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05/04/2016
Défense sanitaire des
cultures et du bétail
6èmes Entretiens de l’AEI
ESA Angers- Mars 2016
Défense sanitaire des cultures et du bétail et AEI
Bioqis Fr
futura sciences
1
05/04/2016
• L’AEI peut-elle proposer des solutions
satisfaisantes face aux difficultés en matière de
défense sanitaire des cultures et élevages?
• Les difficultés sont connues: Pollutions, réaction des
consommateurs,exposition des agriculteurs à des produits
présentant des dangers, réduction du nombre des
molécules (matières actives), etc.
Donc un présent difficile résultant
d’une longue histoire
Histoire résumée de la défense
des cultures, à grands traits
Textes extraits de -et d’après- Daniel
Lejeune SNHF. et Jean P. Deguine (CIRAD).
Résumé : M. Griffon. Février 2016
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Aux temps antiques
On signale fréquemment les attaques de
• Chenilles
• Criquets
• Ergot de seigle
• …
John Martin Les sept plaies d’Egypte- Boston
J. Bosh Tentation de Saint Antoine qui
guérissait le “mal des ardents” –le feu en
haut à gauche- ou ergot du seigle
Et même avant…
• Vers -3000: extraits de • Des procédés de lutte
plantes pour protéger biologique étaient
les stocks alimentaires utilisés en Chine
ancienne à partir
d’agrumes
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Pline l’ancien… à Rome
Pline, auteur romain du premier siècle de notre ère, a
compilé plus de 3000 textes de ses ancêtres et de ses
contemporains dans son « Histoire Naturelle ». Il écrit par
exemple: « En abattant à coups de bâton les branches de
la fougère quand elle bourgeonne, le suc qui s'en écoule
tue les racines. On dit encore qu'elle ne repousse pas. »
Contre les maladies on détruit les végétaux malades par
le feu. On crée des nuages de fumées avec du soufre…
Pline écrit « Quand vous avez des craintes, brûlez dans
les vignes et dans les champs des sarments ou des tas de
paille, ou des herbes, ou des broussailles arrachées : la
fumée sera un préservatif. »
La technique, majoritairement utilisée était l’intervention
manuelle et elle demeure toujours d’actualité : Contre les
mauvaises herbes : arrachage, binage…
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Les Lumières
• Des observations rationnelles permettent en agronomie de
nombreuses avancées. Duhamel du Monceau peut décrire en
1728 la maladie du Safran qui sévissait alors en gâtinais, qu’en
1753, Parmentier publie son « Traité de la conservation des
grains », qu’en 1777, l’abbé Teissier établit la responsabilité
de l’ergot du seigle (Claviceps purpurea) dans le mal des
ardents. En 1807, répondant à un concours lancé par la
société des sciences de Montauban, Abraham-Bénédict
Prevost publie enfin un célèbre mémoire sur la Carie du blé
(Tilletia caries). C’est le Directoire qui, le premier, rendra
obligatoire l’échenillage. Cette loi de l’an VI ne sera reprise et
amplifiée qu’en 1890.
Puis, vient l’ère des grands fléaux
L’allemand De Barye, « père » de la pathologie végétale,
montre en 1853 que les Urédinales et les Ustilaginales
sont bien la cause des charbons et caries, la même
chose à propos du mildiou de la pomme de terre. A la
même époque, en France, Prillieux commence à
enseigner la pathologie végétale.
Syngenta.com
5
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L’ère des grands fléaux
Originaire de l'Est des Etats-Unis,
le Phylloxera est un insecte
piqueur apparenté aux pucerons.
Il fut signalé pour la première fois
en France en 1863. Au 19ème siècle,
le Phylloxera eut une importance
économique et sociale dramatique
sur la viticulture française et
européenne, qui fut dévastée et
qui dut intégralement se
reconstruire. Le Phylloxera a
aujourd'hui colonisé presque tous
les vignobles du monde
Larousse
Les grands fléaux
Les colonies ne sont pas en reste
pour la précarité des récoltes : en
1866 une invasion de criquets
(Schistocerca gregaria) détruit une
grande part des récoltes, causant
indirectement la mort d’au moins
250 000 personnes. Devant ce
fléau, un ramassage massif sera
organisé en 1888, avec un résultat
ahurissant : 70 000 m3 de jeunes
criquets et 10 000 m3 d’oothèques
collectés !
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La révolution pasteurienne est la
prise en considération générale des
L’ère microorganismes. En 1874, Pasteur
publie ses travaux relatifs à la
pasteurienne flacherie du ver à soie. Il évoque à
cette occasion la possibilité
d’utiliser des micro-organismes
pour lutter contre les insectes
nuisibles aux cultures. En 1886,
Mayer découvre la mosaïque du
tabac. Le champ des ennemis des
cultures connus s’accroît avec les
virus. En 1888, Prillieux crée la
première station de recherche en
pathologie végétale
1889 Californie: la lutte biologique
Introduction des coccinelles australiennes et néo-
zélandaises dans les orangeraies californiennes
contre les cochenilles
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Après 14-18: l’ère de la chimie
Jusqu’à la fin des années 1930, l’agriculture et
l’horticulture furent très démunies en
matière de protection phytosanitaire. Malgré
de multiples essais, les matières efficaces se
limitaient encore à une bonne dizaine. Le
soufre ou les sels de cuivre contre les
champignons parasites, les arsenicaux, la
roténone ou les pyrèthres et surtout la
nicotine de la régie des tabacs associée au
savon noir contre les insectes phytophages
et, depuis la fin de la guerre, les stocks
militaires de certains gaz de combat, telle la
chloropicrine utilisée pour les traitements
sous bâche des arbre fruitiers et autres.
