RAPPORT D'ACTIVITés 2011 - Poitou-Charentes INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE - INRA
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INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE
Centre de Poitou-Charentes • Le Chêne • RD 150 • BP 80006 • 8
Tél : 05 49 55 60 00 • Fax : 05 49 55 60 03
Poitou-Charentes
www.poitou-charentes.inra.fr
RAPPORT D’ACTIVITés 2011
Chiffres clés
1 unité 8 unités 240 agents
de recherche expérimentales permanents
19,7 M€
1 unité 4 implantations
de budget
sous contrat en Poitou-
dont 2,4 M€
Inra/CNRS Charentes
de partenariat
9 projets
10 projets
soutenus par
soutenus
le Casdar
par l’Agence
du Ministère
nationale de
chargé de
la recherche
l’agriculture
11 projets
de recherche
européens
Sommaire
éditorial de Jean-Marc Chabosseau 2
1. L’Inra en Poitou-Charentes 3
Les femmes et les hommes 5
Les moyens financiers 7
L’organisation et les structures 11
Les démarches transversales 14
2. Résultats scientifiques marquants 15
• Gestion durable des prairies, systèmes fourragers et territoires 16
Concevoir des prairies productives et bénéfiques à l’environnement 16
Concevoir et évaluer des systèmes fourragers durables 21
Gérer durablement les territoires et préserver la biodiversité 25
• Gestion durable des productions animales 33
Concevoir et évaluer des systèmes d’élevage alternatifs durables 33
Contribuer à une production porcine durable par la sélection génétique 34
Concevoir des méthodes alternatives de reproduction caprine 36
3. Partenariat 37
Groupe d’étude et contrôle des variétés et des semences 38
Plateforme Ibisa de chirurgie préclinique 42
Pôle d’excellence rural 44
4. Partage des connaissances 45
Diffusion des connaissances vers le monde agricole et l’enseignement 46
Rencontres avec le grand public 49
Publications scientifiques 50
n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n 1
éditorial
Les orientations de l’Inra pour la décennie 2010-2020 visent à renouveler les savoirs
et les pratiques pour des systèmes agricoles et alimentaires durables. Il s’agit de
produire plus et mieux, pour l’alimentation ou d’autres usages, en respectant
l’environnement ; de contribuer à la gestion des territoires ; de promouvoir une
alimentation saine et de s’adapter aux changements globaux.
Dans cette perspective, en 2011 l’institut a signé un contrat d’objectifs avec ses tutelles,
les ministères chargés de l’Enseignement supérieur et de l’Agriculture, l’engageant
pour les cinq prochaines années. Au niveau du centre Poitou-Charentes, une réflexion
a été amorcée pour établir un schéma stratégique pluriannuel à l’horizon 2012.
En parallèle de cette activité de programmation, l’activité de recherche et
d’expérimentation s’est poursuivie avec quelques succès. Au niveau européen
notamment, les équipes du centre ont développé les projets Expeer qui regroupe
les infrastructures dédiées à l’étude des relations agriculture-environnement, et
Flockreprod qui concerne des recherches en reproduction caprine et leur transfert
vers les opérateurs du secteur dans différents pays de l’union.
La prise en compte du changement climatique a infléchi nos orientations de recherche
avec notamment la mise en place du projet Climagie et l’organisation de notre colloque
annuel sur le sujet, en collaboration avec la Chambre régionale d’agriculture.
Ce ne sont là que quelques facettes des activités que nous menons pour produire des
connaissances dont la finalité est de contribuer aux besoins de la société et de la
profession agricole. Je vous invite à les découvrir dans cet ouvrage.
Bonne lecture.
Jean-Marc Chabosseau
Président du Centre Inra Poitou-Charentes
2 n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n
1 L’Inra
en Poitou-Charentes
Les femmes et les hommes
Les moyens financiers
L’organisation et les structures
Les démarches transversales
p5
p7
p 11
p 14
n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n 3
Le centre Inra Poitou-Charentes est l’un des 19 centres de recherche régionaux de l’Inra.
Il compte onze unités : huit unités Inra, une unité sous contrat Inra/CNRS et deux
unités du Groupement d’intérêt public Geves (Groupe d’étude et de contrôle des
variétés et des semences).
n Unités du centre Inra
Poitou-Charentes Quatre agents
de l’Inra
•U nité de recherche pluridisciplinaire Prairies et plantes
travaillent
fourragères (URP3F)
dans l’équipe
• Unité sous contrat Inra /CNRS Agripop
Agripop à Chizé
• Unité expérimentale Fourrages et environnement (UEFE)
• Unité expérimentale de Saint Laurent-de-la-Prée (UESLP)
• Unité expérimentale d’Entomologie
•U nité expérimentale Elevage alternatif et santé des Deux thématiques scientifiques
n
monogastriques (UE EASM) et des plateformes expérimentales
•U nité expérimentale Génétique et expérimentations en d’excellence
productions animales (UE Gepa)
•U nité expérimentale Insémination caprine et porcine En Poitou-Charentes, les recherches de l’Inra se concentrent
(UEICP) sur deux thématiques : la gestion durable des prairies,
•U nité expérimentale du Groupe d’étude et de contrôle des systèmes fourragers et territoires, et la gestion durable
variétés et des semences (Geves) des productions animales.
