette • les maladies orphelines, au aventure et sommes impatients service des patients atteints de L’Institut Pasteur est un des d’échanger avec les scientifiques pathologies orphelines graves. membres du Pasteur Network, un issus du monde universitaire et les Diacomit® est indiqué dans réseau mondial de 33 membres partenaires industriel. » le traitement du syndrome de 10
Dravet, une forme d’épilepsie de Depuis 20 ans, Biofortis apporte microbiome. » Benoit Fouchaq, l’enfant rare et très sévère ; son expertise scientifique, régle- président et Françoise Le Vacon, • la santé de la femme avec la mentaire et clinique aux indus- chief scientific officer marque Saforelle, dédiée aux tries du secteur agroalimentaire, femmes de tous âges. biotechnologique, pharmaceutique et les académiques dans leurs www.biocodex.fr projets d’innovation. Forte de ses « Depuis sa création, Biocodex se 90 collaborateurs, l’équipe présente à son actif plus de 500 projets, 250 consacre à la recherche sur les mi- essais cliniques gérés full service en crobiotes et les probiotiques. Nous France, en Europe et à l’interna- avons à cœur de faciliter l’accès à tional. la recherche, repousser les limites Du schéma de l’étude au rendu du de nos connaissances, favoriser Danone Nutricia Research est rapport d’analyse, Biofortis assure la diffusion de celles-ci auprès l’organisation mondiale de la gestion complète des essais des professionnels de santé et recherche et d’innovation de cliniques sur des études mono- du grand public. C’est pourquoi, Danone. Nos 2 principaux centres ou multicentriques pour évaluer en 2016, nous créons la Biocodex de R&I sont situés à Paris-Saclay l’efficacité, la sécurité et la tolérance Microbiota Foundation et le (France) et Utrecht (Pays-Bas), avec des produits dans le secteur de la Biocodex Microbiota Institute. d’autres équipes de recherche nutrition. Notre participation à l’élabora- situées dans le monde entier. Pionnier dans l’analyse du micro- tion de la métabase de données Nous sommes représentés par des biome, Biofortis accélère les projets générée par le projet Le French scientifiques, des nutritionnistes, de développement grâce à des Gut constitue une opportunité des technologues de produits et de experts et des outils performants : exceptionnelle sur le plan R&D. nombreux autres spécialistes. Chez de la fabrication de kits, de la Celle-ci nous aidera à identifier Danone, nous sommes convaincus collecte de selles, de la logistique, de nouveaux biomarqueurs, à éla- que l’alimentation joue un rôle du séquençage haut débit ou de borer des outils diagnostiques et essentiel pour la santé tout au long l’analyse métagénomique jusqu’à à proposer demain des solutions de la vie. l’analyse des données. Cette plate- thérapeutiques par approche forme microbiome associée à un www.danone.com personnalisée. Le partenariat avec laboratoire central de biologie ana- le projet Le French Gut est pour lyse plus 360 paramètres dont des « Le microbiome intestinal est au nous une évidence et un aboutis- cœur de l’histoire de Danone, qui a biomarqueurs de l’hôte associés au sement. Il s’inscrit dans la droite été fondé il y a un peu plus de 100 microbiome. ligne de ce qui anime nos équipes ans sur ce concept révolutionnaire Biofortis bénéficie également depuis de nombreuses années : de l’époque : les aliments fermen- d’une force interne Bio-IT et Data mettre la science au service de tés et les bactéries bénéfiques Sciences dédiée aux projets d’ana- nos patients. » Marie-Emmanuelle qu’ils contenaient pouvaient cibler lyse de données multivariés avec Le Guern , vice-présidente R&D l’intestin pour apporter la santé à une approche innovante d’intelli- Biocodex tous. Être membre du consortium gence artificielle. Le French Gut s’inscrit dans la www.biofortis.fr continuité de notre stratégie de « Pionnier dans l’étude du mi- recherche visant à mieux identifier les interactions entre la santé crobiote intestinal depuis 15 ans, humaine et le microbiome intes- nous soutenons et participons tinal par le biais de l’alimentation. activement depuis sa genèse à ce Comprendre de telles interactions projet national sans précédent. est une étape importante vers Les données collectées vont per- le développement futur d’une Biofortis, CRO full service unique, mettre de connaître le microbiote alimentation plus personnalisée, conduit des essais cliniques en de la population française. Ces et de probiotiques et prébiotiques nutrition, propose des études sur le nouvelles connaissances vont de précision. » microbiome et assure l’analyse des définir des référentiels pertinents Raish Oozeer, directeur Danone données pour la santé humaine et pour les études cliniques que nous Nutricia Research animale. conduisons avec investigation du 11