Pourtant les recherches s’organisent
et s’intensifient : la station de
phytopathologie de Prillieux est
La chimie
installée à Versailles. Le décret du 1er
mai 1911 crée le service d’inspection
phytopathologique des cultures
horticoles. De son côté, la lutte contre
les adventices, que l’on nomme
encore « mauvaises herbes » en est à
ses balbutiements. Seul Rabate avait
mis au point une technique de
désherbage sélectif des blés à l’acide
sulfurique. Le désherbage
« industriel » des voies de chemin de
fer est sans doute à l’origine de grands La dépêche.fr
progrès dans les années 1920 pour les
zones non cultivées.
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Mais toujours l’intervention
manuelle
Ramassage de larves de
doryphores vers 1950
La lutte contre les vers
blancs (larves de hannetons) Pusey
Les travaux de Botjos et des
japonais en 1920, montrent Les
l’implication des pucerons dans la envahisseurs
transmission des virus. Le danger
des plantes invasives trouvent un
premier exemple frappant : celui
de l’envahissement de 24 millions
d’ha australiens par le cactus
raquette (Opuntia) contre lequel
on pratique une forme de lutte
biologique en introduisant un
insecte phytophage (Cactoblastis Bloom IQ.com
cactorum). Le CNRA de
Versailles comporte dorénavant un
laboratoire de phytopharmacie.
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Entre la fin du XIX°
siècle et la fin de la
seconde guerre
mondiale
Les producteurs disposent de
moyens chimiques de plus en
plus nombreux tels que soufre et
cuivre sous des formes diverses,
mais aussi arséniates, roténone, Application hivernale d’arséniate sur arbre fruitier
vers 1920 (photo Syngenta, extraite de Histoire de
huiles minérales, etc. Souvent la protection des cultures de 1850 à nos jours)
non sélectives, polluantes,
persistantes dans Montée des
l’environnement, ces
substances sont de plus
traitements avec
appliquées dans des chimie de synthèse
conditions rudimentaires
Le doryphore (Leptinotarsa decemlineata)
débarque avec les troupes américaines à
Naissance de Bordeaux en 1917 et atteint la Creuse en
1939. Il allait bientôt déferler sur l’Europe
la PV entière. Dans une économie d’occupation
et donc de restrictions alimentaires, il
était vital de prévenir l’arrivée de
nouveaux fléaux agricoles. La loi du 25
mars 1941 crée et organise le service de la
Protection des Végétaux.
En 1942, le français Dupire découvre les
intéressantes propriétés du Lindane
(isomère gamma du HCH).
En 1943, la loi française réglemente la vente
des spécialités phytosanitaires et
organise l’homologation des pesticides
sous la responsabilité conjointe de
l’Institut de Recherche d’Agronomie et de
la Protection des Végétaux.
1005/04/2016
Le DDT Les propriétés insecticides du
DDT sont mises en évidence
par Müller en 1939 et la
molécule est industrialisée
aux USA à partir de 1942. En
1944, le parathion-éthyle,
synthétisé par Schradler est
mis en vente. Linquist montre
que le sang de lapins ayant
absorbé du DDT devient
toxique pour les punaises des
lits…c’est le début de la lutte
endothérapique !
Après guerre: la chimie de synthèse
• En 1946 à Louvain (Belgique), le premier congrès
international de phytopharmacie met en
évidence l’apparition de résistance aux
pesticides chez les insectes. On dénombre déjà
14 espèces concernées en 1948.
• Le DDT (Dichlorodiphényltrichloroéthane) et
l’HCH (hexachlorocyclohexane) arrivent en France
en 1950 et Geigy met au point les triazines.
• En 1956 La Commission des Essais Biologiques.
• L’agriculture bénéficie de la mise au point des
hormones végétales de synthèse, parmi
lesquelles l’acide 2,4 dichloro-phénoxyacétique
s’avère un désherbant sélectif des graminées et
donc des gazons.
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La chimie et les premières réactions
d’opposition
En 1960, on isole et analyse la
phéromone du ver à soie, prélude
à la lutte par piégeage sexuel des
Lépidoptères phytophages.
En 1962 paraît aux USA la célèbre
alarme de Rachel Carson « Le
printemps silencieux », bientôt
suivi du livre de Jean Dorst
« Avant que nature meure » : les
deux ouvrages dénoncent les
risques irréversibles que les
Bird note
pollutions chimiques font courir
aux écosystèmes naturels.
En 1963, Staron découvre le
Chimie et extension Thiabendazole, premier
fongicide systémique. Le
des résistances paraquat, désherbant total,
vante son effet de « labour
chimique » et les huiles de
pétrole sont utilisées en
désherbage précoce de
cultures maraîchères (carottes
et oignons).
En 1969, c’est une liste de
224 espèces d’arthropodes
(insectes ou acariens) qui
Salem news sont résistantes aux
pesticides
1205/04/2016
• En 1964, Jean Ferrat chante « La Les réactions
montagne » L’après 1968 voit le
développement de mouvements des années 60
« écologistes » prônant une vie
saine et un retour à une nature
« sans produits chimiques ».
• Beaucoup insistent sur les
limites du « tout chimique » et
la nécessité de prendre en
compte protection des
pollinisateurs, la lutte
biologique et intégrée.
• Dénonciation de la toxicité
chronique des doses mises en
œuvre.