• Laboratoire BioGeves
• Services déconcentrés d’appui à la recherche (Sdar) Le centre gère des plateformes expérimentales d’excellence,
ouvertes aux partenaires scientifiques et agricoles : une pla-
n 4 implantations teforme d’élevage alternatif de volailles, un Système d’obser-
vation et d’expérimentation pour la recherche en environ-
Les quatre sites du centre sont implantés dans trois départe- nement (SOERE), une plateforme de chirurgie pré-clinique
ments : le site de Lusignan-Rouillé dans la Vienne (86), l’unité porcine, des conservatoires de ressources génétiques et un
sous contrat à Chizé dans les Deux-Sèvres (79) et les sites dispositif d’évaluation des variétés en vue de leur inscription
du Magneraud et de Saint Laurent-de-la-Prée en Charente- au catalogue national.
Maritime (17).
Agripop : une unité sous contrat Inra/CNRS
Le 1er janvier 2011, l’Inra et le CNRS ont créé une unité sous
contrat : l’équipe Agripop. Implantée au Centre d’études
biologiques de Chizé près de Niort,
elle compte quatre agents du CNRS –
dont son directeur Vincent Bretagnolle
– et quatre agents de l’Inra.
Elle cherche à connaître
l’impact sur la biodiversité,
des changements
environnementaux causés
par l’homme.
4 n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n
>
es femmes
L
et les hommes
n Effectif : 240 agents permanents
Le centre Inra Poitou-Charentes compte 240 agents perma- Une majorité de techniciens
nents : 132 à Lusignan-Rouillé, 4 à Chizé, 87 au Magneraud et Avec la création de l’équipe Agripop, ce sont deux nouveaux
17 à Saint Laurent-de-la-Prée. chercheurs qui ont rejoint le centre en 2011. Sur un centre
essentiellement composé d’unités expérimentales, le cher-
Une moyenne d’âge de 44 ans cheur n’est pas le métier majoritaire. Le centre compte 70 %
et 38 % de femmes de techniciens et adjoints techniques, qui travaillent auprès
La moyenne d’âge du centre est de 44 ans et un tiers des des animaux, dans les serres, dans les parcelles d’essai ou
agents du centre a entre 40 et 49 ans. L’effectif total est com- en laboratoire.
posé de 91 femmes et 149 hommes.
A Chercheurs 6%
n Hommes n Femmes C Adjoints techniques 28%
60 ans et + 7 4 A Ingénieurs 24%
50-59 ans 49 22
40-49 ans 49 29
30-39 ans 35 29
20-29 ans 9 7
B Techniciens 42%
Répartition hommes-femmes par tranche d’âge
Répartition par catégorie de la Fonction Publique (A, B, C)
Des petites ou moyennes unités
La population des agents est répartie dans une unité de
recherche, huit unités expérimentales – dont le Geves et le 102 agents non permanents :
BioGeves, une unité sous contrat et une unité d’appui à la 16,5 équivalents temps plein
recherche. L’unité de recherche compte à elle seule 21 % des 102 agents non permanents ont été recrutés ou accueillis
agents. Neuf unités sur onze comptent moins de 30 agents en 2011, représentant 16,5 équivalents temps plein (ETP).
chacune. Ce sont des boursiers de thèse, des chercheurs étrangers,
85 % des métiers représentés appartiennent à deux branches des formateurs, des agents recrutés en CDD ou en CDI,
d’activité professionnelle : les sciences du vivant (71 %) et la mais aussi souvent des stagiaires (30) et des mains d’œuvre
gestion et le pilotage (14 %). occasionnelles (44) recrutées en renfort pour les travaux
saisonniers.
URP3F
USC Agripop Travailleurs en situation de handicap
UEFE En septembre 2011, le centre a recruté une technicienne en
UE St Laurent
gestion financière et comptable à Lusignan, en contrat d’un
UE Entomologie
an pouvant évoluer vers une titularisation. Ce recrutement
UEICP
UE Gepa
s’inscrit dans la politique volontariste de l’Inra en faveur des
UE EASM travailleurs en situation de handicap et contribuera à atteindre
Geves l’obligation légale d’emplois fixée à 6 %.
BioGeves
Services d’appui
Répartition des agents par unité
n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n 5
n La formation des agents
237 agents, permanents ou non, ont bénéficié de 99 actions Sensibiliser aux risques psycho-sociaux
de formation en 2011. Le taux d’accès à la formation des L’Inra s’est saisi de la question des risques psycho-sociaux
agents permanents est de 78 %. Le centre Inra Poitou-Cha- (RPS). Pour Michel Eddi, directeur général délégué de l’Inra,
rentes a organisé 73 formations : 41 formations individuelles, «La question […] est depuis quelques années une préoccupa-
27 formations collectives commanditées par le président de tion importante du monde du travail […]. Ce risque […] com-
centre ou les directeurs d’unité, et géré 5 parcours diplô- prend dans une acceptation large le stress mais aussi les vio-
mants. Cela représente un total de 7 204 heures de forma- lences à l’égard des personnes – dont le harcèlement – ainsi
tion suivies par les agents du centre dans les principaux do- que la souffrance ou le mal être au travail.»
maines suivants : parcours diplômants, prévention, domaines
techniques et langues. A elles seules, les formations en pré- En Poitou-Charentes, une action de sensibilisation a apporté
vention représentent plus de 19 % des heures réalisées. Par aux acteurs des clefs de compréhension des facteurs déclen-
ailleurs, 21 agents du centre ont encadré des formations en cheurs de RPS d’une part et une connaissance des leviers
tant que formateurs internes. d’actions dont ils disposent d’autre part. Ses objectifs :
•m ieux appréhender les enjeux de la prévention des RPS et
agir dans le sens d’une meilleure prise en compte du facteur
humain au travail ;
• c omprendre la problématique de la souffrance au travail, en
repérer les manifestations et le lien avec les RPS ;
•m ieux appréhender les déterminants collectifs, organisation-
nels et managériaux des RPS ;
• r epérer des situations concrètes génératrices de RPS ;
• a border les repères opérationnels pour construire le projet de
centre en matière de prévention des RPS.