avec un éventail de solutions de marque, des conseils scientifiques, des études cliniques et bien plus encore. Nous explorons inlassablement le GMT Science rend l’évaluation du Les microorganismes sont des potentiel de la biotransformation microbiote intestinal disponible au vecteurs d’évolution invisibles, microbienne, une ressource de laboratoire de biologie médicale, facilitant notre mobilité, nous transformation inexploitée, dans afin d’offrir au médecin des aidant à nous protéger des le but de proposer des solutions analyses de routine robustes et maladies et à nous adapter à un naturelles, durables et efficaces. fiables, aux standards de la biologie environnement en constante Chez Gnosis, nous utilisons le vivant médicale, qui lui permettent de évolution. Chez Gnosis by Lesaffre, au service de la prospérité de notre tenir compte de l’état du micro- les microorganismes font partie planète et de ses habitants. biote intestinal dans la prise en intégrante de nos effectifs. charge clinique de ses patients. Nous mettons à profit leur pouvoir gnosisbylesaffre.com GMT Science est une jeune de biotransformation comme entreprise innovante française, la fermentation, pour dévelop- « Pour Gnosis by Lesaffre, les probiotiques, qu’ils soient levures experte de l’analyse des métagé- per des actifs nutritionnels, des ou bactéries, sont un pilier des nomes microbiens grâce à ses probiotiques, ainsi que des levures solutions pour la santé et la nu- outils bioinformatiques et nutritionnelles qui contribuent trition humaine. En se dotant ces biostatistiques, et à ses bases de à apporter des bénéfices pour dernières années d’équipements données propriétaires. Les la santé et le bien-être des êtres comme les simulateurs gastro- solutions développées par GMT humains. Nous nous efforçons de intestinaux TIM et SHIME, le Science pour la mesure de la créer un monde qui bouge mieux, Groupe Lesaffre a placé l’étude du richesse du microbiote intestinal, digère mieux, vieillit mieux, se microbiote intestinal au cœur de des espèces qui le composent et sent mieux et, in fine, vit mieux ses activités de recherche et dé- de ses capacités fonctionnelles, grâce aux microorganismes et à la veloppement. Le projet Le French sont marquées CE comme biotransformation. Gut est ainsi une opportunité pour dispositifs médicaux de diagnostic Nous nous appuyons sur nos exper- Gnosis by Lesaffre de renforcer son in vitro. La R&D de GMT Science est tises en recherche et application, engagement sur ce thème en ap- d’une part consacrée à la sur des normes réglementaires et portant son soutien à la recherche stratification de ces mesures au de qualités strictes, ainsi que sur fondamentale menée par des sein de la population générale, et des procédures robustes de valida- experts de renommée mondiale d’autre part à l’identification de tion clinique, pour concevoir des autour de ce microbiote intestinal, signatures microbiomiques solutions efficaces destinées aux sa diversité, et les facteurs qui associées à certaines situations marchés du bien-être et de la santé l’influencent. Gnosis by Lesaffre pathologiques, et à leur développe- immunitaire, de la digestion et de confirme ainsi son engagement ment en analyses de biologie la santé intestinale, de la mobilité pour une meilleure compréhen- médicale spécifiques. et de la santé des articulations, sion du fonctionnement du micro- de la reproduction et de la santé gmt.bio biote intestinal au sein du corps féminine, ainsi que de l’humeur et humain. » Dr Bertrand Rodriguez, « Afin de développer des outils de la santé cognitive. Nos procédés Biotic innovation team leader, d’analyse du microbiote perfor- sont reproductibles, fiables et soi- gneusement étudiés, de manière Gnosis by Lesaffre mants, à usage médical, GMT Science doit s’appuyer sur des pro- à préserver une uniformité et une fils métagénomiques de grande qualité inégalées de nos produc- qualité technique, associés à des tions industrielles. métadonnées précises. Participer Nous collaborons avec des au projet Le French Gut permettra marques nutraceutiques et phar- à GMT Science d’avoir accès à de maceutiques afin de mettre au telles données et ainsi d’accélé- point des produits qui changent rer considérablement sa R&D. » la donne et sont bénéfiques pour Pionnier de la biotechnologie Étienne Formstecher, CEO, GMT leurs clients. Nous instaurons végétale à sa création en 1992, Science de véritables partenariats avec GREENTECH développe et produit nos clients, les accompagnant pour la cosmétique, la pharmacie 12
et la nutraceutique des ingrédients probiotiques, prêtes à être « Décrire et comprendre le rôle de haute technologie, issus des commercialisées ou personnalisées, clé des microorganismes sur la mécanismes profonds des plantes, ciblent des populations et des santé est au cœur de l’ADN de algues, micro-algues et micro-or- segments santé spécifiques, Lallemand health solutions, et ganismes sourcés dans le monde notamment la santé intestinale, c’est avec ce même élan que nous entier. les défenses naturelles, la santé avons rejoint ce projet citoyen À la croisée des mondes, mentale, la santé des femmes, la ambitieux de cartographies des GREENTECH est en perpétuel santé de la peau, la santé bucco- microbiotes intestinaux des Fran- mouvement : du cœur de la plante dentaire, le sport et le métabolisme. çais. Cette nouvelle « encyclopé- au cœur de la peau, d’une science Les probiotiques sont fabriqués die » ouvrira un champ immense à l’autre, de la terre à la mer, et d’un dans des usines de pointe certifiées de perspectives d’explorations du continent à l’autre, elle produit par les plus hauts standards de potentiel du microbiote pour aider grâce à ses technologies de pointe qualité dans ce domaine. la recherche internationale sur des des actifs cosmétiques