Sources: expo J. Ferrat / Jardiner avec Jean Paul
Les générations d’insecticides se
succèdent suite à la découverte de
dangerosités et suite à la R&D des firmes
Organophophoréset
carbamates Néonicotinoïdes
Organochlorés
Pyrethrinoïdes
Solutions biologiques
1305/04/2016
Puis, depuis 1970, l’apparition des PGM
• En 1972 : autorisation de vente pour le
Bacillus thuringiensis.
• En 1976, Biliotti crée en lien avec le CNRS, le
laboratoire des médiations chimiques.
• En 1990, plus de 500 espèces d’insectes
résistent aux pesticides.
• En 2010, 120 M.Ha en PGM
Quelles leçons tire-t-on de l’histoire?
• Certaines familles de solutions sont anciennes
• La lutte chimique a été fortement privilégiée
• Il y a eu un emballement durant les 3 dernières
décennies dans la recherche de solutions
chimiques mais en même temps dans les
interdictions des produits phytosanitaires
• Les solutions agroécologiques (AEI) ont démarré
très lentement
1405/04/2016
Un grand trait historique:
Plus les cultures pures ont une grande emprise
géographique, et…
– plus les pullulations de ravageurs et de maladies sont
importantes: ils sont devenus “envahisseurs”
– Moins les mécanismes tampon et d’autorégulation
fonctionnent; ils étaient assurés par la biodiversité
– Plus la réaction a été de trouver des solutions chimiques
pour attaquer ces envahisseurs
– Ces produits –outre les risques associés- sont contournés par
des résistances. C’est une escalade a priori sans fin
Temps
Ecosystème naturel Fragmentation Agroécosystème
Grande biodiversité Réduction de Biodiversité très
biodiversité réduite
Espèces en équilibre Espèces avec Déséquilibre
dynamique perturbations permanent
Permanence des pop Fluctuations de pop. Envahisseurs
Autocontrôle Corrections Défense des cultures
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Après l’histoire: Aujourd’hui,
quelle est la problématique pour
la protection des végétaux?
Les “ennemis” des cultures :
combien sont-ils?
• Compétitrices des plantes cultivées: 2500 espèces
• Bioagresseurs (espèces)
– 15 espèces de viroïdes
– 500 virus
– 200 bactéries
– 8000 champignons
– 500 nématodes
– 400 insectes nuisibles
• Mais …16000 auxiliaires et parasitoïdes
1605/04/2016
Avant de continuer, un peu de vocabulaire
• PPP: produits phytophamaceutiques = pesticide
• Biocides: n’entrent pas dans la chaîne alimentaire:
nettoyage des batiments d’élevage, conservation du
bois, produits ménagers
• Ennemi des cultures= organisme nuisible =
bioagresseur ou agent pathogène = ravageur
• Adventice (introduite pour les botanistes)
• Prédateurs, parasitoïdes
• Les PPP contiennent : une ou des substances
actives et des formulants.
• Le rôle de la substance active est de détruire ou
d’empêcher l’ennemi de la culture de s’installer,
les formulants servent de support à cette
substance tout en renforçant son action.
• Ces médicaments des plantes sont
commercialisés sous différentes formulations:
émulsions, poudres, suspensions, micro granulés,
aérosol, liquides, gel de contact..
1705/04/2016
Les techniques sont nombreuses
• Relatives à l’espèce à protéger:
– Variétés résistantes, tolérantes, PGM, plans et semences sains
• Relatives à la conduite des itinéraires techniques de l’espèce
à protéger:
– Dates de semis
– Travail du sol
– Fumure
• Relatives au type de lutte contre l’organisme à combattre
– En dehors périodes de nuisibilité: habitat des ravageurs, plantes
relais, résidus de récolte, habitat des auxiliaires, destr inoculum
– Pendant les périodes de nuisibilité:
• Lutte physique: effeuliilage, capture, effarouchement, filets, feu, chasse
• Lutte biologique: prédateurs, parasites, auxiliaires
• Lutte chimique: PPP, Confusion sexuelle, répulsifs, piégeage de masse
8 domaines scientifiques selon Jean L Bernard
• Connaissance des bioagresseurs: par exemple pour des
pièges chromatiques, connaître les auxiliaires, faire des
régulateurs de croissance d’insectes bloquant leur
developpement…
• Physiologie végétale: connaissances sur la progression des
virus et la thermothérapie, les éliciteurs (acibenzolar-S-
méthyl, extrait de fenugrec, ou de laminaires)…
• Fonctionnalités entre espèces: Exemples: arbre de judée
comme habitat, auxiliaires généralistes et spécialisates,
bandes fleuries avec syrphes contre pucerons;
microhymenoptères contre cicadelle; Préparations à partir
d’antagonistes: Bacillus thurigensis, nematodes
entomopathogènes, champignons, bactéries (bacillus subtilis
/botrytis cinerea, Coniothyrium minitans/ sclérotinia du colza
1805/04/2016
• Chimie de synthèse
– Produits non bioaccumulables et aisement
biodégradables –années 70s-
– Mécanismes biochimiques existants dans nature
(strobilurines issues de strobinurius tenacellus
champignon) – herbicide mesotrione issu de feuilles
de calistremon citrinus
– Conception assistée par ordinateurs des molécules
• Météo et effet sur plantes et ravageurs
– Effets des traitements selon les stades végétatifs
– Capteurs dans les milieux + logiciels = prévision des
maladies
• Machinisme: desherbinage, drones, précision,
buses précision, limitation de dérive,
panneaux récupérateurs, broyeuses,
ramasseuse de feuilles/ larves hybernantes…
• Phéromones sexuelles
• Mâles stériles
• Genome: mais attention aux résistances des
insectes aux insecticides, des herbes au
herbicides, des champignons aux fongicides
1905/04/2016
La chimie évolue
• Marché mondial: plus de 40Mrds$ dont 4%
biopesticides – France autour de 2Mrds €
• Le cahier des charges de l’avenir pour la chimie:
– Non nocif /consommateur
– Non nocif/ environnement
– Non nocif/ agriculteurs
– Fiabilité, emploi aisé
– Faibles doses / ha
– Ciblant l’organisme à combatte: spécificité
– Ne favorisant pas les résistances (?)