Cette formation s’adressait aux directeurs d’unité, directeurs
d’unité adjoints, responsables d’équipe, agents chargés de
prévention, membres du Comité hygiène et sécurité ainsi
qu’aux acteurs RH et prévention. Elle a réuni 48 personnes au
printemps 2011.
78 % des agents permanents ont suivi une formation en 2011.
47 % du budget de la formation a servi à accompagner la
politique scientifique, 20 % à l’accompagnement des métiers
et des parcours professionnels, 23 % à promouvoir les droits
individuels.
6 n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n
>
Les moyens Investissements : 15 %
financiers Leur part importante tient en grande partie à l’effort significatif
consenti sur les investissements immobiliers, pour mettre en
place des moyens expérimentaux d’excellence : une porcherie
et un dispositif expérimental caprin.
n Budget du centre :
19,7 millions d’euros Fonctionnement : 18 %
Ce poste comprend l’ensemble des achats des unités de re-
Ressources cherche et unités expérimentales (hors équipements) ainsi que
Le budget est principalement constitué par une subvention les dépenses collectives (restauration, entretien des locaux…).
d’Etat. Viennent ensuite les recettes propres des unités expé-
rimentales qui résultent de la vente de leurs produits végé-
taux et animaux, et les ressources issues de partenariats 15 %
publics et privés. Investissement
Subvention d’Etat : 72 %
• s ubventions d’exploitation et d’investissement accordées par
67 % Personnel
les deux ministères de tutelle, principalement le Ministère de (permanent et 18 % Fonctionnement
l’enseignement supérieur et de la recherche (y compris les non permanent)
salaires des personnels non permanents) ;
• salaires des personnels permanents.
Destination des dépenses 2011
Partenariats publics et privés : 13 %
• c ontrats de recherche et soutiens finalisés à l’activité de
recherche. n Partenariat public et privé :
2,4 millions d’euros
Ressources propres : 15 %
• p roduits valorisés de l’activité de recherche et de prestations A l’Inra, de nombreux programmes de recherche associent
de services ; des chercheurs de l’institut à des équipes d’autres établisse-
• a utres produits (non affectés à un projet ou un programme ments publics, aux collectivités locales, à l’Europe, à l’Etat,
de recherche). aux professionnels, aux coopératives, aux associations…
La plupart des programmes sont co-financés par différents
intervenants (publics et privés) et sont gérés par l’établisse-
1 889 Ke Partenariat public
ment sous forme de contrats de recherche ou de prestation
538 Ke Partenariat privé de service.
En 2011, le partenariat public et privé du centre a généré
2 886 Ke Ressources 2 427 K€ de ressources contractuelles. En termes d’emplois,
propres
cela représente dix contrats de travail, dont trois boursiers de
thèses et un chercheur invité.
14 365 Ke
Subvention d’état
Le partenariat
Origine des crédits 2011 public
et privé a généré
DEPENSES 10 contrats de
Salaires : 67 % travail en 2011
Pour l’année 2011, les salaires du centre s’élèvent à 12 773 K€,
dont 410 K€ (3,2 %) pour les personnels non permanents.
n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n 7
Investissement Fonctionnement Personnel Tous usages
Région 547 89 104 740
Europe, Feder 601 234 33 868
ANR 16 109 16 141
Etat, CHU, CNRS 23 85 32 140
Secteur privé 20 491 27 538
Toutes origines 1 207 1 008 212 2 427
Les ressources contractuelles 2011 : origine et usage (en K€)
Stéphane Grenier pour sa troisième année de thèse (soute-
212 Ke Personnel nue le 12 décembre), Fabrice Requier et Amel Maamouri pour
leur première année de thèse. La Région soutient également
le projet Expoleg-AV (Exploiter le potentiel offert par les légu-
1 207 Ke
Investissement mineuses fourragères pour une agriculture verte) pour la pé-
riode 2011-2013. Impliquant deux unités du centre (l’URP3F
et l’UEFE) et le semencier Jouffray-Drillaud, ce projet vise à
1 008 Ke acquérir les connaissances fondamentales et les outils permet-
Fonctionnement tant de mieux valoriser le potentiel offert par la luzerne, une
légumineuse fourragère, concernant l’efficience énergétique et
Destination des financements du partenariat 2011 azotée et la ressource en eau des systèmes agricoles.
601 Ke
Feder
Un engagement fort de la Région 740 Ke
Poitou-Charentes Région
Poitou-Charentes
Dans la continuité des années précédentes, le partenariat
avec la Région s’est traduit par l’implication de celle-ci dans 267 Ke
Europe
le financement du dispositif de recherche du centre Inra : 141 Ke
immobilier et équipements, majoritairement au travers du ANR
140 Ke
Contrat de projets Etat-Région (CPER 2007-2013), soutien état, CHU,
CNRS 538 Ke Privés
aux projets de recherche et aux bourses de thèse. Trois doc-
torants étaient notamment cofinancés par la Région en 2011 : Origine des crédits de partenariat 2011
Une implication dans des projets
de recherche européens
Le centre Inra Poitou-Charentes contribue activement à
des initiatives internationales et européennes. Les projets
européens dans lesquels il s’implique sont essentiellement
financés dans le cadre du 7e Programme cadre de recherche
et développement (PCRD) de l’Union européenne, et par le
Fonds européen agricole de garantie (Feaga).
Visite de la Commission ruralité-agriculture-pêche-
cultures marines de la Région Poitou-Charentes
à Saint Laurent-de-la-Prée, le 29 juin 2011.