mimant les Plus de 600 formules probiotiques nouvelles solutions santé. » mécanismes profonds de la nature produites par LHS pour ses clients Sylvie Binda, vice-présidente R&D pour les appliquer à ceux de la sont actuellement commercialisées Lallemand health solutions peau, et les réguler efficacement. dans plus de 60 pays à travers Les résultats se lisent en surface, la les 5 continents. peau est visiblement plus belle. LHS possède le contrôle et l’expertise pour produire des www.greentech.fr solutions probiotiques haut de « Une belle initiative que la gamme, des mélanges et des constitution du projet Le French formulations personnalisées. Gut pour que la France rayonne En effet, chaque étape du mondialement dans les applica- développement d’un produit, tions industrielles et médicales du laboratoire jusqu’aux points Fondée en 2019 par Chrystèle et de la science du microbiote. La de vente, est soutenue par des Pierre Cressard, Nahibu est une connaissance du microbiote et de équipes internes expérimentées société française experte dans ses interactions avec la physiolo- en assurance qualité, affaires l’analyse du microbiote intestinal. gie animale permettra de grandes réglementaires, recherche Nahibu propose un kit d’analyse du avancées dans le domaine de la et développement, affaires microbiote à destination du grand santé animale. Les résultats des scientifiques, support technique, public, disponible en ligne sur travaux du projet Le French Gut ainsi que ventes et marketing. www.nahibu.com mais également devraient permettre une ouver- L’Institut Rosell® pour le dans certains points de vente en ture du carcan réglementaire et, microbiome et les probiotiques, France et à l’étranger. L’analyse du par la suite, un développement qui est le centre de recherche microbiote intestinal proposée par de solutions thérapeutiques et développement de LHS, se Nahibu répond aux plus hautes salvatrices pour de nombreux pa- spécialise, entre autres, dans la exigences de qualité et aux tients en souffrance. » Jean-Yves recherche sur le microbiome standards internationaux de Berthon, CEO GREENTECH SA humain et le rôle clé des métagénomiques (IHMS). Les compléments probiotiques résultats de cartographie et de sur la santé en travaillant en potentiels fonctionnels du collaboration avec un large microbiote sont accompagnés de réseau d’institutions et d’experts conseils alimentaires personnalisés, reconnus internationalement. Ces disponibles en ligne sur une 20 dernières années, les souches application pensée pour vulgariser probiotiques de Lallemand health la compréhension de notre second Lallemand Health Solutions (LHS) solutions ont été étudiées dans cerveau. Au-delà du test du est un fabricant de probiotiques plus de 160 études cliniques et microbiote, Nahibu offre égale- intégré verticalement et spécialisé études précliniques ayant mené ment la possibilité à ses utilisateurs dans la recherche, le développe- à la publication de plus de 330 de poursuivre leur parcours par ment, la production et la commer- articles scientifiques. une consultation diététique avec cialisation de levures et bactéries l’un de ses 500 affiliés profession- lallemand-health-solutions.com/fr probiotiques. Ses formulations nels de santé, formés au microbiote 13
intestinal. En 2022, Nahibu utilise issus d’univers aussi variés que l’avenir de la santé humaine. Notre son expertise du microbiote l’industrie, la médecine ou la mission est d’identifier les meilleurs intestinal pour lancer Baiotiku, sa recherche, concrétise notre projets de recherche et de les trans- propre marque de probiotiques. engagement au service de la former en entreprises de biotech- Nahibu contribue par son expertise science et du progrès. » nologie qui apporteront des à faire progresser la science du Pierre Cressard, président de solutions de santé innovantes sur le microbiote à travers son engage- Nahibu marché. Notre ambition est de ment scientifique ainsi que contribuer à l’émergence de plusieurs études cliniques en cours, champions mondiaux dans chaque notamment sur les liens entre la segment thérapeutique pour performance sportive et le lequel la santé par le microbiome microbiote intestinal. fait sens. www.nahibu.com www.nexbiome.com « Nous sommes immensément Nexbiome Therapeutics est le « En tant que premier incuba- fiers de contribuer à l’initiative premier incubateur privé teur privé du microbiote théra- de Le French Gut. S’associer à Le d’entreprises de biotechnologie du peutique, Nexbiome ne pouvait French Gut, c’est faire progresser microbiome. Nous définissons le faire autrement que de rejoindre la connaissance du microbiote microbiome comme un écosys- Le French Gut, pour soutenir intestinal, et ainsi, découvrir de tème de microorganismes dont la la recherche française dans ce nouveaux territoires dans la composition prédispose à la santé domaine et contribuer à créer des nutrition, le bien-être et la santé. ou à la maladie. Par conséquent, biotechs leaders mondiales dans nous sommes convaincus que le La perspective de faire avancer ce domaine. » la recherche de façon concrète, microbiome représente le réservoir Stanislas Desjonquères, CEO aux côtés d’illustres partenaires de solutions thérapeutiques pour 14
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