– Prix acceptable
La chimie évolue : Charles Descoins AAF
• La recherche de nouvelles molcules “au hasard”
disparaît: 1 succès/ milliers de tentatives- trop
coûteux
• Activation de la voie : Amélioration de produits
naturels biologiquement actifs
• Approche “biorationnelle”ou “drug design”: Pour
une molécule cible connue, on essaye par
modélisation de trouver une molécule active in
silico avec des banques de données-
2005/04/2016
Puis…
• Approche bioinspiration: repérage de
Fonctionnalités correspondant à des cibles
possibles: ex: carbamates antagonistes d’une
hormone juvenile d’insecte, utilisé comme
régulateur de croissance d’insecte… Cas des
éliciteurs…
• Produits de biocontrole
– Exemple: phéromones insectes
– PNPP Preparations naturelles peu préoccupantes
– Biofongicide “esquive” à base de trichoderma (Bayer)
Sans oublier
• PGM
– Maïs et coton Bt : risque de résistance (des zones
refuge limitent la résistance)
– Glyphosate ready: risque de résistance des
adventices de plus en plus signalé (Am. Latine)
– Transgenèse naturelle ouvrant la voie à des
transgenèses utiles
– Gene editing: utilise un processus de mutation
naturelle pour des usages potentiels utiles
2105/04/2016
La société va vers une réduction des PPP
• 1993: 984 Matières actives (MA)
• Directive 91/414CE 250 MA restent + 110 nouvellles =360
disponibles (données 2005)
• Risques humains:
– Risque alimentaire: pas de preuves que les résidus aux doses
indiquées entraînent des maladies; les LMR (lim max residus)
sont toujours respectées. Mais il y a de fortes suspicions quant
aux effets dus aux expositions réelles.
– Agriculteurs: risque Parkinson (glyphosate et adjuvant), mais
cancer non prouvé scientifiquement (etude AGRICAN) bien que
très fortes suspicions et reconnaissance du risque par la justice
– On trouve des PPP dans 90% des eaux de surface et 57%
souterraines
– Risques pour les riverains: non estimés mais suspicions étayées
Quelles sont les alternatives?
• …aux herbicides qui sont soupçonnés de présenter un
risque important:
– Rotations et successions culturales – allelopathie
– Labour “écologique”, binage, faux-semis, robots et solutions
“mécaniques”
– Surveillance de précision – intervention sélective
– Semis direct sous couvertures
– Nouvelles molécules (biosinsiration allelopathie)
– Molécules acceptables avec “conditions de gestion”
applicables par les agriculteurs, et précaution maximale
2205/04/2016
des alternatives…
• …aux fongicides :
– Surveillance de précision et interventions “chirurgicales”
– Succession diversifiée des PPP sur la même parcelle
– Successions culturales défavorables aux maladies et
organisées en mosaïque
– Techniques culturales relatives aux résidus de cultures
– Mulchs limitant les contaminations par le sol
–…
des alternatives
• …aux insecticides soupçonnés de dangerosité:
– Prédateurs et paraitoïdes en lâchers inondatifs ou
installés sur des habitats locaux
– Oiseaux avec nichoirs
– Zones attractives- pièges (plantes, phéromones) ou
concentrations pour destruction massive
– Plantes et substances naturelles répulsives ou
stimulatrices des défenses naturelles
– Nouvelles molécules bioinspirées par le langage
chimique entre plantes et entre plantes et insectes
– Résistance génétique des plantes- nouvelles
biotechniques
2305/04/2016
Brève histoire de la médecine
vétérinaire, dans ses grandes lignes
A partir de diverses sources web
Résumé M. Griffon février 2016
Néolithique et Antiquité
De -10000 à -3000,
domestication des caprins,
aurochs, mouflons,
dromadaires, porcs,
chevaux, éléphants. Très Figurine Egypte- Wikipedia
tôt se pose le problème des
maladies
Longtemps, le traitement des affections humaines et
animales ont été très liées. Dans le Moyen Orient: il n’y
aurait pas véritablement, semble-t-il, de séparation
entre médecine humaine et animale;
2405/04/2016
La Chine et l’Inde
Xème S en Chine:
sur le cheval,
pratique de:
l’acuponcture, le
traitement de la
cataracte, l’usage du
Gravure attribuée à Gan Bozong pouls, l’extraction Comme le cheval, les oiseaux de
(période Tang, 618-907),
représentant Shen Nong, le père des filaires… proie utilisés pour la
fauconnerie sont considérés
mythique de la médecine
traditionnelle chinoise, auteur
En Inde, Ayurveda: comme des animaux dignes de
supposé du Shennong bencao jing. stimulants, elixirs, soins. Manuscrit vétérinaire
Selon la tradition il possède une tête indien (Asvacikitsa).
de buffle. Il est ici figuré avec des aphrodisiaques,
cornes (collection Wellcome)
hygiène
Le cheval, objet de toutes les attentions
Destiné à la guerre en Assyrie et
tout le Moyen Orient.