8 n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 nNom Type de Objectif Début Fin Coordonnateur
projet
Expeer 7e PCRD Fédérer les infrastructures de recherche sur les 2010 2014 Inra
écosystèmes continentaux Poitou-Charentes
Flockreprod 7e PCRD Proposer des méthodes alternatives de reproduction 2009 2013 Inra Poitou-
caprine Charentes/Tours
Animalchange 7e PCRD Proposer une vision prospective de l’élevage tenant 2011 2015 Inra Clermont
compte du changement climatique
Ecofinders 7e PCRD Fonction écologique et indicateurs de biodiversité dans les 2011 2014 Inra Dijon
sols européens
Multisward 7e PCRD Proposer des innovations pour utiliser les prairies et 2010 2014 Inra Rennes
conduire le pâturage des ruminants
GHG 7e PCRD Améliorer notre compréhension et notre capacité à 2010 2013 Thünen Institut
budgétiser le carbone terrestre et les gaz à effet de serre
Q-PorkChains 7e PCRD Améliorer la qualité des viandes porcines pour 2007 2011 Université
le consommateur de Copenhague
Qualité mâle Feaga Mettre au point une méthode pour évaluer les effets des 2010 2013 Inra
insecticides sur la fertilité mâle Poitou-Charentes
Techbee Feaga Mesurer les effets non intentionnels du thiamethoxam 2010 2013 Acta
chez l’abeille domestique
Extraits pollen Feaga Etudier les interactions et synergies entre les différents 2010 2013 Inra
facteurs de pression et leurs possibles effets conjugués Poitou-Charentes
sur les colonies d’abeilles
Nourrissement Feaga Pratiques de nourrissement et composants exogènes : 2011 2012 CNRS Solaize
conséquences sur la composition des gelées royales
produites et impact biologique sur les larves
Projets européens impliquant le centre Inra Poitou-Charentes comme partenaire ou coordonnateur
Participation à plusieurs projets nationaux nationale de la recherche (ANR), ou le Compte d’affectation
Au niveau national, le centre Inra Poitou-Charentes participe spéciale Développement agricole et rural (Casdar) du Minis-
à de nombreux projets, principalement financés par l’Agence tère chargé de l’agriculture.
Nom Type Objectif Début Fin Coordonnateur
de
projet
Grassbiofuel ANR Améliorer le potentiel de la biomasse de graminées pour 2008 2011 Inra
produire du bioéthanol
Biodivagrim ANR Comprendre les conséquences des évolutions paysagères 2008 2012 CNRS Chizé
sur la biodiversité des agro-écosystèmes
Pig Feed ANR Comprendre le déterminisme génétique de l’efficacité 2009 2012 Inra Jouy
alimentaire du porc
Porcinet ANR Améliorer la maturité des porcelets à la naissance par la 2010 2013 Inra Toulouse
sélection génétique
n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n 9Susflora ANR Améliorer la robustesse et la résistance des porcs aux 2011 2014 Inra Jouy
maladies par la sélection génétique
Dynrurabio ANR Dynamiques de développement de l’agriculture biologique 2011 2015 Inra Avignon
pour une écologisation des territoires
Farmbird ANR Etudier les conditions d’une conciliation entre production 2009 2013 Inra Versailles
agricole et conservation de la biodiversité
Advherb ANR Gérer la flore adventice dans des systèmes à bas niveau 2009 2013 Inra Versailles
d’herbicide
Landscaphid ANR Comprendre l’impact du paysage sur les pucerons rava- 2010 2013 Inra
geurs des cultures
Ecocycle ANR Mieux comprendre le fonctionnement des écosystèmes : 2009 2011 University of
les cycles et les interactions de la faune Aberdeen
Polinov Casdar Concevoir des systèmes de culture innovants concilliant 2010 2012 Acta
les enjeux de protection des abeilles et de durabilité de
l’agriculture
AviAlimBio Casdar Proposer des solutions et outils techniques pour accompa- 2011 2014 Chambre régionale
gner le passage à une alimentation 100 % bio en élevage d’agriculture des
avicole biologique Pays de la Loire
Casdar Casdar Evaluation environnementale et optimisation de la conduite 2011 2013 Chambre
Parcours des aménagements de parcours de volailles de chair Label d’agriculture de la
Rouge et Biologiques Sarthe
Interapi Casdar Influence de Cipan produisant du nectar et du pollen en 2012 2014 Itsap Institut de
zone de grandes cultures sur la dynamique de colonies l’abeille
d’abeilles domestiques hivernantes
Perturbateurs PNRPE Réponses individuelles et populationnelles des abeilles aux 2010 2012 CTIS
endocriniens perturbateurs endocriniens xénobiotiques
Blé tendre Casdar Tolérance du blé tendre aux stress biotiques et abiotiques 2008 2012 EGC Versailles
(stress bio) Grignon
Picoble Casdar Protection integrée des rotations avec colza et blé tendre… 2009 2011 Inra Versailles
Grignon
Multi- Casdar Contaminants sol/culture 2011 2013 Inra UMR TCEM
contamination Bordeaux
ESA UEFE Casdar Concilier productivité et services écologiques par des 2009 2012 ESA Angers
associations céréales légumineuses
Cipan Geves CTPS Faisabilité d’un projet sur les Cultures intermédiaires 2010 2011 Geves
Praiface Casdar Faciliter les évolutions d’exploitations vers des systèmes 2011 2013 RAD Rennes
herbagers économes et favorables à la préservation de
l’environnement
Projets nationaux impliquant le centre Inra Poitou-Charentes
10 n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n>
L’organisation
et les structures
n Conseil de gestion n Conseil scientifique
Il délibère sur les questions relatives au fonctionnement et à Il donne son avis sur les actions conduites par le centre en
l’organisation du centre, et à l’exploitation des résultats de la liaison avec des partenaires extérieurs implantés dans la
recherche. région, sur la mise en œuvre des projets impliquant plusieurs
départements de recherche et directions scientifiques de l’Inra,
sur les projets de thèse ainsi que sur la politique de valorisation
des travaux conduits au sein des unités du centre.
n Président de centre et directeurs d’unité
Présidence Gestion durable des prairies, systèmes fourragers et territoires
Jean-Marc
Chabosseau François Gastal Jean-Claude Emile Eric Kerneïs
Président de Centre Adjointe : UEfe Lusignan Adjoint :
Bernadette Julier Olivier Schmit
URP3F Lusignan UESLP
Saint Laurent
Vincent Bretagnolle Pierrick Aupinel
USC Agripop UE Entomologie
Chizé Magneraud
n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n 11Gestion durable des productions animales
Hervé Juin Séverine Deretz Philippe Guillouet
Adjointe : Adjoints : UEICP Rouillé
Karine Germain Yvon Billon et
UE EASM Magneraud Jean-Luc Widiez
UE Gepa
Magneraud-Rouillé
Appui à la recherche Geves BioGeves
Jean-Marc Bernard Aizac René Mathis
Chabosseau Magneraud Magneraud
Sdar Lusignan-
Magneraud
12 n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 nn L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n 13
>
Les démarches énergies renouvelables, elle a étudié la validité, les coûts et les
transversales bénéfices d’une chaudière à bois. Le coût total de 26 000 € a
été cofinancé par la Région Poitou-Charentes (9 300 €) et la
Commission nationale des unités expérimentales (CNUE) de
l’Inra (11 000 €). C’est la deuxième chaudière à bois installée
n Assurance qualité en recherche par l’Inra en Poitou-Charentes, après celle située au lycée agri-
cole Xavier Bernard.
Le groupe qualité du centre Inra Poitou-Charentes gère le ma-
tériel commun de métrologie et organise la démarche qualité n Expérimentations-système
au sein des unités. Les 134 balances du centre Inra Poitou-
Charentes sont contrôlées par la société Balco. Les pipettes Le centre Inra s’est doté de 4 dispositifs expérimentaux inté-
sont contrôlées par les techniciens de l'Inra et en cas de pro- grés permettant de concevoir et d’évaluer les performances
blème, la société Biohit intervient sur site. La centrale d’acqui- techniques, économiques et environnementales de systèmes
sition pour contrôler les températures des enceintes dispose d’élevage innovants et durables en bovins allaitants et laitiers,
désormais de son propre ordinateur portable, à disposition des caprins et volailles. Cette approche, dite d’expérimentation-
techniciens du centre. système, est relativement novatrice et vise à mener des re-
cherches au niveau global de l’exploitation agricole. Elle pose
un certain nombre de questions conceptuelles et pratiques. Le
Le groupe centre a constitué un groupe transversal de réflexion et d’appui
qualité gère aux responsables des dispositifs, pour les traiter.
le matériel
commun de
métrologie
Les unités s'auto-évaluent à partir d'un référentiel Inra consti-
tué de 5 chapitres : management de la qualité et responsabili-
tés, réalisation du projet de recherche, management des res-
sources, documentation et mesures, analyse et amélioration.
n Eco-responsabilité : une seconde
chaudière à bois
En septembre 2011, l’unité expérimentale Génétique et expéri- AlterAvi, l’une des quatre expérimentations-système
mentation en productions animales (Gepa) a équipé son site de de l’Inra en Poitou-Charentes
Rouillé d’une chaudière automatique à granulés bois. L’unité a
souhaité privilégier un chauffage économique et respectueux Intitulé Esprit (Expérimentations-système pour des recherches
de l’environnement pour chauffer les truies et porcelets du innovantes dans les territoires), ce groupe rassemble des
bâtiment maternité / post sevrage. Avec le Centre régional des membres des quatre unités porteuses des dispositifs (UEFE,
UEICP, UE EASM, UESLP). Il aborde collectivement des ques-
A Rouillé, les truies tions d’informatique (bases de données-SIG), de communica-
et leurs porcelets tion, de formation et de valorisation inhérentes aux projets. Il
bénéficient d’un a aussi pour objectif d’organiser les relations avec les acteurs
chauffage à des territoires, pour prendre en compte leur point de vue dans
granulés bois, l’élaboration des questions traitées et pour mettre en œuvre,
cofinancé par de façon interactive, des acquis afin de les confronter à la réa-
l’Inra et la Région. lité socio-économique et aux enjeux environnementaux dans
les territoires.
14 n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n2 Résultats
scientifiques
marquants
Gestion durable des prairies,
systèmes fourragers et territoires
Gestion durable des productions
animales
p 16
p 33
n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n 15Gestion durable des prairies, systèmes
>
fourragers et territoires
n Concevoir des prairies productives très présentes même après huit ans. Certaines espèces,
et bénéfiques à l’environnement à faible productivité mais très pérennes comme la fétuque
rouge ou le pâturin des prés, sont capables de recoloniser les
Améliorer lA valeur agronomique, espaces laissés libres par d’autres espèces moins pérennes.
lA pérennité et les services Cet essai permet de mieux comprendre l’élaboration de la
écosystémiques des prairies valeur agronomique des mélanges d’espèces et l’intérêt de
combiner des espèces ayant des cycles de vie différents. Il
Prairies multi-espèces : comment utiliser montre que, grâce aux complémentarités des espèces, les
la diversité des espèces pour combiner mélanges permettent d’améliorer non seulement l’étalement
productivité, valeur alimentaire et résilience et la régularité de production au cours de l’année, mais égale-
des prairies ? ment la pérennité et la résilience des prairies semées tout au
Un essai comprenant différents mélanges d’espèces four- long de la durée de leur exploitation (cinq à dix ans).