Surveillance des troupeaux dans
l’Asie Centrale
Médecins spécialistes à Rome, et
Palefreniers Ninive- Wikipedia
les célèbres hypiatres de Byzance
Généralisé en Europe avec les
Grandes Invasions
Animal clé pour la traction attelée:
1/3 de la sole au XVIIIème siècle.
Animal de guerre jusqu’en 1914-18
Médecin allemand des Rôle clé des maréchaux ferrants
chevaux au XVIIIe.S.
2505/04/2016
L’hypiatrie arabe
.Grand investissement de
la civilisation arabo-
musulmane dans le cheval
et les soins à lui apporter
(société du mouvement)
.Invention du fer à cheval
et du métier de maréchal
. La Renaissance et
l’imprimerie ont permis de
récupérer les savoirs et
Anatomie du cheval fonder l’enseignement.
Bibliothèque Istambul Wiki
La création de l’enseignement vétérinaire
Déplacement des armées expansion:
peste bovine péripneumonie, maldies
parasitaires,fièvre aphteuse…
1765: Claude Bourgelat de l’Académie
d’équitation de Lyon achète le chateau
d’Alfort pour y faire l’Ecole Vétérinaire
Cohabitation longue
entre vétérinaires et
Frontispice du Markhams
Maisterpeece, ouvrage en anglais maréchaux
de 1636, containing all
knowledge belonging to smith,
farrier or horse-leechn. 17 L’animal comme modèle
touching the curing of all
diseases in the horse. pour l’humain
2605/04/2016
L’ère moderne: depuis 1950
• Passage des petits élevages
aux ateliers spécialisés
avec nouvelle génération
de bâtiments
• Animal d’élevage = vu
comme “animal machine”,
système input-output
• Médicaments variés:
antiparasitaires,
vermifuges, antibiotiques,
vaccins, compléments
alimentaires…
• Utilisation en prévention
des antibiotiques
Les réactions de la société
Inquiétude dues aux “maladies
ESB
“environnementales” :ESB,
contaminations dioxine, excès de
médicaments, antibiorésistances
Ethique: Bien-être animal
Futura
6666millionsdimpatients
2705/04/2016
Quelles leçons tire-t-on de l’histoire?
• Les soins pour les animaux se sont accrus et diversifiés avec
le développement de l’élevage en ateliers
• Les maladies parasitaires et infectieuses ont toujours existé:
bactéries, virus, parasites font partie de l’écosystème.
• Plus il y a des paysages ouverts et des mouvements des
hommes et animaux, plus les “proximités” sont possibles et
plus les épidémies peuvent se déployer. Elles peuvent devenir
explosives.
• Des maladies dues à l’intensité de la production apparaissent:
par exemple les mammites, maladies métaboliques
• Les méthodes de lutte sont fondées sur les médiaments en
particulier les antibiotiques, la vaccination et quelques
principes d’hygiène
• Les consommateurs deviennent méfiants vis à vis de
l’élevage intensif
Après l’histoire de la médecine
vétérinaire, aujourd’hui:
Quelle est la problématique pour la
protection des animaux d’élevage?
2805/04/2016
Maladies (pricipales) des élevages:
Ruminants Porcins Aviaires
Tuberculose SDRP Newcastle
Diarrhées Pneumonies Mycoplsamoses
Mammites Brucellose Grippe aviaire
Toxoplasmose Rhinites Botuline
Fièvres Trichinellose Choléra aviaire
Listeria Peste porcine Salmonellose
Salmonellose Leptospirose
Source: ANSES + Fièvre catarrhale ovine Blue tongue
Le sens des techniques actuelles
• Protection préventive quelquefois obligatoire
par vaccination
• Protection préventive par les médicaments en
particulier les antibiotiques
• Présence vétérinaire importante
• Renforcement de l’hygiène
• Montée des recherches sur les zoonoses et
maladies émergentes
2905/04/2016
Orientations nouvelles fondées sur l’écologie
et les médecines alternatives
• Epidémiologie: capteurs futurs et cartographie
• Principes d’hygiène de l’élevage et d’aménagement
des bâtiments
• Ecopathologie
• Phytothérapie- décoctions en préventif et curatif- ex
tarissement vaches: cataplasmes sur mamelles
• Aromatothérapie; huiles essentielles- infections
• Ostéopathie: tensions articulaires et musculaires si
les animaux acceptent
• Acuponcture (idem)
• Homéopathie: fièvres
Vue d’ensemble sur la santé en agriculture
et élevage suite à cette introduction
• L’emprise progressive de l’agriculture se fait au
détriment d’écosystèmes à forte biodiversité
• la fragmentation des écosystèmes est forte et il y a
généralisation des mouvements des espèces
• Cela entraîne la généralisation des envahissements
biologiques et des épidémies, ainsi que leur caractère de
développement accéléré voire explosif
• et la réponse technologique par la chimie de synthèse
• Cette réponse est de plus en plus contestée par la société
• La référence à l’écologie pour comprendre et pour gérer la
santé s’installe
3005/04/2016
• Les méthodes d’ élevage fondées sur le forçage
métabolique, le confinement
• …ainsi que les risques épidémiques liés à l’explosion des
communications
• …aboutissent à une précaution médicamenteuse excessive
et des effets négatifs
• …qui incitent à mieux respecter le cadre écologique et
physiologique des animaux d’élevage. Mais les solutions
sont-elles assez nombreuses? Et les techniques de “sûreté
sanitaire” ne font-elles pas obstacle à d’autres?