ragères (8 graminées, 5 légumineuses) a été étudié à Lusi-
gnan de 2003 à 2010 sous deux régimes de fauche et deux
niveaux de fertilisation azotée. La valeur agronomique (ren-
dement fourrager et composition biochimique), ainsi que la
proportion de chaque espèce dans le fourrage récolté, ont
été évaluées à chaque coupe. Sur toute la durée de l’essai,
quelques espèces sont régulièrement productives (fétuque
élevée, dactyle), mais d’autres espèces contribuent aussi
significativement au rendement de certaines coupes. Les
mélanges d’espèces permettent ainsi de régulariser la pro-
duction, même s’ils ne sont pas toujours plus productifs que
les espèces pures. Les mélanges qui se révèlent les plus pro-
ductifs après trois, six ou huit ans d’exploitation diffèrent nota-
blement. Les mélanges à base de ray-grass anglais sont sur-
tout productifs au cours des trois premières années et ceux à Evaluation de la proportion de chaque espèce dans une prairie
comprenant 13 espèces fourragères
Analyse Un projet d’amélioration génétique
biochimique et d’intensification écologique des prairies
de fourrage pour leur adaptation au changement
composé d’un climatique (Climagie)
mélange de Climagie est l’un des neuf projets sélectionnés en 2011 dans
8 graminées et le cadre du méta-programme de l’Inra Accaf (Adaptation au
5 légumineuses changement climatique de l’agriculture et de la forêt). Il vise à
améliorer les plantes fourragères pour adapter les prairies au
changement climatique. Coordonné par l’unité de recherche
base de dactyle le sont sur une durée un peu plus longue de pluridisciplinaire Prairies et plantes fourragères, il rassemble
cinq ou six ans. Au-delà de cette durée, les mélanges com- cinq équipes de l’Inra à Lusignan, Clermont-Ferrand, Mont-
prenant de la fétuque élevée offrent la meilleure production. pellier, Caen et Toulouse.
Enfin, l’évolution de la part de chaque espèce dépend peu
des espèces qui l’accompagnent : le ray-grass anglais décline Le changement climatique se profile pour le milieu du siècle
après trois ans de culture, le dactyle et le trèfle blanc après six avec des étés plus chauds, voire une nette diminution des
ans, alors que les fétuques qui s’installent lentement, restent pluies à l’horizon de 2050, et des pics de chaleur et de sé-
16 n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 ncheresse plus fréquents. Pour s’adapter, les prairies devront Les associations luzerne-graminées :
associer des espèces et variétés complémentaires. La sélec- comprendre les bases écophysiologiques
tion génétique s’oriente résolument vers l’amélioration des et génétiques de la complémentarité entre
plantes (fétuque, dactyle, ray-grass, trèfles, luzerne et sain- espèces pour mieux valoriser ce mode
foin) pour des prairies complexes. Le projet Climagie met de culture
en réseau et optimise les contributions de la génétique, de Les associations légumineuses-graminées sont des modes
l’écophysiologie, de l’écologie et de la physiologie végétales, de culture qui permettent une réduction des engrais azotés
pour chercher des caractères et des règles d’assemblage tout en combinant les valeurs agronomiques des deux types
adaptées aux futures conditions climatiques. Climagie se
décline en trois volets : la réponse des plantes à l’environne-
ment, la modélisation de mélanges d’espèces en compétition
pour les ressources naturelles et la valorisation des résultats.
L’URP3F est largement impliquée dans les trois volets avec
ses résultats antérieurs sur les plantes des zones méditerra-
néennes et tempérées, avec un projet de thèse cofinancée
par la Région Poitou-Charentes pour les trois prochaines
L’association luzerne-graminées permet de réduire les
engrais azotés tout en combinant les valeurs agronomiques
des deux types d’espèces
d’espèces. La luzerne dont les capacités de multiplication vé-
Pour s’adapter au changement climatique, les prairies devront gétative sont faibles, possède l’avantage, grâce à la taille de
associer des espèces et variétés complémentaires ses tiges, d’être souvent compétitive pour l’interception de la
(ici : fétuque, dactyle, ray-grass, trèfle blanc et luzerne) lumière. De plus, elle fixe l’azote atmosphérique et contribue
indirectement à enrichir le sol en azote. L’URP3F a engagé
années, et en mobilisant ses relations avec AgriObtention, une série d’expérimentations visant à mieux comprendre la
Jouffray-Drillaud et l’ensemble des partenaires de l’Associa- compétition pour la lumière entre luzerne et graminées et la
tion des créateurs de variétés fourragères. L’URP3F souhaite dynamique de l’azote fixé par la voie de la fixation symbio-
en outre proposer des cartographies biogéographiques pro- tique ou absorbé dans le sol, pour identifier les caractères
jectives de la distribution des ressources génétiques dans les intervenant dans la survie et la production de chacune des
futures conditions climatiques. espèces. La variabilité génétique pour ces caractères, leur
déterminisme génétique et les conséquences de cette varia-
bilité pour la valeur agronomique sont étudiés.