Des ateliers pour explorer et débattre
de quelques orientations en
protection sanitaire des cultures et
animaux
3105/04/2016
Intervenants Domaine
Etienne Benoit Protection intégrée arboriculture
Yvan Gautronneau Le labour écologique –agroécologique
Thibaut Malausa Perspectives du biocontrôle
Jean Pierre Sarthou Les auxiliaires
Philippe André, Guillaume Gasc Logiciels et arbres de décision
Julien Part, Olivier Cor Les méthodes de biocontrôle
Bernard Faye Ecopathologie
Emmanuel Benetteau, Sylvie Chouet Préventions vétérinaire alternative
Vivien Grandin Une ferme DEPHY en transition
Soirée Bernard Chevassus-au-Louis
Une perspective humaniste
de la défense des cultures
(conférence filmée)
3205/04/2016
Table ronde
La défense sanitaire des cultures
comme des troupeaux est avant tout
une affaire d’écologie
Nous avons vu en introduction…
• Que la progression des terres cultivées et des
monocultures crée les conditions de pullulations de
ravageurs et d’épidémies
• Que la perte de la biodiversité et de la complexité des
écosystèmes initiaux nous a aussi fait perdre la
capacité de résilience des “écosystèmes productifs”
• Que “l’affrontement” direct avec les ravageurs est
coûteux et favorise leur résistances génétiques
• Que les maladies infectieuses rencontrent avec la
mobilité des sociétés et la taille des ateliers des
conditions épidémiques favorables
• Que la protection absolue des animaux par des
médicaments rencontre des limites
3305/04/2016
Précisons que
• Nous cultivons une biomasse végétale en concurrence
avec le reste de la biomasse (“mauvaises herbes”)
• Nous, humains nous nous nourissons des “réservoirs”
des plantes cultivées que sont grains, fruits et tubercules
• La biomasse végétale que nous cultivons fait partie de la
ressource alimentaire naturelle et de l’habitat de
beaucoup d’autres êtres vivants : insectes,
champignons, ravageurs en général, animaux d’élevage…
• Insectes, ravageurs, animaux d’élevage- et humains
sommes donc en concurrence naturelle pour les
végétaux cultivés
• Par ailleurs encore, les animaux que nous élevons sont
agressés naturellement par des prédateurs, des
parasites, des champignons, bactéries et autres maladies
• Or, nous nous nourissons de ces animaux et de leurs
produits (lait)
• Notre nourriture en produits animaux est donc aussi
l’objet d’une concurrence naturelle au sein des
écosystèmes cultivés
3405/04/2016
• Lorsque nous éliminons les “ennemis” des cultures et des animaux
d’élevage pour défendre notre nourriture, nous modifions aussi les
flux de tout l’écosystème local:
– Elimination “mauvaises herbes” qui aboutit à en faire proliférer
d’autres (inversion de flore)
– Elimination d’insectes, effets sur les oiseaux qui s’en nourissent,
sur la composition de la faune et donc sur la biodiversité
• Par ailleurs, nous avons, à travers l’histoire, simplifié les
écosystèmes pour obtenir nos systèmes de cultures et d’élevage,
nous avons donc aussi transformé la flore et la faune tributaire de
nos systèmes (ennemis) dans le sens d’une plus grande variabilité
des “agresseurs” (fluctuations moins tempérées)
• Nous avons historiquement combattu beaucoup des “bio
agresseurs” dans l’intention de les éradiquer
• Ce faisant, nous avons encore plus simplifié les “écosystèmes
de production” que sont nos systèmes de culture et
d’élevage et leurs cortèges de “bioagresseurs”, donc favorisé
encore plus la variabilité et les déséquilibres du “système des
bioagresseurs”: suite d’envahissements biologiques
(pullulations à l’échelle des spécialisations en monoculture,
épidémies à l’échelle de la taille des troupeaux
• De plus, en éliminant certaines espèces de bioagresseurs de
manière radicale, nous permettons aux mutants qui
échappent à l’éradication de proliférer. “L’ennemi trouve des
parades ” obligeant à trouver de nouvelles armes. Sans fin
3505/04/2016
• Cette “course aux armements” se fait principalement
depuis un demi siècle par l’invention “d’armes chimiques”
qui se succèdent.
• Or, certaines d’entre elles sont dangereuses pour la santé
humaine, animale et l’environnement. On les retire donc.
Ces retraits privent les producteurs de solutions.
• Les molécules en cause se retrouvent pour certaines
d’entre elles dans les organismes humains et la
nourriture, ce qui provoque des nouvelles peurs et des
conflits de société dont l’importance augmente
• Où mène cette aventure? Est-on assuré qu’elle se termine
bien?
• Depuis longtemps, certains producteurs ont
opté pour le “non chimique” et innovent dans
les voies alternatives
• Depuis quatre décennies se développe la lutte
biologique puis la lutte intégrée ainsi que des
médecines alternatives
• Qu’apportera l’agroécologie et plus
particulièrement l’Ecologie Intensive?
3605/04/2016
Rappel :qu’est-ce que l’AEI et l’EEI?
• Pratiquer “l’écologie intensive” c’est d’abord analyser
les phénomènes de santé des plantes et sante des
animaux en termes scientifiques de biologie i.e. de
physiologie et d’écologie
• C’est trouver des solutions en utilisant avant tout les
mécanismes physiologiques et écologiques de la
nature
– En les “convoquant” (ex: prédateur d’un ravageur)
– En les amplifiant / augmentant (ex: produit de
biocontrôle)
– En les maîtrisant dans l’espace et le temps (précision)
– En les imitant ou en s’en inspirant (molécules
biomimétiques ou bioinspirées
• C’est aussi vérifier leur innocuité car imiter la nature
ne nous évite pas les dangers qui lui sont propres!