L’ensemble de ces études, financées par la Région Poitou-
Charentes, le Ministère chargé de l’agriculture et l’Inra, devra
conduire à promouvoir ce type de culture, en proposant des
types variétaux mieux adaptés et des conduites culturales
favorisant la résilience des associations.
n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n 17Architecture et croissance des plantes certains biais ont été observés pour les couverts montrant
fourragères : un pas supplémentaire une forte structuration verticale et/ou un recouvrement des
vers une prairie virtuelle organes foliaires inter/intra-espèce. Ces erreurs ont pu être
Des plantes virtuelles afin d’analyser les mécanismes réduites via une description verticale plus fine de la canopée.
d’interactions entre espèces pour la lumière et les res-
sources du sol Couplage d’un module de sol, d’un modèle de morpho-
La valeur agricole des prairies est étroitement liée à l’architec- génèse de plante et d’un modèle d’échanges gazeux au
ture des plantes qui les composent. Celle-ci dépend de fac- sein de la plateforme OpenAlea
teurs génétiques (espèces, variétés) et physiologiques (stress La plante intercepte l’énergie lumineuse et l’utilise pour pro-
hydrique, azote) dont l’expression est modulée par l’environne- duire de la biomasse, récoltable lors de la photosynthèse.
ment (rayonnement, sol, précipitations, mode d’exploitation de Pour la plante, la photosynthèse donne lieu à un échange
la prairie). Les recherches de l’équipe visent à : « eau contre carbone » : elle fixe le CO2 qui diffuse de l’air am-
• c aractériser les liens entre architecture des plantes et par- biant via les stomates de ses feuilles, mais consomme dans
tage des ressources du milieu (lumière, azote, eau) ; le même temps de l’eau du sol et la transpire par ces mêmes
• é tudier les réponses des plantes fourragères à la disponibi- stomates. Un modèle générique d’échanges gazeux (eau et
lité de ces ressources ; CO2), rendant compte de ces phénomènes a été implémenté
• intégrer ces réponses afin de modéliser le fonctionnement sur la plateforme de modélisation OpenAlea en collaboration
de peuplements prairiaux en considérant à la fois la diver- avec l’Inra de Montpellier (LEPSE) et l’organisme national ar-
sité des contraintes de milieu, le mode de gestion et la diver- gentin de recherche agronomique (Inta). Les chercheurs ont
sité génétique. calibré à la fois pour la luzerne (à Lusignan) et pour la vigne (à
Montpellier). Ce modèle de fonctionnement de la feuille a pu
Estimer le partage de rayonnement entre espèces dans être introduit avec succès dans différents modèles de plantes
les associations graminées-légumineuses : le potentiel virtuelles de la plateforme (luzerne, vigne…). Cela permet
des représentations simples de l’architecture d’ores et déjà de rendre compte de la photosynthèse et de la
En collaboration avec le groupe ESA, l’URP3F a évalué la transpiration de plantes et peuplements en absence de stress
capacité de différentes méthodes de représentation de l’ar- hydrique. Un second couplage avec un modèle simulant le
chitecture des plantes pour prédire le partage de la lumière bilan hydrique du sol a récemment été réalisé afin d’introduire
dans les associations graminées-légumineuses. L’approche les effets d’un stress hydrique. Il est actuellement en cours
virtuelle (représentation en 3D de la géométrie de tous les d’évaluation sur la vigne. Ce couplage complet, permettant
organes de la plante) a ainsi été confrontée à des repré- de simuler le fonctionnement du continuum sol-plante-atmos-
sentations basées sur le principe de «milieu turbide» (des phère sous contrainte, est une première pour les plantes vir-
représentations en 1D plus ou moins détaillées de la densité tuelles.
du feuillage) sur la base de plusieurs associations grami-
née-légumineuse : blé-pois, fétuque élevée-luzerne, fétuque Les collections d’espèces fourragères
élevée-trèfle. Une large gamme d’architecture et de distribu- et à gazon de Lusignan intègrent les réseaux
tion spatiale du feuillage a été couverte. Dans la très grande français et internationaux de conservation
majorité des cas, le modèle de «milieu turbide» le plus simple des ressources génétiques
a fourni des estimations du partage du rayonnement proches Depuis 2008, les collections de ressources génétiques des
de celles issues de l’approche plante virtuelle. Néanmoins espèces fourragères et à gazon détenues par différentes uni-
tés de recherche de l’Inra ont été rassemblées dans un Centre
de ressources génétiques (CRG) hébergé par l’URP3F à Lu-
signan. Ces collections comprennent des populations natu-
relles de graminées, des variétés de pays de luzerne culti-
Numérisation vées avant l’utilisation des variétés sélectionnées, ainsi que
de l’architecture certaines variétés de graminées et de légumineuses issues
d’une luzerne de la sélection moderne mais qui ne sont plus commercia-
lisées aujourd’hui. Ces collections sont conservées sous
forme de lots de graines maintenus au froid positif (+5°C)
en deux lieux différents ainsi qu’en congélation (-18°C). Elles
18 n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 nressources génétiques européennes Eurisco et ECPGR et
a été mise en ligne sur le site web GBIF de géo-référence-
ment de la biodiversité mondiale. Un versement officiel de
cette liste au système d’échange de ressources génétiques
du «Traité international sur les ressources phytogénétiques
pour l’alimentation et l’agriculture» est par ailleurs en cours.
La mise à disposition de ressources génétiques nationales
dans un système d’échange international permettra en retour
à l’URP3F d’accéder aux collections d’autres pays. La liste
des accessions rendues disponibles sera progressivement
élargie au cours des deux prochaines années.
La sélection assistée par marqueurs
Lots de graines conservés par congélation chez les espèces fourragères
La Sélection assistée par marqueurs (Sam) est un outil d’aide
constituent un matériel génétique indispensable permettant à la sélection. Elle vise à augmenter l’efficacité de la sélection
aux sélectionneurs de disposer de sources de diversité origi- et à permettre un progrès plus rapide que la sélection basée
nales pour adapter les variétés du futur à de nouveaux enjeux uniquement sur l’observation du phénotype. Elle est basée
agronomiques. Dans cette perspective, les accessions déte- sur l’utilisation de marqueurs génétiques – séquences d’ADN
nues par le CRG espèces fourragères et à gazon, ainsi que localisées dans le génome et présentant des variations faci-
les informations attachées à ces accessions (origine, valeur
agronomique), doivent être le plus largement possible visibles La Sélection
et disponibles. Une liste de 537 populations naturelles de gra- assistée par
minées et 30 variétés de pays de luzerne a donc été versée maqueurs
dans la base de données ressources génétiques végétales augmente
du département Génétique et amélioration des plantes de l’efficacité de
l’Inra et rendue consultable publiquement, via l’interface web la sélection
de cette base de données (http://urgi.versailles.inra.fr/siregal). génétique
Cette liste a également été intégrée aux bases de données
537 populations de graminées et 30 variétés de luzerne ont été lement détectables. Des contraintes biologiques conduisent
versées dans une base de données consultable sur internet à créer des variétés synthétiques par sélection de plusieurs
individus qui sont ensuite inter-croisés (polycross) pendant
plusieurs cycles.
Identification des marqueurs liés à la variation
des caractères d’intérêt
n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 n 19La détection de régions du génome (QTL) impliquées dans la européenne permettra de mieux prévoir les réponses des
variation de caractères d’intérêt est une étape indispensable écosystèmes aux changements globaux.
à la Sam. Habituellement, cette détection est réalisée dans Expeer est l’un des grands projets collaboratifs du 7e Pro-
des descendances de croisements biparentaux. Une thèse gramme cadre de recherche et développement (PCRD). La
encadrée par l’URP3F à Lusignan (Laurence Pauly, bourse contribution européenne de 7,4 millions d’euros et le thème par-
Cifre Jouffray-Drillaud – Inra), a montré comment il était pos- ticulièrement novateur des ces infrastructures, en font un projet
sible d’identifier des QTL en utilisant le matériel de sélection, exemplaire pour l’Inra. L’origine de ce projet est un consortium
c’est-à-dire des descendances de polycross. Pour cela, une européen (37 partenaires de 22 pays) au sein duquel l’Inra est
approche expérimentale a été réalisée sur la hauteur étirée moteur. Parmi les 33 sites du réseau, cinq sont français, dont
(reliée au rendement) et la résistance aux rouilles chez le ray- trois sont gérés par l’Inra : le Système d’observation et d’expé-
grass anglais. Ces résultats ouvrent des perspectives intéres- rimentation pour la recherche en environnement ACBB (Agro-
santes pour inclure des étapes de Sam directement dans les systèmes, cycles biogéochimiques et biodiversité) à Lusignan,
schémas d’amélioration des plantes fourragères. Mons et Clermont-Ferrand, le site forestier de Hesse près de
Nancy et Ecosylve autour de Bordeaux.
Evaluer les impacts Expeer prend la suite du projet européen Anaee (Analyse
environnementaux des prairies et expérimentation sur les écosystèmes). Anaee a été éva-
semees lué positivement par le Comité stratégique européen sur
les infrastructures (Esfri) et voté à l’unanimité par les états
Coordonner un projet européen pour membres d’Esfri en septembre 2010 pour être intégré dans la
fédérer les infrastructures de recherche feuille de route des infrastructures européennes.
en environnement
Le projet européen Expeer (Distributed infrastructure for Contribution des prairies au stockage
experimentation in ecosystem research) a été officiellement du carbone et de l’azote
lancé le 8 février 2011 à Fontainebleau. Son but : fédérer En prairie, la permanence d’un couvert végétal donne un ca-
les infrastructures européennes de recherche sur les éco- ractère conservatif aux cycles de carbone et d’azote, contri-
systèmes continentaux (forêts, prairies, systèmes agricoles). buant à séquestrer du CO2 atmosphérique dans les sols et à
limiter les flux d’azote vers l’hydrosphère et vers l’atmosphère.
L’un des objectifs de recherche du dispositif d’observation
SOERE-ACBB de Lusignan est d’évaluer l’incidence des pra-
tiques de gestion (durée de maintien et âge de la prairie, rota-
tion avec des cultures) et de la composition de la végétation
sur les flux atmosphériques et sur le stockage du carbone et
de l’azote dans la matière organique des sols.
Le stockage du carbone peut être évalué à partir de l’évolution
des quantités de carbone stockées dans le sol. Toutefois les
changements de stock de carbone sont lents et nécessitent
des pas de temps de 5 à 10 ans pour pouvoir être quantifiés.
De manière alternative, la mesure en continu par la méthode
des corrélations turbulentes, des flux de CO2 échangés entre
la végétation et l’atmosphère, permet d’évaluer le bilan en
Le réseau européen d’infrastructures mis en place par carbone du système sol-culture sur des pas de temps plus
le projet Expeer permettra de mieux prévoir les réponses courts (saison, année).
des écosystèmes aux changements globaux L’année 2011 a vu le retournement de plusieurs des prairies
de six ans du dispositif SOERE de Lusignan, installées de-
Coordonné en Poitou-Charentes par l’URP3F de l’Inra, puis le printemps 2005. Les flux de CO2 entre la végétation
Expeer va mettre en place à l’échelle européenne un réseau et l’atmosphère, ont été comparés entre une prairie de six
de plateformes expérimentales associées à des plateformes ans labourée en mars et réimplantée en maïs, et une prairie
d’analyse et de modélisation. Leur développement à l’échelle permanente, de même âge mais non labourée.
20 n L’Inra en Poitou-Charentes n Rapport d’activités 2011 nVous pouvez aussi lire