Ce que les réflexions et débats qui
ont eu lieu nous ont rappelé,
révélé ou bien encore appris
3705/04/2016
Le biocontrôle
• Le biocontrôle est le nouveau nom de la lutte
biologique
• Quatre méthodes: les macro-organismes, les micro-
organismes, les médiateurs chimiques (phéromones),
les substantces naturelles végétales, animales, mais
non minérales
• Quelques succès: Bt et lépidoptères,trichogramme,
carpocapse du pommier
• Des échecs: maîtrise de la production des êtres actifs,
chaînes trophiques complexes, coût et risque à
l’efficacité (selon la méthode de mesure)
• S’applique bien en serre, en arboriculture, moins
en viticulture et grande culture
• Difficultés
– Pose de piquets manuellement pour trichogrammes
– Etre obligatoirement “certiphyto”
– Etudes réglementaires d’inocuité très chères
– Refus de l’administration d’autoriser en libre vente à
l’exportation
– Distribution génère peu de valeur
– Technicité nécessaire, manque de formation générale
– Transition écologique des PPP au biocontrôle difficile
3805/04/2016
Perspectives du biocontrôle
• Cap sur les micro-organismes:
– Gamme étendue de potentiels
– Présentation classique
• Spécificité des micro-organismes (avantage
environnemental)
• Mais généricité des macro-organismes (utilité
mais risque environnemental éventuel)
• Biocontrôle par aménagement du paysage: très
crédible, mais gare aux parasites secondaires et
nouvelles pullulations (mésanges devenant
ravageuses des fruits)
L’avenir de la protection intégrée
• Souvent réduite à une ou un petit nombre de
techniques (puceron – prédateur)
• Gamme des solutions rarement mise en
perspective face à un problème donné
• Les voies possibles sont potentiellement
importantes: aménagement paysager
écologique, chaînes trophiques, rôle des
micro-organismes, langage chimique entre
espèces…
3905/04/2016
La maîtrise des adventices: un
problème encore devant nous
• Problème très ancien maîtrisé difficilement par le
labour et la dépense considérable en énergie
• Le “labour chimique” au glyphosate est contesté
fortement
• Les solutions mécaniques restent coûteuses
• Les solutions par compétition de plantes sont difficiles
à maîtriser (couvertures végétales)
• Les nouvelles solutions chimiques ne sont pas au
rende-vous
• Une combinaison “labour écologique, couvertures,
herbicides par exception?…
L’intelligence convoquée: logiciels et
arbres de décision
• Apparition de logiciels d’aide à la décision
pour anticiper ou réagir. Voie d’avenir dans les
mains de firmes ou de coopératives
• Apparition d’arbres de décision pour
l’utilisation de produits phytosanitaires sur le
mode “si (énumération de conditions) alors
(énumération de voies possibles). Cf ANSES
4005/04/2016
L’écopathologie: une voie d’avenir
• L’écopathologie est une démarche scientifique
développée pour tenter d’apporter des
solutions aux problèmes posés par la
pathologie multifactorielle dans les élevages
intensifs
• La démarche consiste à étudier la pathologie,
son déterminisme, dans sa relation avec
l’environnement des animaux, dans une
finalité d'action préventive.
• C’est largement une médecine des
populations
• L’approche de l’animal est “totale”: logement,
alimentation, respect de l’animal (et stress),
situation microbienne, attitude de l’éleveur
• Conception de l‘élevage comme l’activité d’un
“animalier” et non comme la gestion d’un
“animal industriel”
4105/04/2016
L’oeil de l’animalier (vaches laitiaires)
et l’alimentation
• Observer les comportements alimentaires: un jeune bovin
est un “ado” qu’il faut modérer
• Les dominantes et les dominées: accès à la nourriture et
l’espace; risque que les génisses qui ont des besoins plus
élevés aient un accès restreint, d’où l’importance de la
longueur du bâtiment
• Equilibrer les prises alimentaires: trop d’alimentation
rumination trop longue fatigue (repérage par l’état des
bouses)
L’oeil de l’animalier et les maladies
• Repérage précoce des comportements de
maladie
• Repérage des boîteries : repos de l’animal et
une seule traite plutôt qu’un anti-
inflammatoire
• La forme du bâtiment joue un rôle dans la
présence de bactéries: veiller à ce que les
animaux ne soient pas souillés, veiller à
combiner abri et toit ouvert.
4205/04/2016
Elevage: Allier écologie et physiologie
• L’écologie fonctionnelle situe l’animal dans son
environnement et débouche sur une gestion de cet
environnement: écosystème, troupeau…
• La physiologie de l’animal s’intéresse aux
fonctionnalités internes et débouche sur une gestion
de cette physiologie pour obtenir des performances
de l’animal et garantir sa santé.
• Ecophysiologie: lien entre les deux. L’agression de la
maladie fait partie de l’écologie et de la physiologie
“Soigner la santé, pas la maladie”-P. Labre
• La santé: “capacité d’auto-organisation
physiologique adaptative”
• Objectif en santé:
– activer les compétences physiologiques de l’animal et
des défenses naturelles par des oligoéléments,
plantes… Les molécules de synthèse n’ont pas le
même effet car ce sont des molécules pures, alors que
dans les plantes, ce sont des combinaisons
– optimiser le fonctionnement et la réactivité des
animaux
4305/04/2016
3 processus clé –P. Labre
• Activation: c’est une gestion du vivant
• Régulation: Fonctionnalité qui fait partie de
“l’énergie vitale” et qui combine tonus et
motivation. [à rapporcher d’une vision
thermodynamique des systèmes vivants]
• Adaptation: la relation entre espèces
(prédation, symbioses…) et évolution des
métabolismes (digestion, détoxification…)
L’animal est ce qu’il mange
• Les apports à l’animal sont:
– Les aliments: nutrition… (voir infra), catalyseurs,
oligoéléments, vitamines, polyphénols,
antioxydants, flavonoïdes, tanins, molécules
aromatiques
– De l’information d’activation (défenses) et de
régulation (anti stress par exemple)
4405/04/2016
• La nutrition végétale est une clé pour: contruire
le vivant, oxygéner, stimuler, réguler, soignere,
protéger
• La chaîne métabolique permet: la nutrition,
l’épuration, la détoxification (tube dig. Foie, reins)
• La chaîne énergétique est liée au système
nerveux, hormonal…
• Le système de défense: inflammation, immunité
Les interventions zoosanitaires
alternatives
• Lien Environnement - animal:
– Bâtiments et maladies
– Alimentation
– Attitude de l’éleveur
• Médecines
– Phytothérapie: plantes
– Aromathérapie: essences
– Homéopathie: effet de signal (information physiologique)
– Ostéopathie
4505/04/2016
L’apport de Bernard Chevassus-au-Louis
• La défense des cultures utilise un langage guerrier. Il
traduit une volonté d’éradication des ravageurs. On sait
que cette stratégie de défense va à l’échec. Elle est
l’expression d’une vision de l’humanité “au dessus” de
toutes les espèces.
• On se dirige vers une autre approche: celle de la la
gestion des populations adverses
• Cette conception correspond à l’idée de remettre les
humains dans l’écosystème, à partager l’espace entre
habitants humains et tous êtres vivants (territoires
communs), donc à inventer un nouvel humanisme
élargi à l’ensemble du vivant.
Eradiquer ou composer avec?
• Stratégies d’éradication directe d’un
“bioagresseur” mène à leur résistance (sauf
arme fatale)
• Stratégies de composition avec un “agent” de
l’écosystème: maîtrise (containment-
endiguement) de l’agent à effet négatif
(bioagresseur); c’est le choix de l’Ecologie
intensive
4605/04/2016
Donc les expériences s’accumulent, et la
philosophie de l’action évolue : Chacun devra
donc choisir un mode d’action
• Eradiquer directement le ravageur ou le pathogène en
particulier avec des solutions chimiques, sans
considération pour son environnement: c’est une
conception qui passera
• “Composer” avec leur environnement i.e. prendre en
compte l’écosystème productif
– Avec peu de solutions chimiques à risque avec des
exceptions rares: l’agriculture et l’élevage biologiques
– Entrer en transition afin de réduire le plus possible les
solutions chimiques présentant des risques
– Viser des solutions composites
Exemple: maîtriser les “mauvaises herbes” –ou
composer avec les différentes espèces
• Eradication directe:
– Herbicide mais risque de résistance et risque
environnemental
– “mécanique”: élimination par arrachage, labour
“agronomique”, broyage, chaleur (voie agronomique)
• Composition avec l’écosystème (agroécologie):
– Couvert végétal de plantes coopératives occupant tout
l’espace et réduisant les adventices
– Utilisation de la compétition entre plantes (compétition pour
la lumière et l’espace racinaire, allélopathie) au détriment
des advcentices
4705/04/2016
Exemple: éradiquer ou maîtriser une
pullulation d’insectes ravageurs
• Eradication directe:
– Insecticide risque de résistance, pollutions
• Composition avec l’écosystème et agroécologie
– Utilisation prédateurs et parasites par lâchers ou
installation dans un habitat
– Suppression de l’habitat du ravageur
– Utilisation de phénotypes résistants au ravageur:
variétés sélectionnées, variétés issues de
biotechniques
–…
Schéma fonctionnel de la relation
plante cultivée – bioagresseurs
Habitat Prédateur Parasite
Climat et
Habitat Bioagresseur environnement
favorables
Plante en Plante Plante en
“cooperation” cultivée compétition
4805/04/2016
Stratégie herbicide
Habitat Prédateur Parasite
Climat et
Habitat Bioagresseur environnement
favorables
Plante en Plante
“cooperation” cultivée
Strétégie herbicide - conséquences
Habitat Prédateur Parasite
Climat et
Habitat Bioagresseur environnement
favorables
Nouvelle
Plante en Plante Plante en
“cooperation” cultivée compétition
4905/04/2016
Schéma fonctionnel de la relation
plante cultivée – bioagresseur insecte
Habitat Prédateur Parasite
Climat et
Habitat Bioagresseur environnement
favorables
Plante en Plante Plante en
“cooperation” cultivée compétition
Stratégie éradication du bioagresseur
Habitat Prédateur Parasite
Climat et
Habitat environnement
favorables
Plante en Plante Plante en
“cooperation” cultivée compétition
5005/04/2016
Conséquences
Habitat Prédateur Parasite
Climat et
Bioagresseur environnement
Habitat
résistant favorables
Plante en Plante Plante en
“cooperation” cultivée compétition
Pour les animaux, c’est un peu la même
problématique: une maladie dans un élevage
est un pathogène (parasite) qui a trouvé son
hôte ou un hôte qui lui permet son
développement dans un environnement
favorable. Le pathogène peut provenir d’un
autre hote (vecteur) et participer à une
épidémie.
On peut donc avoir une conception éradicatrice
ou “gestionnaire” et écologique.
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